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IGF2、IGFBP2和DRD2基因遺傳變異與番鴨產(chǎn)蛋性能的相關(guān)性研究

發(fā)布時(shí)間:2017-04-11 03:01

  本文關(guān)鍵詞:IGF2、IGFBP2和DRD2基因遺傳變異與番鴨產(chǎn)蛋性能的相關(guān)性研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:番鴨是優(yōu)良的肉用家禽,深受養(yǎng)戶和消費(fèi)者的喜愛,但番鴨的育成時(shí)間長、飼養(yǎng)成本高,產(chǎn)蛋數(shù)較少,降低了番鴨的利用價(jià)值,所以番鴨的優(yōu)質(zhì)性狀還有待發(fā)掘,特別是產(chǎn)蛋性狀的選育,更是育種工作的難點(diǎn)。傳統(tǒng)的育種方法很難對產(chǎn)蛋性狀做出精確的選擇,這就要求我們從育種分子標(biāo)記入手。本試驗(yàn)選用IGF2,IGFBP2和DRD2基因?yàn)檠芯繉ο?擴(kuò)增這些基因的CDS區(qū),研究它們在番鴨各個(gè)組織的表達(dá)規(guī)律,篩選它們的多態(tài)位點(diǎn),并探尋這些SNP與番鴨產(chǎn)蛋性狀的相關(guān)性。本實(shí)驗(yàn)獲得番鴨IGFBP2和DRD2的全長CDS區(qū)序列及IGF2基因的部分CDS區(qū)序列。檢測這三個(gè)基因在番鴨各個(gè)組織中的表達(dá)規(guī)律,發(fā)現(xiàn)番鴨IGF2基因主要在腎臟和卵巢表達(dá),在心臟、肝臟、大腦、小腦、垂體和腹脂也有較高表達(dá);IGFBP2基因主要在心臟有表達(dá);而DRD2基因主要在卵巢和腦部組織中表達(dá)。并且發(fā)現(xiàn)這三個(gè)基因在卵巢組織都有相當(dāng)高的表達(dá)水平,因此猜想這三個(gè)基因可能與繁殖性狀有一定的相關(guān)性。在IGF2,IGFBP2和DRD2基因中共發(fā)現(xiàn)50個(gè)SNP,分析其中19個(gè)SNP位點(diǎn)與產(chǎn)蛋性狀的關(guān)系發(fā)現(xiàn),IGF2基因的A-1864G和C-1704G位點(diǎn)多態(tài)性都與59周齡產(chǎn)蛋量顯著相關(guān)(P0.05),而對開產(chǎn)日齡和300日齡產(chǎn)蛋數(shù)影響不顯著(P0.05),而且2個(gè)位點(diǎn)的等位基因頻率符合哈迪溫伯格平衡;IGFBP2基因的6個(gè)SNP位點(diǎn)與開產(chǎn)日齡、59周齡產(chǎn)蛋量和300日齡產(chǎn)蛋量都沒有顯著相關(guān)(P0.05),但不同基因型之間還是存在一定差異,且6個(gè)SNP的等位基因頻率符合哈迪溫伯格平衡;DRD2基因C+7T、A+3183C、C+3301G、A+3484T和A+3489G位點(diǎn)都與59周齡產(chǎn)蛋量顯著相關(guān)(P0.05),T+3423C位點(diǎn)與59周齡產(chǎn)蛋量極顯著相關(guān)(P0.01);C+7T、C+364G和T+3423C位點(diǎn)與開產(chǎn)日齡顯著相關(guān)(P0.05),且T+3423C位點(diǎn)與300日齡產(chǎn)蛋量顯著相關(guān)(P0.05),除了C+7T和C+364G位點(diǎn),其他位點(diǎn)都偏離了哈迪溫伯格平衡。本試驗(yàn)在IGF2,IGFBP2和DRD2基因中鑒定與產(chǎn)蛋性狀顯著相關(guān)的多態(tài)位點(diǎn),可以用于對番鴨產(chǎn)蛋性狀進(jìn)行分子標(biāo)記輔助選擇。
【關(guān)鍵詞】:番鴨 產(chǎn)蛋性狀 IGF2 IGFBP2 DRD2
【學(xué)位授予單位】:華南農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:S834
【目錄】:
  • 摘要3-4
  • Abstract4-6
  • 常用縮寫詞6-10
  • 1 前言10-16
  • 1.1 我國水禽產(chǎn)業(yè)生產(chǎn)現(xiàn)狀10
  • 1.2 SNP在畜禽育種中的作用10-11
  • 1.3 IGFs系統(tǒng)的組成及作用途徑11-15
  • 1.3.1 IGF2的結(jié)構(gòu)與功能12-13
  • 1.3.2 IGFBP2的結(jié)構(gòu)和功能13-14
  • 1.3.3 IGFs對卵泡發(fā)育的影響14-15
  • 1.4 DRD2的結(jié)構(gòu)和功能15-16
  • 1.5 本研究的目的和意義16
  • 2 材料和方法16-28
  • 2.1 試驗(yàn)動(dòng)物16
  • 2.2 主要儀器設(shè)備16-17
  • 2.3 主要試劑來源及配制17-18
  • 2.3.1 主要試劑來源17
  • 2.3.2 主要試劑配制17-18
  • 2.4 試驗(yàn)方法18-28
  • 2.4.1 基因組DNA的提取18
  • 2.4.2 DNA濃度和純度的檢測18
  • 2.4.3 總RNA的抽提與檢測18-19
  • 2.4.4 RNA的反轉(zhuǎn)錄19-20
  • 2.4.5 IGF2、IGFBP2和DRD2基因CDS克隆20-23
  • 2.4.5.1 引物設(shè)計(jì)合成20-21
  • 2.4.5.2 PCR產(chǎn)物回收與純化21-22
  • 2.4.5.3 回收純化后的PCR產(chǎn)物克隆測序22-23
  • 2.4.6 IGF2、IGFBP2和DRD2基因的組織表達(dá)23-24
  • 2.4.6.1 定量引物設(shè)計(jì)合成23-24
  • 2.4.6.2 熒光定量的計(jì)算分析方法24
  • 2.4.7 SNP位點(diǎn)的篩查24-26
  • 2.4.7.1 DNA池的構(gòu)建24
  • 2.4.7.2 SNP位點(diǎn)篩查引物的設(shè)計(jì)合成24-25
  • 2.4.7.3 混池反應(yīng)體系25-26
  • 2.4.8 SNP位點(diǎn)分型26-27
  • 2.4.8.1 SNP位點(diǎn)分型引物的設(shè)計(jì)合成26-27
  • 2.4.8.2 SNP位點(diǎn)直接測序分型27
  • 2.4.9 數(shù)據(jù)分析27-28
  • 2.4.9.1 變異位點(diǎn)的篩查27
  • 2.4.9.2 關(guān)聯(lián)分析27-28
  • 3 結(jié)果與分析28-50
  • 3.1 番鴨IGF2、IGFBP2和DRD2基因CDS的克隆28-33
  • 3.1.1 組織RNA的提取和反轉(zhuǎn)錄28
  • 3.1.2 番鴨IGF2基因部分CDS的克隆28-29
  • 3.1.3 番鴨IGFBP2基因CDS的克隆29-30
  • 3.1.4 番鴨DRD2基因CDS的克隆30
  • 3.1.5 番鴨IGF2、IGFBP2和DRD2基因序列比對和同源性分析30-33
  • 3.2 番鴨IGF2、IGFBP2和DRD2基因的組織表達(dá)33-35
  • 3.2.1 IGF2基因的m RNA在番鴨各組織中的表達(dá)33
  • 3.2.2 IGFBP2基因的m RNA在番鴨各組織中的表達(dá)33-34
  • 3.2.3 DRD2基因的m RNA在番鴨各組織中的表達(dá)34-35
  • 3.3 番鴨IGF2、IGFBP2和DRD2基因的SNP位點(diǎn)的篩查35-38
  • 3.3.1 番鴨IGF2基因的SNP位點(diǎn)的篩查35
  • 3.3.2 番鴨IGFBP2基因的SNP位點(diǎn)的篩查35-36
  • 3.3.3 番鴨DRD2基因的SNP位點(diǎn)的篩查36-38
  • 3.4 番鴨IGF2、IGFBP2和DRD2基因SNP位點(diǎn)的關(guān)聯(lián)分析38-43
  • 3.4.1 番鴨IGF2基因SNP位點(diǎn)與產(chǎn)蛋性狀的關(guān)聯(lián)分析38-39
  • 3.4.2 番鴨IGFBP2基因SNP位點(diǎn)與產(chǎn)蛋性狀的關(guān)聯(lián)分析39-40
  • 3.4.3 番鴨DRD2基因SNP位點(diǎn)與產(chǎn)蛋性狀的關(guān)聯(lián)分析40-43
  • 3.5 基因型頻率和基因頻率的計(jì)算和H-W檢測43-50
  • 3.5.1 IGF2基因SNP位點(diǎn)的基因型頻率、基因頻率和H-W檢測43-44
  • 3.5.2 IGFBP2基因SNP位點(diǎn)的基因型頻率、基因頻率和H-W檢測44-46
  • 3.5.3 DRD2基因SNP位點(diǎn)的基因型頻率、基因頻率和H-W檢測46-50
  • 4 討論50-56
  • 4.1 番鴨IGF2、IGFBP2和DRD2基因的結(jié)構(gòu)分析50-51
  • 4.2 番鴨IGF2、IGFBP2和DRD2基因的組織表達(dá)分析51-52
  • 4.3 SNPs與相關(guān)產(chǎn)蛋性狀的關(guān)聯(lián)分析52-55
  • 4.3.1 IGF2基因SNPs與相關(guān)產(chǎn)蛋性狀的關(guān)聯(lián)分析52-53
  • 4.3.2 IGFBP2基因SNPs與相關(guān)產(chǎn)蛋性狀的關(guān)聯(lián)分析53-54
  • 4.3.3 DRD2基因SNPs與相關(guān)產(chǎn)蛋性狀的關(guān)聯(lián)分析54-55
  • 4.4 SNPs位點(diǎn)等位基因和基因型頻率分布55-56
  • 5 結(jié)論56-57
  • 致謝57-58
  • 參考文獻(xiàn)58-65

【參考文獻(xiàn)】

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  本文關(guān)鍵詞:IGF2、IGFBP2和DRD2基因遺傳變異與番鴨產(chǎn)蛋性能的相關(guān)性研究,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。



本文編號:298138

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