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柔嫩艾美耳球蟲裂殖生殖時(shí)期雞盲腸蛋白質(zhì)組學(xué)和乙;揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2021-03-06 14:21
  雞球蟲病是雞感染艾美耳屬球蟲后引起的一種腸道疾病,雞球蟲病每年對(duì)全世界禽類養(yǎng)殖業(yè)造成巨大的損失。目前該病的防治主要依靠化學(xué)藥物和疫苗,但是抗球蟲藥的濫用導(dǎo)致的耐藥性產(chǎn)生使新藥的開發(fā)迫在眉睫。雞球蟲生活史復(fù)雜,其發(fā)育主要經(jīng)過孢子生殖、裂殖生殖和配子生殖三個(gè)階段。裂殖生殖是雞球蟲的無性生殖階段,此階段伴隨著球蟲裂殖子入侵宿主細(xì)胞、在宿主細(xì)胞中大量增殖并破壞宿主細(xì)胞的過程。球蟲在入侵過程中蟲體和宿主會(huì)在蛋白質(zhì)水平上出現(xiàn)變化,而蛋白質(zhì)是生理功能的執(zhí)行者,對(duì)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能的研究直接闡明物種生理和病理的變化機(jī)制。因此,研究球蟲裂殖生殖時(shí)期宿主蛋白的變化對(duì)闡明球蟲的致病機(jī)理、發(fā)現(xiàn)潛在的藥物作用靶點(diǎn)及免疫防治具有重要意義。本研究收集了正常雛雞盲腸和裂殖生殖時(shí)期(E.tenella感染120小時(shí))雛雞盲腸,盲腸樣本經(jīng)蛋白提取、胰酶酶解、TMT標(biāo)記、HPLC分級(jí)、修飾富集、LC-MS/MS分析、數(shù)據(jù)庫搜索,之后采用蛋白注釋、蛋白質(zhì)功能富集、基于蛋白功能富集的聚類分析和蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析進(jìn)行生物信息學(xué)分析。蛋白質(zhì)組學(xué)分析結(jié)果顯示:蛋白質(zhì)差異表達(dá)分析發(fā)現(xiàn)717個(gè)差異表達(dá)蛋白,其中包括373個(gè)上調(diào)蛋白和344個(gè)... 

【文章來源】:吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)吉林省

【文章頁數(shù)】:81 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

柔嫩艾美耳球蟲裂殖生殖時(shí)期雞盲腸蛋白質(zhì)組學(xué)和乙;揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)分析


質(zhì)譜鑒定到肽段的長度分布

長度分布,質(zhì)量精度,質(zhì)譜儀


質(zhì)量和電荷數(shù)較高,HCD 碎裂方式不適用。如圖 2-4 顯布符合一般規(guī)律,肽段長度的分布符合質(zhì)控要求,。圖 2-4 質(zhì)譜鑒定到肽段的長度分布Fig.2-4 Mass spectrometry identified the length distribution of peptid的質(zhì)量精度正常要求絕大多數(shù)圖譜的一級(jí)質(zhì)量誤差需要在差越小,得分越高。如圖 2-5 絕大多數(shù)圖譜的一級(jí)質(zhì)量誤大的質(zhì)量偏差,說明質(zhì)譜儀的質(zhì)量精度正常,不會(huì)影響到

柱狀圖,質(zhì)譜數(shù)據(jù),柱狀圖,差異表達(dá)分析


圖 2-6 質(zhì)譜數(shù)據(jù)結(jié)果柱狀圖Fig.2-6 Mass spectrometry Histogram白差異表達(dá)分析通過多次全蛋白定量的重復(fù)試驗(yàn),分別得到了每個(gè)樣本在當(dāng) p-value<0.05 時(shí),以差異表達(dá)量變化超過 1.5 作為顯著 1/1.5 作為顯著下調(diào)的變化閾值。在 M 組/N 組中我們一共,其中有 373 個(gè)是上調(diào)蛋白,344 個(gè)是下調(diào)蛋白(下文比,詳見圖 2-7。

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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碩士論文
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