獲得版納微型豬近交系(BMI)CATSPER3基因部分編碼區(qū)序列,通過生物信息學(xué)分析其氨基酸序列和進行不同物種間的同源性比較。以版納微型豬近交系的公豬睪丸為材料提取RNA,RT-PCR方法擴增CATSPER3基因部分編碼區(qū)序列,利用在線分析軟件進行生物信息學(xué)分析。結(jié)果顯示,擴增出CATSPER3基因部分編碼區(qū)序列。生物信息學(xué)分析表明,推導(dǎo)氨基酸序列,編碼蛋白分子量為19.397 3 k D,理論等電點為5.05;在氨基酸組成上,酸性氨基酸(Asp+Glu)有24個、堿性氨基酸(Lys+Arg)有16個,其中以亮氨酸(Leu)占13.3%、纈氨酸(Val)占9.6%、蘇氨酸(Thr)占9.0%、苯丙氨酸(Phe)占8.4%、谷氨酸(Glu)占7.2%,天冬氨酸(Asp)占7.2%等含量較高。在核苷酸相似度上與普通豬相似度最高,與山羊核苷酸的相似度較低;分子系統(tǒng)進化樹表明與非近交系豬同處于一個分支中,親緣關(guān)系較近,與山羊和綿羊親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。
【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 引物設(shè)計
        1.2.2 RNA的提取、c DNA合成
        1.2.3 CATSPER3基因PCR擴增
        1.2.4 CATSPER3基因克隆
        1.2.5 CATSPER3基因序列的生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果
    2.1 CATSPER3基因擴增結(jié)果
    2.2 CATSPER3基因序列生物信息學(xué)分析
3 討論
4 結(jié)論

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本文編號：2833140