發(fā)布時(shí)間：2021-01-04 20:17

　　微生物群落作為微生物的功能組合,在多細(xì)胞生物和環(huán)境中起著重要作用。動(dòng)物腸道微生物受到環(huán)境等多因素的影響,土壤作為環(huán)境中微生物的重要聚集地,是否會(huì)對(duì)該地區(qū)家畜腸道微生物產(chǎn)生影響,值得探索。為此本研究利用宏基因組測(cè)序技術(shù),對(duì)錫林郭勒和紅原地區(qū)家畜腸道微生物和土壤微生物多樣性進(jìn)行研究。主要結(jié)果如下:對(duì)錫林郭勒地區(qū)牛、山羊和馬腸道微生物研究結(jié)果表明:同一環(huán)境下牛、山羊和馬的腸道均以廣古菌門(mén)、厚壁菌門(mén)、變形菌門(mén)、擬桿菌門(mén)為優(yōu)勢(shì)菌門(mén),在屬水平,不同家畜間菌屬的相對(duì)豐度存在顯著差異,但是反芻動(dòng)物牛和山羊的腸道微生物結(jié)構(gòu)較為相似,其腸道中的副類桿菌屬、另枝菌屬、顫桿菌克顯著高于馬,而非反芻動(dòng)物馬腸道中Subdoligranulum顯著高于牛和山羊（P<0.05）。棲息地土壤微生物對(duì)牛、山羊、馬腸道微生物產(chǎn)生了不同的影響,其中土壤中的地嗜皮菌屬、馬賽菌屬、游動(dòng)桿菌屬、鞘脂菌屬對(duì)所有家畜腸道微生物都產(chǎn)生了顯著影響（P<0.05）。對(duì)紅原地區(qū)牛腸道微生物研究結(jié)果表明:紅原地區(qū)牛腸道以廣古菌門(mén),厚壁菌門(mén),擬桿菌門(mén),變形菌門(mén)為優(yōu)勢(shì)菌門(mén),以甲烷短桿菌屬,消化鏈球菌屬,擬桿菌屬,大腸埃希氏菌屬,另枝菌屬... 

【文章來(lái)源】：內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)

【文章頁(yè)數(shù)】：55 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖１樣本釆集分布圖??Ｆｉｇ．ｌ?Ｓａｍｐｌｅ?ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｍａｐ??

?內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文?２１＿??Ｓｕｂｄｏｌｉｇｒａｎｕｌｕｍ?（１．１４％?）?〇??卜｜｜｜＿?｜｜ｉ＿??邏＿１＿—??ｃ?—?ｒｉ?ｃｎ?＊ｒｉ?ａｃ?ｃ－??｜?１?１?１?Ｉ?Ｓ?Ｉ?Ｉ?Ｉ??圖１０紅原地區(qū)牛腸道微生物門(mén)水平（Ａ）和屬水平（Ｂ）相對(duì)含量??Ｆｉｇ．?１０?Ｔｈｅ?ｒｅｌａｔｉｖｅ?ａｂｕｎｄａｎｃｅ?ｏｆ?ｃａｔｔｌｅ?ｉｎｔｅｓｔｉｎａｌ?ｍｉｃｒｏｂｉｏｍｅ?ａｔ?ｐｈｙｌｕｍ?ｌｅｖｅｌ?（Ａ）?ａｎｄ?ａｔ?ｇｅｎｕｓ?ｌｅｖｅｌ?ＣＢ?）?ｆｒｏｍ??Ｈｏｎｇｙｕａｎ?ｒｅｇｉｏｎ??３．５紅原地區(qū)土壤微生物分析??３．５．１紅原地區(qū)土壤ａ多樣性分析??基于Ｉｌｌｕｍｉｎａ?ＨｉＳｅｑ?２０００測(cè)序技術(shù)，對(duì)紅原地區(qū)７份土壤樣品進(jìn)行宏基因組測(cè)??序，平均每個(gè)樣品測(cè)得了?６Ｇｂ以上的數(shù)據(jù)。經(jīng)過(guò)質(zhì)量控制后，平均每個(gè)樣品的測(cè)序??量為?４．６７?Ｇｂ?（范圍＝４．０７－５．２９?Ｇｂ；?ＳＤ＝０．４３）。??為了評(píng)估紅原地區(qū)土壤微生物的ａ多樣性，本研宂選取了香農(nóng)指數(shù)和辛普森指??數(shù)來(lái)反映其微生物的多樣性和豐富度，結(jié)果如表７所示。紅原地區(qū)土壤微生物香農(nóng)??指數(shù)平均?２．２０?（ｒａｎｇｅ＝ｌ．１２－３．２５），辛普森指數(shù)平均?０．７３（ｒａｎｇｅ＝０．３９－０．９４）。??

２２?不同地區(qū)家畜腸道微生物和土壤微生物多樣性及相關(guān)性研究???表７紅原地區(qū)土壤微生物多樣性指數(shù)??Ｔａｂｌｅ．７?Ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ?ｉｎｄｉｃｅｓ?ｉｎ?ｓｏｉｌ?ｍｉｃｒｏｂｉｏｍｅ?ｆｒｏｍ?Ｈｏｎｇｙｕａｎ?ｒｅｇｉｏｎ??樣品名稱?香農(nóng)指數(shù)?辛普森指數(shù)??ＨＴ２?１．８４?０．６７??ＨＴ３?１．１２?０．３９??ＨＴ４?２．９５?０．９１??ＨＴ５?１．７２?０．６８??ＨＴ６?３．２５?０．９４??ＨＴ７?１．８４?０．６５??ＨＴ８?２．７０?０．９０??Ｍｅａｎ±ＳＤ?２．２０＋０．７７?０．７３±０．２０??３．５．２紅原地區(qū)土壤微生物結(jié)構(gòu)解析??ｉ幽■??ｇ?ｅ?５?Ｉ?Ｉ?ｅ?Ｉ??ｏｔｍｒ??＇＂＇■Ｉ?Ｔ—??駿纖；ｓｓ－ｆｉｑｉｈｔｍｖａｔｔｂｉｕｍ??Ｉ?■嶋??ｒ＾ｔ?＾?〇ｆ＞??ｔ?ｔｒ?ｉｚ?ｔ?ｔｘ?完??圖１１紅原地區(qū)土壤微生物門(mén)水平（Ａ）和屬水平（Ｂ）相對(duì)含量??Ｆｉｇ．?１１?Ｔｈｅ?ｒｅｌａｔｉｖｅ?ａｂｕｎｄａｎｃｅ?ｏｆ?ｓｏｉｌ?ｍｉｃｒｏｂｉｏｍｅ?ａｔ?ｐｈｙｌｕｍ?ｌｅｖｅｌ?（Ａ）?ａｎｄ?ａｔ?ｇｅｎｕｓ?ｌｅｖｅｌ?（Ｂ）?ｆｒｏｍ??Ｈｏｎｇｙｕａｎ?ｒｅｇｉｏｎ??


本文編號(hào)：2957335