空氣微生物是規(guī)�；i場環(huán)境污染的重要因素之一,空氣中的病原微生物會影響動物、工人和周邊居民的健康狀況,而空氣中的微生物可能來源于糞便細(xì)菌的霧化。目前,對豬舍空氣微生物的研究,主要集中在少數(shù)幾種微生物或者某一特定病原微生物。關(guān)于豬舍空氣微生物的多樣性及豐度的研究,豬舍對周圍環(huán)境的空氣污染狀況研究,以及豬糞微生物和空氣微生物的對比研究,涉及較少。因此,本實(shí)驗(yàn)以四川省邛崍市金利豬場為研究對象,從2013年7月到8月,以液體撞擊式空氣采樣器采集豬舍和距離豬舍不同距離的空氣樣品,同時采集糞便樣品,提取樣品總DNA,將DNA樣品送往北京諾禾公司測序,然后利用QIIME軟件分析樣品的豐度、多樣性及差異。a多樣性分析和β多樣性分析結(jié)果顯示,糞便微生物和周圍空氣微生物多樣性及豐度差異顯著（P<0.01）,不同距離處的空氣樣品差異不顯著（P>0.05）。另外,利用QIIME軟件從OTUs水平分析不同距離處的空氣樣品差異顯著性,至少25%的樣品中含有的OTUs的總數(shù)是2593個,其中豐度差異顯著的有27個。差異顯著的OTUs僅占總體OTUs的1%,說明總體差異不顯著,分析表明是由于差異不顯著的O... 

【文章來源】：四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：61 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
常用詞語英文縮寫
1 前言
    1.1 微生物氣溶膠
        1.1.1 微生物氣溶膠的概念
        1.1.2 微生物氣溶膠的性質(zhì)
        1.1.3 畜禽舍微生物氣溶膠
    1.2 畜禽舍微生物氣溶膠的危害
        1.2.1 畜禽舍空氣微生物對人類的危害
        1.2.2 畜禽舍空氣微生物對畜禽的危害
        1.2.3 畜禽舍空氣微生物帶來的經(jīng)濟(jì)損失
        1.2.4 豬舍空氣微生物的危害
    1.3 畜禽舍空氣微生物氣溶膠的形成
    1.4 空氣微生物的研究進(jìn)展
        1.4.1 空氣微生物研究方法進(jìn)展
        1.4.2 豬舍空氣微生物的研究進(jìn)展
        1.4.3 空氣微生物傳播的研究
        1.4.4 空氣微生物國內(nèi)外研究現(xiàn)狀
    1.5 16SRDNA高通量測序
        1.5.1 16SrDNA高通量測序的原理
        1.5.2 16SrDNA高通量測序在科研上的應(yīng)用
    1.6 空氣樣品采集方法
        1.6.1 液體撞擊式空氣采樣器概述
        1.6.2 液體撞擊式空氣采樣器特點(diǎn)
        1.6.3 液體撞擊式采樣器的應(yīng)用
    1.7 本研究的目的和意義
2 材料與方法
    2.1 材料及取樣地點(diǎn)
        2.1.1 豬場情況
        2.1.2 主要試劑
        2.1.3 主要儀器設(shè)備
    2.2 方法
        2.2.1 樣本的采集與處理
        2.2.2 測序結(jié)果初步分析
        2.2.3 數(shù)據(jù)分析
3 結(jié)果與分析
    3.1 樣品采集和測序結(jié)果的前處理
    3.2 OTU熱圖
    3.3 物種注釋與菌群結(jié)構(gòu)分析
    3.4 A多樣性分析
    3.5 B多樣性分析
    3.6 樣本與因素的差異顯著性分析
        3.6.1 分析所有樣品
        3.6.2 分析空氣樣品
        3.6.3 空氣樣品中差異顯著的OTUs
    3.7 共享（SHARED）分析
        3.7.1 OTUs類型分析
    3.8 LDA EFFECT SIZE（LEFSE）分析
4 討論
    4.1 實(shí)驗(yàn)方法討論
    4.2 采樣方法討論
    4.3 數(shù)據(jù)處理方法討論
    4.4 不同距離處的空氣微生物差異不顯著
    4.5 來源問題的討論
    4.6 D類和E類微生物的病原性
    4.7 污染源傳播距離與豬場設(shè)計的關(guān)系
    4.8 氣象因素討論
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
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[2]豬舍環(huán)境氣載需氧菌的檢測及大腸桿菌氣溶膠的發(fā)生與傳播[D]. 袁文.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[3]ERIC-PCR對畜禽舍氣載耐藥大腸桿菌來源及向周邊環(huán)境傳播的檢測[D]. 姚美玲.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007



本文編號：2968713