基于Imp肽核酸探針檢測血清1型鴨疫里默氏菌及基于gyrA肽核酸諾氟沙星增效作用的研究
發(fā)布時間:2021-01-17 15:06
鴨疫里默氏菌(Riemerella anatipestifer,RA)是一種革蘭氏陰性菌,主要引起鴨、鵝、火雞等禽類的接觸性傳染病。本文開展了基于膜通透性增強蛋白(Imp)的肽核酸(PNA)探針檢測血清1型RA及基于拓撲異構(gòu)酶A(gyrA)的肽核酸增強諾氟沙星抗菌作用的研究,主要內(nèi)容和結(jié)果如下:1.基于Imp肽核酸探針檢測血清1型RA的研究和應用利用軟件篩選出imp基因的第134-145位點序列合成PNA-imp。在RA imp引物上添加5-FAM熒光標記,然后以血清1型RA CH-1株、血清2型RA CH-2株、ATCC 11845株及未知血清型RA各臨床分離株為模板進行PCR擴增,將PNA-imp與擴增產(chǎn)物進行雜交,熒光顯微鏡下PNA-imp與靶位點特異性結(jié)合后會呈現(xiàn)綠色熒光亮斑。結(jié)果表明:在PNA-imp 6.2μM、60°C條件下可以特異檢測到血清1型RA;對2和6型RA、大腸桿菌、鼠傷寒沙門氏菌、多殺性巴氏桿菌等檢測結(jié)果均為陰性。2.基于gyrA肽核酸增強抗菌作用的研究和應用利用軟件篩選出gyrA基因的第1591-1604位點序列合成PNA-gyrA。對比PNA-gyrA與喹...
【文章來源】:四川農(nóng)業(yè)大學四川省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
γPNA與DNA雜交復合體結(jié)構(gòu)
γPNA調(diào)控翻譯[78]
RNAstructure 5.8軟件繪制 imp mRNA 的二潛在的反義作用靶區(qū)域,如發(fā)卡、膨脹環(huán)、內(nèi)件分析靶區(qū)域 RNA 與 PNA 結(jié)合的各項參數(shù):凈能量(overall△G)、PNA 與直鏈靶序列結(jié)合因雙鏈解開所需要的能量(Break-targΔG)、Po-self△G)、PNA 分子間結(jié)合所需要的能量(o溫度(Tm),然后根據(jù)最低自由能原則篩選出結(jié)成 PNA-imp 序列遞交至 panagene 公司進行合成,得到 PNA-imp 結(jié)構(gòu)示意圖。如圖 3 所示,其中CTCTTGCGA。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]抑制DNA拓撲異構(gòu)酶Ⅰ可抑制炎性基因的表達并保護機體免受炎癥損傷[J]. 李江雪,于益芝,RIALDI A,CAMPISI L,ZHAO N. 中國腫瘤生物治療雜志. 2017(01)
[2]鴨疫里默氏桿菌16S rRNA和dnaB基因的雙重PCR檢測方法的建立[J]. 丁云竹,孫冰清,姜盼,崔俊生,陶敏捷,胡青海,常維山. 中國預防獸醫(yī)學報. 2017(01)
[3]DNA拓撲異構(gòu)酶抑制劑在逆轉(zhuǎn)腫瘤多藥耐藥性中的研究進展[J]. 張游華,顧牣賾,牛天力,張青川. 現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學. 2016(24)
[4]部分革蘭氏陰性菌脂多糖運輸?shù)鞍譒ptD的結(jié)構(gòu)及功能研究進展[J]. 莫婷,劉馬峰,程安春. 微生物學通報. 2017(01)
[5]血清15型鵝源鴨疫里默氏桿菌的分離鑒定及交叉免疫保護研究[J]. 姜安安,王小蘭,王少輝,韓先干,丁鏟,王桂軍,于圣青. 中國動物傳染病學報. 2015(03)
[6]鴨疫里默氏桿菌耐藥性及檢測方法研究進展[J]. 李亞菲,孫娜,蔣紅霞,曾振靈. 中國家禽. 2013(19)
[7]血清1型鴨疫里默氏桿菌滅活油乳劑疫苗的研制[J]. 王小蘭,胡青海,童永亮,韓先干,丁鏟,于圣青. 中國預防獸醫(yī)學報. 2012(04)
[8]鴨疫里默氏桿菌病原及其防控關(guān)鍵技術(shù)研究[J]. 程安春,朱德康,王曉佳,王雪平,張莎秋,賈仁勇,羅啟慧,韓新峰,陳孝躍,汪銘書. 中國家禽. 2012(06)
[9]近年我國部分地區(qū)鴨疫里默氏桿菌耐藥性分析[J]. 孫靜,郭浩,王秀玲,常維山. 山東畜牧獸醫(yī). 2011(05)
[10]鴨疫里默氏桿菌16 S rRNA PCR快速檢測方法的建立[J]. 馮金牛,陳芳艷,阮二壘,楊麗云,黎丁滔,陳瑞愛,區(qū)德慶,唐秀英,王林川. 中國獸醫(yī)科學. 2010(04)
本文編號:2983099
【文章來源】:四川農(nóng)業(yè)大學四川省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
γPNA與DNA雜交復合體結(jié)構(gòu)
γPNA調(diào)控翻譯[78]
RNAstructure 5.8軟件繪制 imp mRNA 的二潛在的反義作用靶區(qū)域,如發(fā)卡、膨脹環(huán)、內(nèi)件分析靶區(qū)域 RNA 與 PNA 結(jié)合的各項參數(shù):凈能量(overall△G)、PNA 與直鏈靶序列結(jié)合因雙鏈解開所需要的能量(Break-targΔG)、Po-self△G)、PNA 分子間結(jié)合所需要的能量(o溫度(Tm),然后根據(jù)最低自由能原則篩選出結(jié)成 PNA-imp 序列遞交至 panagene 公司進行合成,得到 PNA-imp 結(jié)構(gòu)示意圖。如圖 3 所示,其中CTCTTGCGA。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]抑制DNA拓撲異構(gòu)酶Ⅰ可抑制炎性基因的表達并保護機體免受炎癥損傷[J]. 李江雪,于益芝,RIALDI A,CAMPISI L,ZHAO N. 中國腫瘤生物治療雜志. 2017(01)
[2]鴨疫里默氏桿菌16S rRNA和dnaB基因的雙重PCR檢測方法的建立[J]. 丁云竹,孫冰清,姜盼,崔俊生,陶敏捷,胡青海,常維山. 中國預防獸醫(yī)學報. 2017(01)
[3]DNA拓撲異構(gòu)酶抑制劑在逆轉(zhuǎn)腫瘤多藥耐藥性中的研究進展[J]. 張游華,顧牣賾,牛天力,張青川. 現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學. 2016(24)
[4]部分革蘭氏陰性菌脂多糖運輸?shù)鞍譒ptD的結(jié)構(gòu)及功能研究進展[J]. 莫婷,劉馬峰,程安春. 微生物學通報. 2017(01)
[5]血清15型鵝源鴨疫里默氏桿菌的分離鑒定及交叉免疫保護研究[J]. 姜安安,王小蘭,王少輝,韓先干,丁鏟,王桂軍,于圣青. 中國動物傳染病學報. 2015(03)
[6]鴨疫里默氏桿菌耐藥性及檢測方法研究進展[J]. 李亞菲,孫娜,蔣紅霞,曾振靈. 中國家禽. 2013(19)
[7]血清1型鴨疫里默氏桿菌滅活油乳劑疫苗的研制[J]. 王小蘭,胡青海,童永亮,韓先干,丁鏟,于圣青. 中國預防獸醫(yī)學報. 2012(04)
[8]鴨疫里默氏桿菌病原及其防控關(guān)鍵技術(shù)研究[J]. 程安春,朱德康,王曉佳,王雪平,張莎秋,賈仁勇,羅啟慧,韓新峰,陳孝躍,汪銘書. 中國家禽. 2012(06)
[9]近年我國部分地區(qū)鴨疫里默氏桿菌耐藥性分析[J]. 孫靜,郭浩,王秀玲,常維山. 山東畜牧獸醫(yī). 2011(05)
[10]鴨疫里默氏桿菌16 S rRNA PCR快速檢測方法的建立[J]. 馮金牛,陳芳艷,阮二壘,楊麗云,黎丁滔,陳瑞愛,區(qū)德慶,唐秀英,王林川. 中國獸醫(yī)科學. 2010(04)
本文編號:2983099
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