捻轉血矛線蟲是對反芻動物影響最大的一種消化道線蟲,捻轉血矛線蟲耐藥性的產生,嚴重威脅著畜牧業(yè)的發(fā)展。為了篩選捻轉血矛線蟲丙硫咪唑耐藥性相關基因用于耐藥性產生機制研究和臨床耐藥蟲株鑒定,本研究基于轉錄組數據,得到捻轉血矛線蟲丙硫咪唑敏感株和耐藥株SNP信息,進行了功能富集分析,篩選出4個差異基因,對其進行生物信息學分析及PCR測序驗證;對采自內蒙古烏審旗、察右后旗和科右前旗的丙硫咪唑耐藥種群Ⅰ型β-tubulin基因167、198和200位點單核苷酸多態(tài)性位點進行了檢測;對捻轉血矛線蟲耐丙硫咪唑蟲株不同藥物濃度刺激下P450、GST和ABC基因表達量進行了檢測。研究結果如下:（1）捻轉血矛線蟲HC-WSrBZ1、HC-WSrBZ2共有6090個差異基因富集到50條GO Term上,KEGG pathway共篩選出11條顯著富集通路。Hc-CYsBZ和Hc-CYrBZ共有6757個差異基因富集到50條GO Term上,KEGG pathway共篩選出19條顯著富集通路。Hc-ssBZ、Hc-XArBZ共有208個差異基因富集到26條GO Term上,KEGG pathway共篩選出10條顯... 

【文章來源】：內蒙古農業(yè)大學內蒙古自治區(qū)

【文章頁數】：75 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖２捻轉血矛線蟲轉錄組中ｇｅｎｉｃ?ＳＮＰ概況??Ｆｉｇ．２?Ｓｕｍｍａｒｙ?ｏｆ?ｇｅｎｉｃ?ＳＮＰ?ｗｉｔｈｉｎ?ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ?ｏｆ?Ｈ．?ｃｏｎｔｏｒｔｕｓ??

＿２８?檢轉血矛線蟲丙硫咪唑耐藥相關基因ＳＮＰ及表達研究???２．３．８差異基因擴增產物測序分析??根據４個基因在４個不同樣本中ＰＣＲ產物測序結果，利用ＤＮ?Ａｓｔａｒ中Ｍｅｇａｌｉｇｎ軟件，??進行捻轉血矛線蟲標準敏感蟲株與３個耐藥蟲株測序序列的兩兩比對。??ＨＣＯＮ＿００１９２０２０基因在３個耐藥蟲株中第２６６位均由Ｔ突變?yōu)椋�，見圖１２；??ＨＣＯＮ＿０００３７８００基因在３個耐藥蟲株中，第１７９、１８２、１８８位均由Ａ突變?yōu)椋牵妶D１３；??ＨＣＯＮ＿００１２９０９０基因在３個耐藥蟲株中第２８３位由Ｇ突變?yōu)椋�，見圖Ｉ４；??ＨＣＯＮ＿００１７８６５０基因在３個耐藥蟲株中第８９位均由Ｃ突變?yōu)椋粒妶D１５。突變結果均??與轉錄組測序結果一致。??■?．?ＪＭＢｉｉ?ａｉａｉｉ??＾５０?２＂０?２７０?￡Ｓ０?￡＆０??＾ＴＵ，Ｔ＾Ｃ－＾ＣＡＴＣｄ５｛；ｉＧＸＣＡ５ｒ，??ｔ?ｍｍｍｍｍｍｍｍｍｍ??ＧｙｒｔＡＧＸＡＣＳ甲山．ｒｔ？〒：?只?＾ｔＡＡｒＣ－ＡＣ＾ＣＡｔＣＣＣ＞Ｃ＞ＡＳ＞＞ＣＡｇＴ??＾?２５０?Ｚ￡０?２＊０?２－？Ｃ?２￡Ｃ?２＾０??ｗｎ?Ｋ＆ＡＡＣＧ?從ＭＵ．ＴＧＡ＾ＣＩｗＩＣＣｐｔＡ＾Ｃ＾ＧＴ??？說?ＣＡ：Ｃ?扯ＡＣＯ．Ｓ：??ＭＢＢＲｌ?９ＨＨＫ?１＾?０ＨＨＢ８８ＢＢ８ＳＨＢ１??ｌＣ＜－ＣＸＡ＾Ｃ＾Ｃ＞Ｔ＾ＴｒＫＣ－ＴＣ＾?＾＾．：ＳＡＳＣ－Ｃ?Ｃ？碑？渾：??ｒ７Ｉ〇?＾?ｃ?－〇?以?紓０??ｍｕｒｅ＊？■上：說？相ｅｘ：?ｒＡＴ＾．Ｔｃ－ｘ＾ｃｘｒｃｄｊｔＡＳＡＣＡＧＴ??圖１２?ＨＣＯＮ＿００１９２０２０基因比

Ｇ?陽性數?／％?／％＿??羊群１?５?丙硫咪唑?３４８０?５?７２０?１?７９．３１?８０??羊群２?５?丙硫咪唑?１２４０?５?１１２０?５?＾６８?０??４．３．３蟲卵孵化試驗結果??求出校正蟲卵孵化抑制率，利用Ｅｘｃｅｌ軟件求出概率單位，以藥物濃度的對數為??橫坐標，概率單位為縱坐標，做散點圖并繪制線性回歸方程。羊群１捻轉血矛線蟲蟲??卵孵化試驗線性回歸方程為ｙ＝〇．４９７３ｘ＋５．７３６６（Ｒ２＝０．６６５８），ＬＤ５Ｑ＝０．２２７噸／ｍＬ，結果??見圖１９?；羊群２捻轉血矛線蟲蟲卵孵化試驗線性回歸方程為??ｙ＝０．３６０８ｘ＋５．０６１６（Ｒ２＝０．９０６３），ＬＤ５０＝０．８４３?ｐｇ／ｍＬ，如圖２０所示。據國內外報道，受??檢樣品ＬＤ５Ｑ值大于０．１｜ｉｇ／ｍＬ時，可判定該蟲卵對于丙硫咪唑耐藥。羊群１捻轉血矛線??蟲ＬＤ５〇＝０．２２７?＾ｉｇ／ｍＬ，表示出現了耐藥性，而羊群２捻轉血矛線蟲ＬＤ５〇Ｋ）．８４３?＾ｇ／ｍＬ，??遠大于０．１?（ｉｇ／ｍＬ，表；ＴＣ該羊群存在嚴重耐藥性。??ｃ?６????????ｒ?Ｘ?５??ｙ＝０．４９７３ｘ?＋５．７３６６?４??蛛?？?Ｒ２?＝?０．６６５８??蟲?－??２??１??－２．５?－２?－１．５?－０．５?０??藥物濃度的對數??圖１９羊群１捻轉血矛線蟲蟲卵孵化試驗??Ｆｉｇ．１９?Ｅｇｇ?ｈａｔｃｈ?ｔｅｓｔ?ｏｆ?Ｈ．?ｃｏｎｔｏｒｔｕｓ?ｉｎ?ｆｌｏｃｋ?１??


本文編號：2957258