捻轉(zhuǎn)血矛線蟲是對(duì)反芻動(dòng)物影響最大的一種消化道線蟲,捻轉(zhuǎn)血矛線蟲耐藥性的產(chǎn)生,嚴(yán)重威脅著畜牧業(yè)的發(fā)展。為了篩選捻轉(zhuǎn)血矛線蟲丙硫咪唑耐藥性相關(guān)基因用于耐藥性產(chǎn)生機(jī)制研究和臨床耐藥蟲株鑒定,本研究基于轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),得到捻轉(zhuǎn)血矛線蟲丙硫咪唑敏感株和耐藥株SNP信息,進(jìn)行了功能富集分析,篩選出4個(gè)差異基因,對(duì)其進(jìn)行生物信息學(xué)分析及PCR測(cè)序驗(yàn)證;對(duì)采自內(nèi)蒙古烏審旗、察右后旗和科右前旗的丙硫咪唑耐藥種群Ⅰ型β-tubulin基因167、198和200位點(diǎn)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)進(jìn)行了檢測(cè);對(duì)捻轉(zhuǎn)血矛線蟲耐丙硫咪唑蟲株不同藥物濃度刺激下P450、GST和ABC基因表達(dá)量進(jìn)行了檢測(cè)。研究結(jié)果如下:（1）捻轉(zhuǎn)血矛線蟲HC-WSrBZ1、HC-WSrBZ2共有6090個(gè)差異基因富集到50條GO Term上,KEGG pathway共篩選出11條顯著富集通路。Hc-CYsBZ和Hc-CYrBZ共有6757個(gè)差異基因富集到50條GO Term上,KEGG pathway共篩選出19條顯著富集通路。Hc-ssBZ、Hc-XArBZ共有208個(gè)差異基因富集到26條GO Term上,KEGG pathway共篩選出10條顯... 

【文章來(lái)源】：內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)

【文章頁(yè)數(shù)】：75 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖２捻轉(zhuǎn)血矛線蟲轉(zhuǎn)錄組中ｇｅｎｉｃ?ＳＮＰ概況??Ｆｉｇ．２?Ｓｕｍｍａｒｙ?ｏｆ?ｇｅｎｉｃ?ＳＮＰ?ｗｉｔｈｉｎ?ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ?ｏｆ?Ｈ．?ｃｏｎｔｏｒｔｕｓ??

＿２８?檢轉(zhuǎn)血矛線蟲丙硫咪唑耐藥相關(guān)基因ＳＮＰ及表達(dá)研究???２．３．８差異基因擴(kuò)增產(chǎn)物測(cè)序分析??根據(jù)４個(gè)基因在４個(gè)不同樣本中ＰＣＲ產(chǎn)物測(cè)序結(jié)果，利用ＤＮ?Ａｓｔａｒ中Ｍｅｇａｌｉｇｎ軟件，??進(jìn)行捻轉(zhuǎn)血矛線蟲標(biāo)準(zhǔn)敏感蟲株與３個(gè)耐藥蟲株測(cè)序序列的兩兩比對(duì)。??ＨＣＯＮ＿００１９２０２０基因在３個(gè)耐藥蟲株中第２６６位均由Ｔ突變?yōu)椋�，見圖１２；??ＨＣＯＮ＿０００３７８００基因在３個(gè)耐藥蟲株中，第１７９、１８２、１８８位均由Ａ突變?yōu)椋�，見圖１３；??ＨＣＯＮ＿００１２９０９０基因在３個(gè)耐藥蟲株中第２８３位由Ｇ突變?yōu)椋粒妶DＩ４；??ＨＣＯＮ＿００１７８６５０基因在３個(gè)耐藥蟲株中第８９位均由Ｃ突變?yōu)椋�，見圖１５。突變結(jié)果均??與轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果一致。??■?．?ＪＭＢｉｉ?ａｉａｉｉ??＾５０?２＂０?２７０?￡Ｓ０?￡＆０??＾ＴＵ，Ｔ＾Ｃ－＾ＣＡＴＣｄ５｛；ｉＧＸＣＡ５ｒ，??ｔ?ｍｍｍｍｍｍｍｍｍｍ??ＧｙｒｔＡＧＸＡＣＳ甲山．ｒｔ？〒：?只?＾ｔＡＡｒＣ－ＡＣ＾ＣＡｔＣＣＣ＞Ｃ＞ＡＳ＞＞ＣＡｇＴ??＾?２５０?Ｚ￡０?２＊０?２－？Ｃ?２￡Ｃ?２＾０??ｗｎ?Ｋ＆ＡＡＣＧ?從ＭＵ．ＴＧＡ＾ＣＩｗＩＣＣｐｔＡ＾Ｃ＾ＧＴ??？說(shuō)?ＣＡ：Ｃ?扯ＡＣＯ．Ｓ：??ＭＢＢＲｌ?９ＨＨＫ?１＾?０ＨＨＢ８８ＢＢ８ＳＨＢ１??ｌＣ＜－ＣＸＡ＾Ｃ＾Ｃ＞Ｔ＾ＴｒＫＣ－ＴＣ＾?＾＾．：ＳＡＳＣ－Ｃ?Ｃ？碑？渾：??ｒ７Ｉ〇?＾?ｃ?－〇?以?紓０??ｍｕｒｅ＊？■上：說(shuō)？相ｅｘ：?ｒＡＴ＾．Ｔｃ－ｘ＾ｃｘｒｃｄｊｔＡＳＡＣＡＧＴ??圖１２?ＨＣＯＮ＿００１９２０２０基因比

Ｇ?陽(yáng)性數(shù)?／％?／％＿??羊群１?５?丙硫咪唑?３４８０?５?７２０?１?７９．３１?８０??羊群２?５?丙硫咪唑?１２４０?５?１１２０?５?＾６８?０??４．３．３蟲卵孵化試驗(yàn)結(jié)果??求出校正蟲卵孵化抑制率，利用Ｅｘｃｅｌ軟件求出概率單位，以藥物濃度的對(duì)數(shù)為??橫坐標(biāo)，概率單位為縱坐標(biāo)，做散點(diǎn)圖并繪制線性回歸方程。羊群１捻轉(zhuǎn)血矛線蟲蟲??卵孵化試驗(yàn)線性回歸方程為ｙ＝〇．４９７３ｘ＋５．７３６６（Ｒ２＝０．６６５８），ＬＤ５Ｑ＝０．２２７噸／ｍＬ，結(jié)果??見圖１９?；羊群２捻轉(zhuǎn)血矛線蟲蟲卵孵化試驗(yàn)線性回歸方程為??ｙ＝０．３６０８ｘ＋５．０６１６（Ｒ２＝０．９０６３），ＬＤ５０＝０．８４３?ｐｇ／ｍＬ，如圖２０所示。據(jù)國(guó)內(nèi)外報(bào)道，受??檢樣品ＬＤ５Ｑ值大于０．１｜ｉｇ／ｍＬ時(shí)，可判定該蟲卵對(duì)于丙硫咪唑耐藥。羊群１捻轉(zhuǎn)血矛線??蟲ＬＤ５〇＝０．２２７?＾ｉｇ／ｍＬ，表示出現(xiàn)了耐藥性，而羊群２捻轉(zhuǎn)血矛線蟲ＬＤ５〇Ｋ）．８４３?＾ｇ／ｍＬ，??遠(yuǎn)大于０．１?（ｉｇ／ｍＬ，表；ＴＣ該羊群存在嚴(yán)重耐藥性。??ｃ?６????????ｒ?Ｘ?５??ｙ＝０．４９７３ｘ?＋５．７３６６?４??蛛?？?Ｒ２?＝?０．６６５８??蟲?－??２??１??－２．５?－２?－１．５?－０．５?０??藥物濃度的對(duì)數(shù)??圖１９羊群１捻轉(zhuǎn)血矛線蟲蟲卵孵化試驗(yàn)??Ｆｉｇ．１９?Ｅｇｇ?ｈａｔｃｈ?ｔｅｓｔ?ｏｆ?Ｈ．?ｃｏｎｔｏｒｔｕｓ?ｉｎ?ｆｌｏｃｋ?１??


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