豬MYOD/PPAR-γ2轉(zhuǎn)基因鼠外源基因的插入位點效應(yīng)的研究
發(fā)布時間:2021-03-17 19:49
外源基因在轉(zhuǎn)基因動物體內(nèi)的表達既受到表達載體的啟動子影響,又受到外源基因在插入過程中所引起的插入位點效應(yīng)的影響。本實驗室采用原核顯微注射法制備了可以穩(wěn)定遺傳的MyoD和PPAR-γ2轉(zhuǎn)基因鼠。為了研究影響外源基因在轉(zhuǎn)基因動物體內(nèi)表達的因素,本試驗將實驗室保留的F3代的MyoD和PPAR-γ2轉(zhuǎn)基因鼠經(jīng)世代純繁建系,檢測轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因在DNA、RNA和蛋白水平的表達;通過熱不對稱交錯式PCR(TAIL-PCR)法對轉(zhuǎn)基因鼠中的外源基因MyoD和PPAR-γ2進行定位,確定外源基因的插入位點,再分析外源基因整合過程中產(chǎn)生的插入位點效應(yīng),為日后應(yīng)用于生產(chǎn)實踐奠定理論基礎(chǔ)。主要研究結(jié)果如下:1、測定PPAR-γ2轉(zhuǎn)基因鼠和野生型鼠后腿肌肉組織中的甘油三酯含量和PPAR-γ蛋白的表達情況,檢測的結(jié)果表明PPAR-γ2陽性轉(zhuǎn)基因鼠肌內(nèi)甘油三酯的含量高于野生型鼠(p<0.05),PPAR-γ蛋白在轉(zhuǎn)基因鼠中的表達高于野生型鼠;2、用RT-qPCR法檢測MyoD轉(zhuǎn)基因鼠各組織中外源基因的表達量,結(jié)果表明外源基因MyoD在肌肉組織中的表達量高于其他組織,且后腿肌肉組織中MyoD蛋白的表達量My...
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:76 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略詞表
第一章 文獻綜述
1 引言
2 轉(zhuǎn)基因動物建系
3 外源基因定位的方法及研究進展
3.1 熱不對稱交錯式PCR法
3.2 反向PCR法
3.3 熒光原位雜交法
3.4 連接介導(dǎo)PCR法
4 插入位點效應(yīng)的研究進展
4.1 甲基化的檢測方法及研究進展
4.1.1 限制性酶切PCR
4.1.2 甲基化特異性PCR
4.1.3 變性高效液相色譜法
4.1.4 亞硫酸鹽測序PCR
4.1.5 亞硫酸鹽PCR-SSCP
4.2 拷貝數(shù)的檢測方法及研究進展
4.2.1 絕對定量PCR法
4.2.2 Southern Blot
4.2.3 CGH芯片
4.2.4 高密度SNP芯片
4.3 其他插入位點效應(yīng)及研究進展
5 研究的目的與意義
第二章 材料方法
1 試驗材料
1.1 試驗動物
1.2 載體和質(zhì)粒
1.3 主要儀器與設(shè)備
1.4 主要試劑及試劑盒
1.5 主要溶液的配制
2 試驗方法
2.1 后代陽性轉(zhuǎn)基因鼠的鑒定
2.1.1 小鼠基因組DNA的提取
2.1.2 陽性鼠的鑒定
2.2 轉(zhuǎn)基因鼠基因組外源基因拷貝數(shù)的鑒定
2.2.1 小鼠單拷貝基因重組質(zhì)粒的檢測
2.2.2 PCR擴增產(chǎn)物的檢測
2.2.3 重組質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化
2.2.4 陽性克隆的檢測及測序
2.2.5 將連接目的片段的pGL3-Basic的重組質(zhì)粒小量提取
2.2.6 轉(zhuǎn)基因鼠基因組內(nèi)拷貝數(shù)的鑒定
2.3 轉(zhuǎn)基因鼠目的基因在RNA水平表達情況的驗證
2.3.1 轉(zhuǎn)基因鼠不同組織RNA的提取
2.3.2 RNA的反轉(zhuǎn)錄
2.3.3 實時熒光定量PCR分析MyoD轉(zhuǎn)基因鼠不同組織中MyoD基因的表達情況
2.4 轉(zhuǎn)基因鼠目的基因在蛋白水平表達情況的驗證
2.4.1 轉(zhuǎn)基因鼠與野生型鼠肌肉組織蛋白的提取
2.4.2 Western blot檢測目的蛋白質(zhì)的表達量
2.5 轉(zhuǎn)基因鼠肌肉組織甘油三酯的測定
2.6 外源基因定位
2.6.1 熱不對稱交錯式PCR
2.6.2 PCR擴增產(chǎn)物的檢測
2.6.3 PCR產(chǎn)物的回收及純化
2.6.4 膠回收產(chǎn)物連接T載體
2.6.5 連接產(chǎn)物的轉(zhuǎn)化
2.6.6 陽性克隆的檢測及測序
2.7 亞硫酸鹽PCR-SSCP
2.7.1 外源基因CpG島分析
2.7.2 基因組DNA亞硫酸鹽處理
2.7.3 亞硫酸鹽處理產(chǎn)物PCR擴增
2.7.4 PCR擴增產(chǎn)物的檢測
2.7.5 PCR產(chǎn)物的回收及純化
2.7.6 膠回收產(chǎn)物連接T載體
2.7.7 連接產(chǎn)物的轉(zhuǎn)化
2.7.8 陽性克隆的檢測及測序
2.7.9 測序結(jié)果SSCP檢測
2.8 統(tǒng)計學(xué)分析
第三章 研究結(jié)果與分析
1 PPAR-γ2 陽性轉(zhuǎn)基因鼠的檢測
2 PPAR-γ2 轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因穩(wěn)定遺傳的判定
3 肌肉組織中外源基因PPAR-γ2 的表達情況
4 肌肉組織內(nèi)甘油三酯的測定
5 TAIL-PCR定位外源基因PPAR-γ2 的結(jié)果
6 PPAR-γ2 轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因存在的插入位點效應(yīng)
6.1 PPAR-γ2 轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因拷貝數(shù)的判定
6.2 PPAR-γ2 轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因其他的插入位點效應(yīng)
7 MyoD陽性轉(zhuǎn)基因鼠的檢測
8 MyoD轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因穩(wěn)定遺傳的判定
9 MyoD轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因MyoD的表達情況
9.1 MyoD轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因MyoD的組織表達譜分析
9.2 肌肉組織中外源基因MyoD的表達情況
10 MyoD轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因存在的插入位點效應(yīng)
10.1 MyoD轉(zhuǎn)基因鼠外源基因拷貝數(shù)的判定
10.2 MyoD轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因啟動子區(qū)域的CpG島甲基化的鑒定
10.3 MyoD轉(zhuǎn)基因鼠外源基因其他插入位點效應(yīng)的鑒定
第五章 討論
第六章 結(jié)論
1 本試驗取得的結(jié)果
2 后期研究設(shè)想
參考文獻
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]禽白血病病毒衣殼蛋白p27基因絕對定量PCR方法的建立及應(yīng)用[J]. 胡海,錢琨,張丹陽,石亞運,張杰,邵紅霞,金文杰,秦愛建. 中國家禽. 2015(20)
[2]榮昌豬雜交群體基因組拷貝數(shù)變異鑒定與分析[J]. 龍熙,邱小田,陳磊,王金勇,李學(xué)偉. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2014(04)
[3]利用連接介導(dǎo)PCR檢測外源基因整合位點體系的建立[J]. 劉娣,李斌,張冬杰. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2013(12)
[4]轉(zhuǎn)外源基因(pGH)在豬染色體上整合狀況[J]. 蔣亞軍,吳明明,孫金海. 中國獸醫(yī)學(xué)報. 2013(07)
[5]轉(zhuǎn)基因克隆牛外源基因整合位點的研究[J]. 譚貝貝,蘇紅,胡嘉祺,吳茜紅,徐大慶,鞏校東,李世杰. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2012(17)
[6]如皋雞不同時期肌肉組織生長相關(guān)基因的表達譜分析[J]. 欒德琴,常國斌,盛中偉,黃正洋,周偉,龔琳琳,陳丹艷,劉巖,王克華,竇套存,陳國宏. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2012(01)
[7]DNA甲基化調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)基因動物外源基因表達的研究進展[J]. 張國梁,董煥聲,張西鋒,沈偉. 青島農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2011(04)
[8]拷貝數(shù)變異及其研究進展[J]. 劉欣,王立剛,王立賢. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2010(08)
[9]轉(zhuǎn)基因豬中外源基因拷貝數(shù)和整合位點的研究[J]. 孔慶然,武美玲,朱江,格日樂其木格,郇延軍,尹智,牟彥雙,劉忠華. 生物化學(xué)與生物物理進展. 2009(12)
[10]hblf廣泛表達轉(zhuǎn)基因小鼠品系的建立及其組織形態(tài)學(xué)分析[J]. 王水良,賀艷,謝幼華,汪垣,厲建中,王龍,王鑄鋼,傅繼梁. 科學(xué)通報. 2003(23)
博士論文
[1]APOBEC3B基因拷貝數(shù)變異與乙肝相關(guān)性肝細胞癌易感性[D]. 張彤雯.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2012
[2]1.TIMP-1轉(zhuǎn)基因小鼠純系的建立及體內(nèi)表達研究 2.TIMP-1轉(zhuǎn)基因小鼠染色體FISH定位[D]. 劉慶鑫.中國人民解放軍軍醫(yī)進修學(xué)院 2002
碩士論文
[1]利用轉(zhuǎn)基因鼠模型驗證豬的MYOZ1/MYF6啟動子上調(diào)肌肉組織中豬的PPAR-γ2/MYOD基因的表達[D]. 馬娟娟.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]豬骨骼肌特異性表達基因myoz1/tnnc2啟動子的克隆及功能驗證[D]. 尚楊楊.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[3]豬肌肉/肝臟特異性表達MyoD/BGL1載體構(gòu)建及轉(zhuǎn)基因小鼠的研究[D]. 周鵬.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[4]五指山豬KIT基因拷貝數(shù)檢測暨豬PSME1基因與免疫性狀關(guān)系的研究[D]. 牛玉娜.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
本文編號:3087623
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:76 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略詞表
第一章 文獻綜述
1 引言
2 轉(zhuǎn)基因動物建系
3 外源基因定位的方法及研究進展
3.1 熱不對稱交錯式PCR法
3.2 反向PCR法
3.3 熒光原位雜交法
3.4 連接介導(dǎo)PCR法
4 插入位點效應(yīng)的研究進展
4.1 甲基化的檢測方法及研究進展
4.1.1 限制性酶切PCR
4.1.2 甲基化特異性PCR
4.1.3 變性高效液相色譜法
4.1.4 亞硫酸鹽測序PCR
4.1.5 亞硫酸鹽PCR-SSCP
4.2 拷貝數(shù)的檢測方法及研究進展
4.2.1 絕對定量PCR法
4.2.2 Southern Blot
4.2.3 CGH芯片
4.2.4 高密度SNP芯片
4.3 其他插入位點效應(yīng)及研究進展
5 研究的目的與意義
第二章 材料方法
1 試驗材料
1.1 試驗動物
1.2 載體和質(zhì)粒
1.3 主要儀器與設(shè)備
1.4 主要試劑及試劑盒
1.5 主要溶液的配制
2 試驗方法
2.1 后代陽性轉(zhuǎn)基因鼠的鑒定
2.1.1 小鼠基因組DNA的提取
2.1.2 陽性鼠的鑒定
2.2 轉(zhuǎn)基因鼠基因組外源基因拷貝數(shù)的鑒定
2.2.1 小鼠單拷貝基因重組質(zhì)粒的檢測
2.2.2 PCR擴增產(chǎn)物的檢測
2.2.3 重組質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化
2.2.4 陽性克隆的檢測及測序
2.2.5 將連接目的片段的pGL3-Basic的重組質(zhì)粒小量提取
2.2.6 轉(zhuǎn)基因鼠基因組內(nèi)拷貝數(shù)的鑒定
2.3 轉(zhuǎn)基因鼠目的基因在RNA水平表達情況的驗證
2.3.1 轉(zhuǎn)基因鼠不同組織RNA的提取
2.3.2 RNA的反轉(zhuǎn)錄
2.3.3 實時熒光定量PCR分析MyoD轉(zhuǎn)基因鼠不同組織中MyoD基因的表達情況
2.4 轉(zhuǎn)基因鼠目的基因在蛋白水平表達情況的驗證
2.4.1 轉(zhuǎn)基因鼠與野生型鼠肌肉組織蛋白的提取
2.4.2 Western blot檢測目的蛋白質(zhì)的表達量
2.5 轉(zhuǎn)基因鼠肌肉組織甘油三酯的測定
2.6 外源基因定位
2.6.1 熱不對稱交錯式PCR
2.6.2 PCR擴增產(chǎn)物的檢測
2.6.3 PCR產(chǎn)物的回收及純化
2.6.4 膠回收產(chǎn)物連接T載體
2.6.5 連接產(chǎn)物的轉(zhuǎn)化
2.6.6 陽性克隆的檢測及測序
2.7 亞硫酸鹽PCR-SSCP
2.7.1 外源基因CpG島分析
2.7.2 基因組DNA亞硫酸鹽處理
2.7.3 亞硫酸鹽處理產(chǎn)物PCR擴增
2.7.4 PCR擴增產(chǎn)物的檢測
2.7.5 PCR產(chǎn)物的回收及純化
2.7.6 膠回收產(chǎn)物連接T載體
2.7.7 連接產(chǎn)物的轉(zhuǎn)化
2.7.8 陽性克隆的檢測及測序
2.7.9 測序結(jié)果SSCP檢測
2.8 統(tǒng)計學(xué)分析
第三章 研究結(jié)果與分析
1 PPAR-γ2 陽性轉(zhuǎn)基因鼠的檢測
2 PPAR-γ2 轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因穩(wěn)定遺傳的判定
3 肌肉組織中外源基因PPAR-γ2 的表達情況
4 肌肉組織內(nèi)甘油三酯的測定
5 TAIL-PCR定位外源基因PPAR-γ2 的結(jié)果
6 PPAR-γ2 轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因存在的插入位點效應(yīng)
6.1 PPAR-γ2 轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因拷貝數(shù)的判定
6.2 PPAR-γ2 轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因其他的插入位點效應(yīng)
7 MyoD陽性轉(zhuǎn)基因鼠的檢測
8 MyoD轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因穩(wěn)定遺傳的判定
9 MyoD轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因MyoD的表達情況
9.1 MyoD轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因MyoD的組織表達譜分析
9.2 肌肉組織中外源基因MyoD的表達情況
10 MyoD轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因存在的插入位點效應(yīng)
10.1 MyoD轉(zhuǎn)基因鼠外源基因拷貝數(shù)的判定
10.2 MyoD轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因啟動子區(qū)域的CpG島甲基化的鑒定
10.3 MyoD轉(zhuǎn)基因鼠外源基因其他插入位點效應(yīng)的鑒定
第五章 討論
第六章 結(jié)論
1 本試驗取得的結(jié)果
2 后期研究設(shè)想
參考文獻
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]禽白血病病毒衣殼蛋白p27基因絕對定量PCR方法的建立及應(yīng)用[J]. 胡海,錢琨,張丹陽,石亞運,張杰,邵紅霞,金文杰,秦愛建. 中國家禽. 2015(20)
[2]榮昌豬雜交群體基因組拷貝數(shù)變異鑒定與分析[J]. 龍熙,邱小田,陳磊,王金勇,李學(xué)偉. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2014(04)
[3]利用連接介導(dǎo)PCR檢測外源基因整合位點體系的建立[J]. 劉娣,李斌,張冬杰. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2013(12)
[4]轉(zhuǎn)外源基因(pGH)在豬染色體上整合狀況[J]. 蔣亞軍,吳明明,孫金海. 中國獸醫(yī)學(xué)報. 2013(07)
[5]轉(zhuǎn)基因克隆牛外源基因整合位點的研究[J]. 譚貝貝,蘇紅,胡嘉祺,吳茜紅,徐大慶,鞏校東,李世杰. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2012(17)
[6]如皋雞不同時期肌肉組織生長相關(guān)基因的表達譜分析[J]. 欒德琴,常國斌,盛中偉,黃正洋,周偉,龔琳琳,陳丹艷,劉巖,王克華,竇套存,陳國宏. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2012(01)
[7]DNA甲基化調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)基因動物外源基因表達的研究進展[J]. 張國梁,董煥聲,張西鋒,沈偉. 青島農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2011(04)
[8]拷貝數(shù)變異及其研究進展[J]. 劉欣,王立剛,王立賢. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2010(08)
[9]轉(zhuǎn)基因豬中外源基因拷貝數(shù)和整合位點的研究[J]. 孔慶然,武美玲,朱江,格日樂其木格,郇延軍,尹智,牟彥雙,劉忠華. 生物化學(xué)與生物物理進展. 2009(12)
[10]hblf廣泛表達轉(zhuǎn)基因小鼠品系的建立及其組織形態(tài)學(xué)分析[J]. 王水良,賀艷,謝幼華,汪垣,厲建中,王龍,王鑄鋼,傅繼梁. 科學(xué)通報. 2003(23)
博士論文
[1]APOBEC3B基因拷貝數(shù)變異與乙肝相關(guān)性肝細胞癌易感性[D]. 張彤雯.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2012
[2]1.TIMP-1轉(zhuǎn)基因小鼠純系的建立及體內(nèi)表達研究 2.TIMP-1轉(zhuǎn)基因小鼠染色體FISH定位[D]. 劉慶鑫.中國人民解放軍軍醫(yī)進修學(xué)院 2002
碩士論文
[1]利用轉(zhuǎn)基因鼠模型驗證豬的MYOZ1/MYF6啟動子上調(diào)肌肉組織中豬的PPAR-γ2/MYOD基因的表達[D]. 馬娟娟.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]豬骨骼肌特異性表達基因myoz1/tnnc2啟動子的克隆及功能驗證[D]. 尚楊楊.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[3]豬肌肉/肝臟特異性表達MyoD/BGL1載體構(gòu)建及轉(zhuǎn)基因小鼠的研究[D]. 周鵬.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[4]五指山豬KIT基因拷貝數(shù)檢測暨豬PSME1基因與免疫性狀關(guān)系的研究[D]. 牛玉娜.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
本文編號:3087623
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