雜種三葉草多葉型與標準型的轉(zhuǎn)錄組比較分析
發(fā)布時間:2021-03-17 19:24
三葉草的多葉型與標準型是以蒙農(nóng)三葉草1號為母本和白三葉為父本進行遠緣雜交及胚拯救技術(shù)而獲得的Fi代株系。自2005年以來,經(jīng)過對Fi代的胚離體培養(yǎng)、莖段離體培養(yǎng)器官發(fā)生和胚萌發(fā)適應(yīng)條件等一系列研究,得到可以在溫室和田間栽培的F1代植株。在雜交培育的研究過程中,部分三葉草植株出現(xiàn)4~5小葉的多葉型性狀。通過對這些植株的根蘗進行營養(yǎng)擴繁,形成一系列多葉型株系。這一發(fā)現(xiàn)對于新品種的培育具有重要意義。為探索三葉草多葉現(xiàn)象的分子機制,本研究選擇其中一個多葉型三葉草株系(1-1)和標準型三葉草株系(2-2)為研究對象,分別作為試驗組和對照組,每組設(shè)立三個生物學重復(fù)。T1、T2、T3為試驗組樣品,T4、T5、T6為對照組樣品,基于RNA-Seq技術(shù),對6個樣品進行轉(zhuǎn)錄組測序分析。主要研究結(jié)果如下:(1)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析得到多葉型三葉草與標準型三葉草的差異表達基因共1985個,包括794個上調(diào)基因與1191個下調(diào)基因。GO功能注釋表明差異表達基因主要富集在蛋白質(zhì)磷酸化(Protein phosphorylation)、防御反應(yīng)(Defense response)、核(Nucleus)、細胞質(zhì)(Cytos...
【文章來源】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學內(nèi)蒙古自治區(qū)
【文章頁數(shù)】:67 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2?Unigene長度分布圖??Fig.2?Unigene?length?distribution?map??
圖3?Mapped?Reads在mRNA上的位置分布圖??Fig.3?Map?distribution?of?Mapped?Reads?on?mRNA??
圖5轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)飽和度模擬圖??Fig.5?Transcriptome?sequencing?data?saturatio?
【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析及高通量GO注釋理論的研究[J]. 劉粉香,楊文國,孫勤紅. 安徽農(nóng)業(yè)科學. 2018(31)
[2]多葉型苜蓿的研究進展[J]. 王曉龍,李紅,楊偉光,楊曌,柴華,黃新育,高海娟,徐艷霞,藍嵐. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2016(23)
[3]蘋果褐斑病菌侵染蘋果屬山定子的轉(zhuǎn)錄組學分析[J]. 李海錄,宋艷艷,馮浩,黃麗麗,強曉玉,韓青梅. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學報. 2017(01)
[4]高加索三葉草、白三葉及其F1代株系種子特征的比較[J]. 李曉秀,王明玖,白春利. 畜牧與飼料科學. 2015(04)
[5]水稻土壤宏基因組中的β-葡萄糖苷酶基因克隆、表達及酶活的研究[J]. 賀俐,吳楊. 井岡山大學學報(自然科學版). 2014(03)
[6]白三葉草對林地微域環(huán)境的調(diào)節(jié)及其林下種植技術(shù)[J]. 萬井尉. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè). 2013(01)
[7]KEGG數(shù)據(jù)庫的進展及其在生物信息學中的應(yīng)用[J]. 李向真,劉子朋,李娟,方慧生. 藥物生物技術(shù). 2012(06)
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[9]高通量轉(zhuǎn)錄組測序的數(shù)據(jù)分析與基因發(fā)掘[J]. 周華,張新,劉騰云,余發(fā)新. 江西科學. 2012(05)
[10]大規(guī)模GO注釋的生物信息學流程[J]. 黃子夏,柯才煥,陳軍. 廈門大學學報(自然科學版). 2012(01)
博士論文
[1]秦川牛肌肉生長發(fā)育相關(guān)基因和蛋白質(zhì)的篩選及其初步鑒定[D]. 賀花.西北農(nóng)林科技大學 2014
[2]高加索三葉草與白三葉雜交后代遺傳特性及育性恢復(fù)的研究[D]. 黃帆.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2012
碩士論文
[1]干旱脅迫下甜高粱(遼甜一)轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 邵丹陽.河南大學 2018
[2]三葉草雜種F1代5個株系及親本主要特征特性比較[D]. 鄔娜.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2017
[3]2種三葉草雜種F1代株系的鑒定與光合特性比較分析[D]. 周瑩.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2017
[4]白沙蒿對干旱響應(yīng)的轉(zhuǎn)錄組研究[D]. 員艷麗.內(nèi)蒙古師范大學 2016
[5]甘蔗脫葉性的評價及其分子基礎(chǔ)[D]. 商賀陽.廣西大學 2016
[6]高加索三葉草、白三葉及其F1代株系的遺傳特征[D]. 李曉秀.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2015
[7]低溫脅迫下西葫蘆轉(zhuǎn)錄組分析與SSR分子標記開發(fā)[D]. 張宏亮.山西農(nóng)業(yè)大學 2015
[8]β-葡萄糖苷酶基因的篩選及性質(zhì)分析[D]. 夏玉林.廣東藥科大學 2016
[9]紫花苜蓿耐鹽生理特性及轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 江超.山東農(nóng)業(yè)大學 2014
[10]高加索三葉草與白三葉雜交BC1胚培養(yǎng)及F1育性分析[D]. 任尚佳.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2014
本文編號:3087592
【文章來源】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學內(nèi)蒙古自治區(qū)
【文章頁數(shù)】:67 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2?Unigene長度分布圖??Fig.2?Unigene?length?distribution?map??
圖3?Mapped?Reads在mRNA上的位置分布圖??Fig.3?Map?distribution?of?Mapped?Reads?on?mRNA??
圖5轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)飽和度模擬圖??Fig.5?Transcriptome?sequencing?data?saturatio?
【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析及高通量GO注釋理論的研究[J]. 劉粉香,楊文國,孫勤紅. 安徽農(nóng)業(yè)科學. 2018(31)
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[3]蘋果褐斑病菌侵染蘋果屬山定子的轉(zhuǎn)錄組學分析[J]. 李海錄,宋艷艷,馮浩,黃麗麗,強曉玉,韓青梅. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學報. 2017(01)
[4]高加索三葉草、白三葉及其F1代株系種子特征的比較[J]. 李曉秀,王明玖,白春利. 畜牧與飼料科學. 2015(04)
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[6]白三葉草對林地微域環(huán)境的調(diào)節(jié)及其林下種植技術(shù)[J]. 萬井尉. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè). 2013(01)
[7]KEGG數(shù)據(jù)庫的進展及其在生物信息學中的應(yīng)用[J]. 李向真,劉子朋,李娟,方慧生. 藥物生物技術(shù). 2012(06)
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博士論文
[1]秦川牛肌肉生長發(fā)育相關(guān)基因和蛋白質(zhì)的篩選及其初步鑒定[D]. 賀花.西北農(nóng)林科技大學 2014
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碩士論文
[1]干旱脅迫下甜高粱(遼甜一)轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 邵丹陽.河南大學 2018
[2]三葉草雜種F1代5個株系及親本主要特征特性比較[D]. 鄔娜.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2017
[3]2種三葉草雜種F1代株系的鑒定與光合特性比較分析[D]. 周瑩.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2017
[4]白沙蒿對干旱響應(yīng)的轉(zhuǎn)錄組研究[D]. 員艷麗.內(nèi)蒙古師范大學 2016
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[6]高加索三葉草、白三葉及其F1代株系的遺傳特征[D]. 李曉秀.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2015
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[9]紫花苜蓿耐鹽生理特性及轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 江超.山東農(nóng)業(yè)大學 2014
[10]高加索三葉草與白三葉雜交BC1胚培養(yǎng)及F1育性分析[D]. 任尚佳.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2014
本文編號:3087592
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