全基因組選擇是標(biāo)記輔助選擇在全基因組范圍上的應(yīng)用。作為動(dòng)物遺傳領(lǐng)域的研究熱點(diǎn),有關(guān)全基因組選擇模型和方法的研究日新月異,本研究就基因組選擇中包含顯性效應(yīng)的模型和方法做了如下研究：1、本研究基于包含顯性效應(yīng)的層級(jí)貝葉斯模型,假設(shè)加性效應(yīng)和顯性效應(yīng)存在不同方式的相關(guān)性,提出兩種子模型BayesAD1和BayesAD2,通過模擬數(shù)據(jù)比較他們估計(jì)基因組育種值（BV）,顯性離差（DV）和基因型值（GV）的準(zhǔn)確性。在模擬數(shù)據(jù)中設(shè)置不同水平的QTL（quantitative trait loci）數(shù)目、全同胞家庭個(gè)體數(shù)和加性方差與顯性方差的比重,研究?jī)煞N模型在這些參數(shù)組合下的特性。結(jié)果顯示：固定全同胞數(shù)和QTL數(shù)目,對(duì)BV的估計(jì)中,BayesAD2準(zhǔn)確性最高,BayesAD0準(zhǔn)確性最低。隨著加性方差比重升高,顯性方差比重下降,BayesAD2的優(yōu)勢(shì)逐漸減小至消失；對(duì)DV的估計(jì)中,BayesAD2仍舊比BayesAD1表現(xiàn)突出,隨著顯性方差比重下降,BayesAD2的準(zhǔn)確性也降低,和BayesAD1的差距減小。QTL數(shù)目的增多使得估計(jì)BV的準(zhǔn)確性下降,而顯性離差估計(jì)的準(zhǔn)確性卻隨之升高,QTL不變,全同... 

【文章來源】：中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市

【文章頁(yè)數(shù)】：66 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

加性效應(yīng)絕對(duì)值與顯性系數(shù)的聯(lián)合分布散點(diǎn)圖

Figure 2.3 Correlation of TDV and EDV in generation 2 to 6 with different models圖2.4顯示了從第2到6世代不同模型估計(jì)基因組基因型值的準(zhǔn)確性，BayesADO估計(jì)的準(zhǔn)25

們可以很好的擬合個(gè)體間的加性相關(guān)和顯性相關(guān)關(guān)系，進(jìn)行方差組分估計(jì)和育種值估計(jì)。因此本部分研宄中，用西門塔爾牛群體對(duì)BayesADl、BayesAD2, G2A、Su’s和IBD進(jìn)行驗(yàn)證。.2材料與方法. 2.1參考群體的構(gòu)建本研宄室于2008年在內(nèi)蒙古錫林郭勒盟烏拉蓋管理區(qū)構(gòu)建了資源群體，經(jīng)過2011年擴(kuò)群，項(xiàng)目戶已達(dá)到15家牧場(chǎng)，基礎(chǔ)母牛數(shù)己超過了 2000頭，使用的西門塔爾種公牛數(shù)達(dá)到了 35。在接牛生長(zhǎng)之5-9月齡，運(yùn)送至北京金維福仁牧場(chǎng)開始集中育肥與統(tǒng)一的詞養(yǎng)管理。在達(dá)到0 ~ 14月齡后進(jìn)行分批屠宰，收集生長(zhǎng)發(fā)育、屠宰性狀、胴體性狀和肉質(zhì)性狀共87個(gè)性狀。育及屠宰期間，試驗(yàn)動(dòng)物均沒有表現(xiàn)任何疾病癥狀，所有數(shù)據(jù)測(cè)定及屠宰過程均嚴(yán)格依照根據(jù)國(guó)有關(guān)規(guī)定和標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行。用于本部分研究的試驗(yàn)群體由2010至2012年屠宰的807頭使用Illumina BovineHD SNP芯進(jìn)行全基因組SNP標(biāo)記檢測(cè)的西門塔爾公牛構(gòu)成。其中2010年屠宰283頭，2011年239頭，012年285頭。部分牛沒有系譜記錄，根據(jù)孟德爾錯(cuò)誤率校正完善系譜后，確認(rèn)其中603頭公牛屬于40頭父親公牛的后代，后代數(shù)最多的公牛有173個(gè)兒子，最少的有1個(gè)后代。圖4-1顯示 40頭父親公牛的后代數(shù)分布。200 -1


本文編號(hào)：3067378