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松遼黑豬RBP4和RARG基因多態(tài)性及其與繁殖性狀的關(guān)聯(lián)分析

發(fā)布時間:2020-10-31 17:09
   母豬繁殖性狀對養(yǎng)豬業(yè)的生產(chǎn)效益和經(jīng)濟利益至關(guān)重要,近年來與母豬繁殖性狀相關(guān)的候選基因及分子標記備受關(guān)注。本研究以132頭松遼黑豬為研究對象,選取與豬繁殖性狀相關(guān)的視黃醇結(jié)合蛋白4(RBP4)和視黃酸受體γ(RARG)基因為候選基因,采用PCR-HRM分析與DNA測序相結(jié)合的方法,檢測松遼黑豬RBP4和RARG基因部分外顯子的單核苷酸多態(tài)性(SNP),并比較分析不同基因型與母豬總產(chǎn)仔數(shù)、產(chǎn)活仔數(shù)、初生重、3周齡重、斷奶重及乳頭數(shù)的關(guān)聯(lián)性,旨在尋找與松遼黑豬繁殖性狀相關(guān)的SNP,為松遼黑豬高繁殖力新品系的選育奠定基礎(chǔ)。研究結(jié)果表明:1.在松遼黑豬RBP4基因第3外顯子和第5外顯子上各發(fā)現(xiàn)一個SNP位點,分別命名為為G45A和C170T,其中在G45A位點檢測到GG、GA和AA 3種基因型,在C170T位點檢測到CC和CT 2種基因型;在松遼黑豬RARG基因第6外顯子及第8外顯子上均未檢測到SNP位點。2.RBP4基因G45A位點在該松遼黑豬群體中分布較為均勻,遺傳變異程度處于中等水平,可提供遺傳信息性中等,偏離Hardy-Weinberg定律(P0.05);C170T位點在該實驗群體中分布不均勻,遺傳變異程度較低,可提供遺傳信息性較低,未偏離Hardy-Weinberg定律(P0.05)。3.在RBP4基因G45A位點上,3種基因型的總產(chǎn)仔數(shù)及產(chǎn)活仔數(shù)均表現(xiàn)為GGGAAA基因型,其中GG基因型的總產(chǎn)仔數(shù)、產(chǎn)活仔數(shù)顯著地高于AA基因型(P0.05);在仔豬3周齡重方面,GG基因型顯著低于GA基因型(P0.05);在仔豬斷奶重上GG基因型顯著低于GA及AA基因型(P0.05);該位點各基因型在仔豬初生重及乳頭數(shù)上未表現(xiàn)出顯著差異(P0.05)。在C170T位點上,不同基因型松遼黑豬的總產(chǎn)仔數(shù)、產(chǎn)活仔數(shù)、仔豬初生重、3周齡重、斷奶重及乳頭數(shù)均無顯著差異(P0.05)。4.綜上,RBP4基因G45A位點對松遼黑豬產(chǎn)仔數(shù)具有顯著影響,今后可將該位點作為選留高產(chǎn)仔數(shù)母豬個體的參考之一。但該位點是否可作為松遼黑豬產(chǎn)仔數(shù)相關(guān)的遺傳標記,有待進一步研究。RBP4基因C170T位點可能不是松遼黑豬繁殖性狀相關(guān)的突變位點,在后期工作中,需擴大群體做進一步驗證。目前尚不能確定RBP4基因是否為影響松遼黑豬繁殖性狀的主效基因,需要從該基因的功能及作用機制等方面出發(fā)加以驗證。
【學位單位】:長春師范大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2019
【中圖分類】:S828
【部分圖文】:

外顯子,基因,測序,基因型


D:AA 基因型D: AA genotype圖 3.3 RBP4 基因第 3 外顯子測序結(jié)果Fig.3.3 The sequencing results of Exon 3 of RBP4 gene
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本文編號:2864244

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