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馬立克氏腫瘤的泛素化組分析及CDK1泛素化的鑒定

發(fā)布時(shí)間:2020-12-05 10:29
  馬立克氏。∕D)是由血清1型馬立克氏病毒(MDV-1)引起的雞淋巴組織增生性傳染病。雞CD4+T細(xì)胞最易被MDV感染轉(zhuǎn)化,可經(jīng)浸潤(rùn)在外周神經(jīng)和內(nèi)臟器官中形成T淋巴瘤并引起免疫抑制。MDV編碼的基因參與MD腫瘤發(fā)生、MDV的感染與復(fù)制等過(guò)程,一些有關(guān)MD腫瘤的轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組分析也揭示MDV可通過(guò)改變宿主細(xì)胞的組學(xué)促進(jìn)致病。本實(shí)驗(yàn)的前期研究發(fā)現(xiàn)MDV編碼的被膜蛋白UL36具有去泛素化酶活性,并在MD腫瘤細(xì)胞中高水平表達(dá),此蛋白在MDV的復(fù)制、致瘤及傳播中發(fā)揮重要作用。由于動(dòng)物細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)泛素化參與細(xì)胞周期、增殖、分化、凋亡和病毒感染等過(guò)程,我們推測(cè)MDV可能改變雞CD4+T淋巴細(xì)胞的泛素化組以促進(jìn)腫瘤發(fā)生及免疫功能異常。因此,本研究對(duì)MD腫瘤細(xì)胞與雞正常CD4+T細(xì)胞的泛素化組差異進(jìn)行了分析。本研究應(yīng)用抗泛素化肽段(K-ε-GG)的單克隆抗體分離MD腫瘤細(xì)胞系MDCC-MSB1細(xì)胞和CD4+T淋巴細(xì)胞中的泛素化多肽,然后應(yīng)用質(zhì)譜對(duì)多肽進(jìn)行定量和定性分析,并應(yīng)用生物信息學(xué)分析泛素化基序、結(jié)構(gòu)域以及蛋... 

【文章來(lái)源】:吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:112 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

馬立克氏腫瘤的泛素化組分析及CDK1泛素化的鑒定


純化的雞CD4+T淋巴細(xì)胞的純度鑒定Fig.1.1VerificationofthepurifiedchickenCD4+Tlymphocytes

泛素化,多肽,比值,蛋白質(zhì)


圖 1.3 MS 數(shù)據(jù)的質(zhì)量控制分析Fig. 1.3 Quality control and validation of MS dataA. 鑒定到的多肽的質(zhì)量誤差分布。B. 不同長(zhǎng)度多肽的個(gè)數(shù). The mass error distribution of the identified peptides. B. Number of peptidesdifferent lengths.本實(shí)驗(yàn)中,一共鑒定到了 2880 個(gè)蛋白質(zhì)和這些蛋白質(zhì)中的 10024 個(gè)泛。除去 MDCC-MSB1/T cells(M/T 比值)定量比值中的無(wú)效的統(tǒng)計(jì)結(jié)有 2350 個(gè)蛋白和其中的 7097 個(gè)泛素化多肽定量檢測(cè)比值具有統(tǒng)計(jì)<0.05)。在此基礎(chǔ)上,M/T 比值≥2.0 認(rèn)為是泛素化顯著上調(diào),而 T/M 比值為是泛素化顯著下調(diào)。每個(gè)樣品均進(jìn)行三次平行重復(fù)實(shí)驗(yàn),檢測(cè)數(shù)據(jù)的果如圖 1.4,x/y 的值接近 1 則表示數(shù)據(jù)有很好的再現(xiàn)性,圖中可知所得展現(xiàn)了良好的重復(fù)性。最終,檢測(cè)到有 717 個(gè)蛋白質(zhì)及其 1638 個(gè)肽段

散點(diǎn)圖,再現(xiàn)性,比率,散點(diǎn)圖


圖 1.4 使用散點(diǎn)圖對(duì)三次重復(fù)實(shí)驗(yàn)的再現(xiàn)性分析Fig. 1.4 Reproducibility analysis of three repeated measures using a scatter diagramA. 橫軸表示 LOG2(M-1 / T-1 比率)的值,縱軸表示 LOG2(M-2 / T-2 比率)的值。 B. 橫軸表示 LOG2(M-2 / T-2 比率)的值,縱軸表示 LOG2(M-3 / T-3比率)的值。C. 橫軸表示 LOG2(M-1 / T-1 比率)值,縱軸表示 LOG2(M-3 / T-3比率)值A(chǔ). The x-axis presents the LOG2 (M-1/T-1 ratio) values, and the y-axis presents theLOG2 (M-2/T-2 ratio) values. B. The x-axis presents the LOG2 (M-2/T-2 ratio)values, and the y-axis presents the LOG2 (M-3/T-3 ratio) values. C. The x-axispresents the LOG2 (M-1/T-1 ratio) values, and the y-axis presents the LOG2(M-3/T-3 ratio) values.1.3.3.2 ‘RD.K..N’基序更容易受 MDV 的泛素化或去泛素化調(diào)節(jié)

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]馬立克氏病毒UL36蛋白的表達(dá)及其去泛素化酶活性分析[J]. 王夢(mèng)云,周宏達(dá),韋美甜,呂巖,吳山力,艾永興.  畜牧與獸醫(yī). 2017(05)



本文編號(hào):2899310

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