趨化因子受體2(CXCR2)作為一種重要的信號(hào)分子受體,能夠與其配體結(jié)合,介導(dǎo)免疫和炎癥反應(yīng)的發(fā)生。本研究以中國荷斯坦奶牛246個(gè)個(gè)體為材料,采用PCR-RFLP、DNA測(cè)序技術(shù)及DNA序列分析技術(shù),結(jié)合SPSS分析,研究炎癥應(yīng)答相關(guān)的基因CXCR2的啟動(dòng)子區(qū)域、內(nèi)含子區(qū)域、外顯子區(qū)域、及3端非編碼區(qū)的遺傳變異,以探討實(shí)驗(yàn)牛群體中CXCR2基因的遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳信息多樣性。結(jié)合奶牛個(gè)體的產(chǎn)奶性狀指標(biāo),包括產(chǎn)奶量、乳脂率、乳蛋白率、體細(xì)胞評(píng)分等,對(duì)CXCR2基因的遺傳突變位點(diǎn)與產(chǎn)奶性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,篩選影響中國荷斯坦奶牛產(chǎn)奶性狀和抗病性狀的分子標(biāo)記,為中國荷斯坦奶牛的經(jīng)濟(jì)性狀選育的分子標(biāo)記輔助選擇和優(yōu)質(zhì)高產(chǎn)新品系培育提供理論依據(jù)。試驗(yàn)得到以下主要結(jié)果:1.采用PCR-RFLP及測(cè)序的方法,研究中國荷斯坦奶牛CXCR2基因的遺傳變異情況。實(shí)驗(yàn)牛群體中,篩選出CXCR2基因序列上存在3個(gè)遺傳變異位點(diǎn),分別是g.106178917 AG、g.106186215GA和g.106191980 AG。而進(jìn)一步的DNA序列分析表明,g.106178917 AG、g.106186215GA和g.106191980 AG突變位點(diǎn)均位于CXCR2基因的內(nèi)含子區(qū)域。2.多態(tài)位點(diǎn)遺傳分析表明,在實(shí)驗(yàn)牛群體中,g.106178917 AG位點(diǎn)A等位基因占主導(dǎo)為59.15%,AG基因型頻率為79.27%最高。g.106186215GA位點(diǎn)G等位基因占主導(dǎo)為96.55%,其中,GG基因型頻率為93.91%最高。而g.106191980 AG位點(diǎn)A等位基因占主導(dǎo)為54.37%,AG基因型頻率為89.58%最高。χ2適合性檢驗(yàn)表明,篩選出CXCR2基因序列的3個(gè)遺傳變異位點(diǎn)在實(shí)驗(yàn)牛群體中處于哈代溫伯格非平衡狀態(tài)。PIC多態(tài)信息含量(PIC)分析結(jié)果說明,g.106178917 AG和g.106191980 AG處于中度多態(tài),而g.106186215GA處于低度多態(tài)。3.關(guān)聯(lián)分析結(jié)果表明,CXCR2基因序列上3個(gè)遺傳變異位點(diǎn)均與產(chǎn)奶量顯著相關(guān)。其中,g.106178917 AG位點(diǎn)AG基因型,g.106186215GA位點(diǎn)AA基因型和g.106191980 AG位點(diǎn)AG基因型與高產(chǎn)奶量顯著相關(guān)。在中國荷斯坦奶牛CXCR2基因的內(nèi)含子中鑒定出3個(gè)遺傳變異位點(diǎn),且都與奶牛的SCS,產(chǎn)奶量,脂肪和蛋白質(zhì)百分比顯示出高度顯著的相關(guān)性,表明這三個(gè)SNP位點(diǎn)可作為中國荷斯坦奶牛牛產(chǎn)奶性狀和抗病性狀的分子標(biāo)記基因。
【學(xué)位單位】：西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位年份】：2019
【中圖分類】：S823.2
【文章目錄】：
摘要
Abstract
CHAPTER-Ⅰ INTRODUCTION AND REVIEW OF LITERATURE
    1.1 Introduction
    1.2 Mastitis and the mammary gland
        1.2.1 Mastitis-Causing Pathogens
    1.3 Genetic improvement of mastitis
        1.3.1 Current selection methods in dairy production
        1.3.2 Marker-based selection methods
CHAPTER-Ⅱ MATERIALS AND METHODS
    2.1 Experiment material
        2.1.1 Collection of test materials
        2.1.2 Test total technical route
        2.1.3 Preparation of common solutions and reagents
        2.1.4 Main instruments and equipment
    2.2
CHAPTER-Ⅲ RESULTS
    3.1 CXCR2 gene SNP locus detection
    3.2 CXCR2 gene SNP locus typing
    3.3 CXCR2 gene SNP locus population genetic analysis
    3.4 Analysis of association between SNP locus and SCS and milk production traits of the CXCR2 gene
    3.5 CXCR2 gene SNP locus linkage disequilibrium analysis
    3.6 CXCR2 gene SNP locus haplotype analysis
    3.7 Association of SNP locus haplotypes with SCS and milk production traits
CHAPTER-Ⅳ DISCUSSION
    4.1 Mastitis and somatic cell score（SCS）
    4.2 PCR-PIRA（PCR-primer introduced restriction analysis）improves the efficiency of SNP locus typing
    4.3.Association between CXCR2 gene polymorphism and traits
CHAPTER-Ⅴ CONCLUSION
REFERENCES
ACKNOWLEDGEMENTS
CURRICULUM VITAE

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本文編號(hào)：2851195