維氏氣單胞菌TH0426株cadA和cadB基因缺失株構(gòu)建及其基因功能初探
發(fā)布時(shí)間:2021-03-02 05:55
維氏氣單胞菌(Aeromonas veronii)作為一種人、獸及水生生物共患病原菌,在醫(yī)學(xué)界和科學(xué)界得到了較為廣泛的關(guān)注,通過(guò)對(duì)近年來(lái)的流行病學(xué)調(diào)查結(jié)果進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)A.veronii的毒力及其對(duì)藥物的耐受能力方面呈逐年增強(qiáng)的趨勢(shì),這也使得越來(lái)越多的國(guó)家意識(shí)到該病原菌的危害,并將其列為水體質(zhì)量檢測(cè)的重要指標(biāo)。目前針對(duì)A.veronii的研究大多集中在分離鑒定及藥敏試驗(yàn)上,而對(duì)其毒力因子及致病機(jī)制方面的研究相對(duì)較少,這也在一定程度上限制了對(duì)該病原菌的研究進(jìn)展,同時(shí)也使得越來(lái)越多的科研人員認(rèn)識(shí)到毒力因子方面研究的重要性。本試驗(yàn)基于課題組前期的研究結(jié)果上,篩選獲得了A.veronii強(qiáng)毒株TH0426中可能與其毒力相關(guān)的高表達(dá)蛋白--尸胺逆轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白CadB,在對(duì)該蛋白的編碼基因進(jìn)行比對(duì)分析時(shí),又發(fā)現(xiàn)在該菌株中存在的賴氨酸脫羧酶與該蛋白相關(guān)性較高;進(jìn)而我們利用高效自殺性質(zhì)粒介導(dǎo)的同源重組法對(duì)A.veronii TH0426中這兩個(gè)蛋白的編碼基因cadA和cadB進(jìn)行了缺失,從而構(gòu)建了A.veronii TH0426的cadA和cadB基因缺失突變株,通過(guò)對(duì)缺失株、互補(bǔ)株及野生株相關(guān)生物學(xué)特性...
【文章來(lái)源】:吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)吉林省
【文章頁(yè)數(shù)】:77 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
cadA基因上、下游基因的擴(kuò)增、連接A:TH0426基因組提;B:cadA上游基因(UcadA);C:cadA下游基因(DcadA);D:
利用限制性內(nèi)切酶 Xba I 和 Sac I 對(duì)構(gòu)建成功的克隆載體 pEASY-UD cadA 和自殺性載體 pRE112 分別進(jìn)行酶切(如圖 1.2A),而后對(duì)目的片段與載體進(jìn)行連接,從而構(gòu)建重組自殺性載體 pRE112-UD cadA(如圖 1.2 B);以重組自殺性載體 pRE112-UD cadA 為模板,利用 P13-1/P13-2對(duì)其進(jìn)行驗(yàn)證并測(cè)序,獲得大小為2649bp 的基因片段(如圖 1.2 C);且測(cè)序結(jié)果經(jīng)比對(duì)與原序列相符,表明成功構(gòu)建了重組自殺性載體 pRE112-UD cadA。圖 1.1 cadA 基因上、下游基因的擴(kuò)增、連接A:TH0426 基因組提;B: cadA 上游基因(U cadA);C: cadA 下游基因(D cadA); D:cadA 上下游基因連接(UD cadA);E: 鑒定 pEASY-UD cadA 質(zhì)粒Fig. 1.1 Amplification and connection of cadA upstream and downstream genesA:Gene of TH0426;B: cadA upstream gene(U cadA);C: cadA downstream gene(D cadA);D: cadA upstream and downstream genes(UD cadA); E: PCR for pEASY-UD cadA
基因缺失突變片段整合至目標(biāo)菌株的基因組中,該過(guò)程代表了第一同源重組的發(fā)生;在對(duì)菌株進(jìn)行篩選時(shí),我們發(fā)現(xiàn) PCR 結(jié)果中存在兩個(gè)目的片段,其中大小為 2244bp 的基因片段來(lái)源于重組自殺性載體所攜帶的 cadA 基因缺失突變片段另一個(gè)大小為 4377bp 的基因片段則來(lái)自細(xì)菌自身的基因組,該片段中包含了 UcadA 和 cadA ORF 基因片段,結(jié)果與預(yù)期相符(如圖 1.3 A)。但二次同源重組的發(fā)生,并不意味著所有菌株均會(huì)缺失目的基因,變?yōu)槿笔蛔冎辏粚?shí)則發(fā)生真正突變的菌株極少;大部分的菌株在二次同源重組發(fā)生后,均未缺失目的基因,只是隨著重組自殺性載體的崩解,恢復(fù)為野生株;而通過(guò)負(fù)向選擇獲得的疑似菌株對(duì)其提取基因組后(如圖 1.3 B),利用 P3-1/P3-2引物對(duì)其進(jìn)行驗(yàn)證,缺失突變株只能擴(kuò)增出大小為 2307bp 的基因片段,而野生株則擴(kuò)增出大小為 4440bp 的基因片段,結(jié)果與預(yù)期相符(如圖 1.3 C);隨后又利用 P4-1/P4-2引物對(duì)其再次進(jìn)行驗(yàn)證,缺失株未擴(kuò)增出相應(yīng)的目的片段,而野生株擴(kuò)增出大小為 815bp 的基因片段結(jié)果與預(yù)期相符(如圖 1.3 D);結(jié)果表明已成功構(gòu)建 cadA 基因的缺失突變株△cadA。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]甲魚(yú)源致病性維氏氣單胞菌的分離鑒定及抑菌試驗(yàn)(英文)[J]. 朱芝秀,蔣新華,鄧舜洲,王倍,李輝鴻,徐添悅. Agricultural Science & Technology. 2016(04)
[2]諾卡式菌和維氏氣單胞菌并發(fā)引起太陽(yáng)魚(yú)死亡一例[J]. 雷燕. 當(dāng)代水產(chǎn). 2016(03)
[3]加州鱸源維氏氣單胞菌的分離、鑒定及致病性[J]. 龍波,王均,賀揚(yáng),趙敏,王二龍,崔靜雯,鄧綠洲,劉韜,曾宇鯤,汪開(kāi)毓,陳德芳. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2016(01)
[4]團(tuán)頭魴致病性維氏氣單胞菌的分離鑒定及藥敏試驗(yàn)[J]. 藺凌云,潘曉藝,袁雪梅,姚嘉赟,徐洋,尹文林,許婷,郝貴杰,沈錦玉. 水產(chǎn)養(yǎng)殖. 2015(07)
[5]細(xì)菌生物膜檢測(cè)方法改進(jìn)與應(yīng)用[J]. 尤理想,趙青,周敏,汪意濤,吳淑燕,李嫄淵,黃瑞. 實(shí)驗(yàn)技術(shù)與管理. 2015(03)
[6]CRISPR/Cas9系統(tǒng)介導(dǎo)基因組編輯的研究進(jìn)展[J]. 劉志國(guó). 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2014(10)
[7]腹瀉患者糞便來(lái)源的氣單胞菌分布及耐藥性[J]. 葛檣檣,白永鳳,陳曉,余斐,鄭書(shū)發(fā),陳瑜. 中國(guó)老年學(xué)雜志. 2013(21)
[8]多胺與細(xì)菌病原的致病性[J]. 張艷霏,馬翠萍,譚訓(xùn)剛,鄒玉霞. 微生物學(xué)通報(bào). 2013(02)
[9]維氏氣單胞菌研究進(jìn)展[J]. 吳同壘,單曉楓,孟慶峰,郭偉生,王偉利,錢(qián)愛(ài)東. 中國(guó)獸藥雜志. 2011(07)
[10]框鏡鯉致病性維氏氣單胞菌的分離鑒定[J]. 龔倩,高淑琴,單曉楓,郭偉生,孟慶峰,王偉利,錢(qián)愛(ài)東. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2010(12)
碩士論文
[1]胸膜肺炎放線桿菌potD2基因缺失株的構(gòu)建及其生物學(xué)特性研究[D]. 趙雨.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]犬布魯氏菌菌殼疫苗株的構(gòu)建及實(shí)驗(yàn)免疫研究[D]. 錢(qián)晶.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]健康烏鱧體內(nèi)兩種氣單胞菌的分離、鑒定及其毒力基因檢測(cè)[D]. 胡天野.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[4]團(tuán)頭魴池塘維氏氣單胞菌的致病性、耐藥性、基因分型及其分布研究[D]. 周光.上海海洋大學(xué) 2012
[5]嗜水氣單胞菌J-1株ahyI基因缺失株的構(gòu)建及特性分析[D]. 薛玉玲.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[6]嗜水氣單胞菌J-1株β溶血素基因缺失株的構(gòu)建及特性分析[D]. 熊華萱.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
本文編號(hào):3058737
【文章來(lái)源】:吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)吉林省
【文章頁(yè)數(shù)】:77 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
cadA基因上、下游基因的擴(kuò)增、連接A:TH0426基因組提;B:cadA上游基因(UcadA);C:cadA下游基因(DcadA);D:
利用限制性內(nèi)切酶 Xba I 和 Sac I 對(duì)構(gòu)建成功的克隆載體 pEASY-UD cadA 和自殺性載體 pRE112 分別進(jìn)行酶切(如圖 1.2A),而后對(duì)目的片段與載體進(jìn)行連接,從而構(gòu)建重組自殺性載體 pRE112-UD cadA(如圖 1.2 B);以重組自殺性載體 pRE112-UD cadA 為模板,利用 P13-1/P13-2對(duì)其進(jìn)行驗(yàn)證并測(cè)序,獲得大小為2649bp 的基因片段(如圖 1.2 C);且測(cè)序結(jié)果經(jīng)比對(duì)與原序列相符,表明成功構(gòu)建了重組自殺性載體 pRE112-UD cadA。圖 1.1 cadA 基因上、下游基因的擴(kuò)增、連接A:TH0426 基因組提;B: cadA 上游基因(U cadA);C: cadA 下游基因(D cadA); D:cadA 上下游基因連接(UD cadA);E: 鑒定 pEASY-UD cadA 質(zhì)粒Fig. 1.1 Amplification and connection of cadA upstream and downstream genesA:Gene of TH0426;B: cadA upstream gene(U cadA);C: cadA downstream gene(D cadA);D: cadA upstream and downstream genes(UD cadA); E: PCR for pEASY-UD cadA
基因缺失突變片段整合至目標(biāo)菌株的基因組中,該過(guò)程代表了第一同源重組的發(fā)生;在對(duì)菌株進(jìn)行篩選時(shí),我們發(fā)現(xiàn) PCR 結(jié)果中存在兩個(gè)目的片段,其中大小為 2244bp 的基因片段來(lái)源于重組自殺性載體所攜帶的 cadA 基因缺失突變片段另一個(gè)大小為 4377bp 的基因片段則來(lái)自細(xì)菌自身的基因組,該片段中包含了 UcadA 和 cadA ORF 基因片段,結(jié)果與預(yù)期相符(如圖 1.3 A)。但二次同源重組的發(fā)生,并不意味著所有菌株均會(huì)缺失目的基因,變?yōu)槿笔蛔冎辏粚?shí)則發(fā)生真正突變的菌株極少;大部分的菌株在二次同源重組發(fā)生后,均未缺失目的基因,只是隨著重組自殺性載體的崩解,恢復(fù)為野生株;而通過(guò)負(fù)向選擇獲得的疑似菌株對(duì)其提取基因組后(如圖 1.3 B),利用 P3-1/P3-2引物對(duì)其進(jìn)行驗(yàn)證,缺失突變株只能擴(kuò)增出大小為 2307bp 的基因片段,而野生株則擴(kuò)增出大小為 4440bp 的基因片段,結(jié)果與預(yù)期相符(如圖 1.3 C);隨后又利用 P4-1/P4-2引物對(duì)其再次進(jìn)行驗(yàn)證,缺失株未擴(kuò)增出相應(yīng)的目的片段,而野生株擴(kuò)增出大小為 815bp 的基因片段結(jié)果與預(yù)期相符(如圖 1.3 D);結(jié)果表明已成功構(gòu)建 cadA 基因的缺失突變株△cadA。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]甲魚(yú)源致病性維氏氣單胞菌的分離鑒定及抑菌試驗(yàn)(英文)[J]. 朱芝秀,蔣新華,鄧舜洲,王倍,李輝鴻,徐添悅. Agricultural Science & Technology. 2016(04)
[2]諾卡式菌和維氏氣單胞菌并發(fā)引起太陽(yáng)魚(yú)死亡一例[J]. 雷燕. 當(dāng)代水產(chǎn). 2016(03)
[3]加州鱸源維氏氣單胞菌的分離、鑒定及致病性[J]. 龍波,王均,賀揚(yáng),趙敏,王二龍,崔靜雯,鄧綠洲,劉韜,曾宇鯤,汪開(kāi)毓,陳德芳. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2016(01)
[4]團(tuán)頭魴致病性維氏氣單胞菌的分離鑒定及藥敏試驗(yàn)[J]. 藺凌云,潘曉藝,袁雪梅,姚嘉赟,徐洋,尹文林,許婷,郝貴杰,沈錦玉. 水產(chǎn)養(yǎng)殖. 2015(07)
[5]細(xì)菌生物膜檢測(cè)方法改進(jìn)與應(yīng)用[J]. 尤理想,趙青,周敏,汪意濤,吳淑燕,李嫄淵,黃瑞. 實(shí)驗(yàn)技術(shù)與管理. 2015(03)
[6]CRISPR/Cas9系統(tǒng)介導(dǎo)基因組編輯的研究進(jìn)展[J]. 劉志國(guó). 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2014(10)
[7]腹瀉患者糞便來(lái)源的氣單胞菌分布及耐藥性[J]. 葛檣檣,白永鳳,陳曉,余斐,鄭書(shū)發(fā),陳瑜. 中國(guó)老年學(xué)雜志. 2013(21)
[8]多胺與細(xì)菌病原的致病性[J]. 張艷霏,馬翠萍,譚訓(xùn)剛,鄒玉霞. 微生物學(xué)通報(bào). 2013(02)
[9]維氏氣單胞菌研究進(jìn)展[J]. 吳同壘,單曉楓,孟慶峰,郭偉生,王偉利,錢(qián)愛(ài)東. 中國(guó)獸藥雜志. 2011(07)
[10]框鏡鯉致病性維氏氣單胞菌的分離鑒定[J]. 龔倩,高淑琴,單曉楓,郭偉生,孟慶峰,王偉利,錢(qián)愛(ài)東. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2010(12)
碩士論文
[1]胸膜肺炎放線桿菌potD2基因缺失株的構(gòu)建及其生物學(xué)特性研究[D]. 趙雨.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]犬布魯氏菌菌殼疫苗株的構(gòu)建及實(shí)驗(yàn)免疫研究[D]. 錢(qián)晶.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]健康烏鱧體內(nèi)兩種氣單胞菌的分離、鑒定及其毒力基因檢測(cè)[D]. 胡天野.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[4]團(tuán)頭魴池塘維氏氣單胞菌的致病性、耐藥性、基因分型及其分布研究[D]. 周光.上海海洋大學(xué) 2012
[5]嗜水氣單胞菌J-1株ahyI基因缺失株的構(gòu)建及特性分析[D]. 薛玉玲.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[6]嗜水氣單胞菌J-1株β溶血素基因缺失株的構(gòu)建及特性分析[D]. 熊華萱.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
本文編號(hào):3058737
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