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鴨PRLR基因單核苷酸多態(tài)性和拷貝數(shù)變異研究

發(fā)布時間:2020-09-21 13:19
   本研究以臺灣褐色菜鴨為試驗動物,通過PCR-SSCP測序?qū)ε_灣褐色菜PRLR基因第10外顯子進(jìn)行單核苷酸多態(tài)性檢測并分析其多態(tài)性與臺灣褐色菜鴨各性狀的關(guān)聯(lián);通過克隆獲得目的基因和參照基因的重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品,10倍濃度梯度稀釋后進(jìn)行定量PCR擴(kuò)增,獲得引物的擴(kuò)增曲線和熔解曲線,繪制相應(yīng)的標(biāo)準(zhǔn)曲線,優(yōu)化擴(kuò)增條件使得目標(biāo)基因和參照基因的引物擴(kuò)增效率一致,最后通過2-△△Ct方法對PRLR基因拷貝數(shù)進(jìn)行定量,并分析其多態(tài)性與臺灣褐色菜鴨生產(chǎn)性能的關(guān)聯(lián)。結(jié)果如下:(1)在臺灣褐色菜鴨PRLR基因第10外顯子檢測到1個堿基突變(G253A),存在BB和Bb兩種基因型,B等位基因頻率為0.787 2,b等位基因頻率為0.2128,雜合度為0.3350,多態(tài)信息含量為0.2789,屬于中度多態(tài);χ2適應(yīng)性檢驗結(jié)果表明PRLR基因第10外顯子的多態(tài)位點偏離Hardy-Weinberg平衡(P0.05)。Bb基因型個體的出生重和300日齡蛋重均顯著高于BB型(P0.05),且Bb基因型個體的蛋殼重極顯著高于BB基因型(P0.01),(2)以10倍濃度梯度稀釋的重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品為模板進(jìn)行熒光定量PCR擴(kuò)增,繪制相應(yīng)的標(biāo)準(zhǔn)曲線。結(jié)果顯示,PRLR和Ldh-B的標(biāo)準(zhǔn)曲線的R2分別為0.991和0.990,擴(kuò)增效率分別為111.68%和108.429%,斜率分別為-3.070和-3.135,說明PRLR和Lah-B的擴(kuò)增效率近似一致,可以通過2-△△Ct方法對PRLR基因進(jìn)行定量分析。(3)在94羽臺灣褐色菜鴨的樣品中共檢測到1、2、3、4、5五種拷貝數(shù)變異類型,拷貝數(shù)變異與臺灣褐色菜鴨的蛋殼厚度和蛋形指數(shù)顯著相關(guān)(P0.05),拷貝數(shù)為2的個體蛋殼厚度顯著高于拷貝數(shù)為1和5的個體;拷貝數(shù)為3的個體蛋形指數(shù)顯著低于拷貝數(shù)為1、2和4的個體;其余性狀均無顯著相關(guān)(P0.05)。
【學(xué)位單位】:福建農(nóng)林大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2015
【中圖分類】:S834

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本文編號:2823532

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