蘇博美利奴羊皮膚組織中WNT2基因的DNA甲基化與表達(dá)量分析
發(fā)布時間:2021-03-07 13:48
毛囊是皮膚的衍生物,WNT信號通路是已知與毛囊發(fā)育密切相關(guān)的通路之一,為研究WNT信號通路中關(guān)鍵基因WNT2的DNA甲基化和基因表達(dá)對羊毛性狀的調(diào)控作用,本研究以周歲蘇博美利奴羊為研究對象,采用亞硫酸氫鹽測序法(BSP),并結(jié)合前期MeDIP-seq結(jié)果檢測了WNT2基因在第5外顯子及前后100bp處的DNA甲基化模式,通過實時熒光定量PCR法檢測WNT2基因在蘇博美利奴羊皮膚組織中的表達(dá)量。結(jié)果顯示:WNT2基因在2組中的甲基化水平均較高,且2組的表達(dá)水平與DNA甲基化水平變化趨勢一致,同時,CpG11位點的甲基化水平與表達(dá)量之間呈現(xiàn)顯著正相關(guān),該位點可能與羊毛纖維直徑有關(guān),表明WNT2基因的DNA甲基化水平對羊毛纖維直徑有一定作用。本實驗為后期深入研究DNA甲基化對毛囊的影響提供了重要參考,也為該基因的進(jìn)一步研究提供理論基礎(chǔ)。
【文章來源】:中國畜牧雜志. 2020,56(09)北大核心
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
WNT2基因的CpG島預(yù)測圖
對蘇博美利奴羊皮膚組織中WNT2基因第5外顯子及前后100 bp序列進(jìn)行DNA甲基化分析,根據(jù)未甲基化的胞嘧啶經(jīng)亞硫酸氫鹽處理后被轉(zhuǎn)化為胸腺嘧啶,而甲基化的胞嘧啶經(jīng)亞硫酸氫鹽處理后不被轉(zhuǎn)化為胸腺嘧啶的原理,分析不同細(xì)度蘇博美利奴羊WNT2基因的甲基化模式,見圖4,經(jīng)序列比對結(jié)果發(fā)現(xiàn)共有13個CpG位點,與Meth Primer軟件預(yù)測的結(jié)果一致。2.2.3 不同細(xì)度蘇博美利奴羊皮膚組織中WNT2基因的DNA甲基化水平
不同細(xì)度蘇博美利奴羊皮膚組織中WNT2基因的甲基化模式圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]調(diào)控毛囊發(fā)育的Wnt信號通路研究進(jìn)展[J]. 吳素芳,馬濤,李健宇,李建平,張巧靈. 動物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2019(04)
[2]香豬卵巢RARRES1基因第1外顯子CG位點的甲基化及其與基因差異表達(dá)的關(guān)聯(lián)[J]. 阮亦麒,李大鵬,冉雪琴,毛寧,易凡利,張福平,王嘉福. 中國畜牧獸醫(yī). 2018(06)
[3]利用CRISPR/Cas9系統(tǒng)敲除綿羊皮膚成纖維細(xì)胞Wnt2基因的研究[J]. 馮新宇,袁超,郭婷婷,劉建斌,郭健,牛春娥,孫曉萍,馮瑞林,岳耀敬,楊博輝. 畜牧與獸醫(yī). 2018(02)
[4]新疆巴什拜羊肌肉生長抑制素基因DNA甲基化與mRNA表達(dá)量分析[J]. 姚力丹,祖玲玲,馬曉燕,依明·蘇來曼,決肯·阿尼瓦什. 中國畜牧獸醫(yī). 2017(10)
[5]山羊早期胎兒組織TET1與Wnt通路基因的表達(dá)變化及其相關(guān)性[J]. 譚強,羅南劍,張艷麗,安炳星,陳秋羊,趙永聚. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(14)
[6]microRNAs在動物皮膚及毛囊發(fā)育中的調(diào)控作用研究進(jìn)展[J]. 吳月紅,李勇,楊易,何玉龍. 中國畜牧獸醫(yī). 2016(09)
[7]烏珠穆沁羊生長分化因子11基因外顯子1序列CpG位點的甲基化模式分析[J]. 何小龍,李蓓,付紹印,劉永斌,祁云霞,王標(biāo),特日格勒,榮威恒,達(dá)賴. 中國畜牧獸醫(yī). 2016(02)
[8]毛囊發(fā)育與毛發(fā)生產(chǎn)研究進(jìn)展[J]. 王寧,榮恩光,閆曉紅. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2012(09)
[9]MicroRNAs在動物皮膚和毛發(fā)發(fā)育中的調(diào)控作用[J]. 劉丹丹,赫曉燕,郝歡慶. 中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報. 2010(09)
[10]毛囊干細(xì)胞增殖與分化相關(guān)信號通路研究進(jìn)展[J]. 許永安,付小兵. 中國修復(fù)重建外科雜志. 2010(02)
碩士論文
[1]基于甲基化與lncRNA的絨山羊毛囊發(fā)育表觀遺傳學(xué)初步研究[D]. 馮帥帥.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[2]wnt1、wnt2及sfrp4mRNA在子癇前期患者胎盤組織中的表達(dá)及意義[D]. 曾鴻波.中南大學(xué) 2010
本文編號:3069212
【文章來源】:中國畜牧雜志. 2020,56(09)北大核心
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
WNT2基因的CpG島預(yù)測圖
對蘇博美利奴羊皮膚組織中WNT2基因第5外顯子及前后100 bp序列進(jìn)行DNA甲基化分析,根據(jù)未甲基化的胞嘧啶經(jīng)亞硫酸氫鹽處理后被轉(zhuǎn)化為胸腺嘧啶,而甲基化的胞嘧啶經(jīng)亞硫酸氫鹽處理后不被轉(zhuǎn)化為胸腺嘧啶的原理,分析不同細(xì)度蘇博美利奴羊WNT2基因的甲基化模式,見圖4,經(jīng)序列比對結(jié)果發(fā)現(xiàn)共有13個CpG位點,與Meth Primer軟件預(yù)測的結(jié)果一致。2.2.3 不同細(xì)度蘇博美利奴羊皮膚組織中WNT2基因的DNA甲基化水平
不同細(xì)度蘇博美利奴羊皮膚組織中WNT2基因的甲基化模式圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]調(diào)控毛囊發(fā)育的Wnt信號通路研究進(jìn)展[J]. 吳素芳,馬濤,李健宇,李建平,張巧靈. 動物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2019(04)
[2]香豬卵巢RARRES1基因第1外顯子CG位點的甲基化及其與基因差異表達(dá)的關(guān)聯(lián)[J]. 阮亦麒,李大鵬,冉雪琴,毛寧,易凡利,張福平,王嘉福. 中國畜牧獸醫(yī). 2018(06)
[3]利用CRISPR/Cas9系統(tǒng)敲除綿羊皮膚成纖維細(xì)胞Wnt2基因的研究[J]. 馮新宇,袁超,郭婷婷,劉建斌,郭健,牛春娥,孫曉萍,馮瑞林,岳耀敬,楊博輝. 畜牧與獸醫(yī). 2018(02)
[4]新疆巴什拜羊肌肉生長抑制素基因DNA甲基化與mRNA表達(dá)量分析[J]. 姚力丹,祖玲玲,馬曉燕,依明·蘇來曼,決肯·阿尼瓦什. 中國畜牧獸醫(yī). 2017(10)
[5]山羊早期胎兒組織TET1與Wnt通路基因的表達(dá)變化及其相關(guān)性[J]. 譚強,羅南劍,張艷麗,安炳星,陳秋羊,趙永聚. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(14)
[6]microRNAs在動物皮膚及毛囊發(fā)育中的調(diào)控作用研究進(jìn)展[J]. 吳月紅,李勇,楊易,何玉龍. 中國畜牧獸醫(yī). 2016(09)
[7]烏珠穆沁羊生長分化因子11基因外顯子1序列CpG位點的甲基化模式分析[J]. 何小龍,李蓓,付紹印,劉永斌,祁云霞,王標(biāo),特日格勒,榮威恒,達(dá)賴. 中國畜牧獸醫(yī). 2016(02)
[8]毛囊發(fā)育與毛發(fā)生產(chǎn)研究進(jìn)展[J]. 王寧,榮恩光,閆曉紅. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2012(09)
[9]MicroRNAs在動物皮膚和毛發(fā)發(fā)育中的調(diào)控作用[J]. 劉丹丹,赫曉燕,郝歡慶. 中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報. 2010(09)
[10]毛囊干細(xì)胞增殖與分化相關(guān)信號通路研究進(jìn)展[J]. 許永安,付小兵. 中國修復(fù)重建外科雜志. 2010(02)
碩士論文
[1]基于甲基化與lncRNA的絨山羊毛囊發(fā)育表觀遺傳學(xué)初步研究[D]. 馮帥帥.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[2]wnt1、wnt2及sfrp4mRNA在子癇前期患者胎盤組織中的表達(dá)及意義[D]. 曾鴻波.中南大學(xué) 2010
本文編號:3069212
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