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藏豬IFN-λ3基因克

發(fā)布時(shí)間:2020-08-25 07:38
【摘要】:當(dāng)病原體入侵時(shí),機(jī)體能夠快速產(chǎn)生強(qiáng)大的先天免疫應(yīng)答,其中干擾素信號(hào)通路最為經(jīng)典。目前,根據(jù)干擾素的來(lái)源、核苷酸和氨基酸序列、結(jié)構(gòu)、受體以及生物學(xué)功能的不同,將其分為Ⅰ型干擾素(IFN-α/β)、Ⅱ型干擾素(IFN-γ)以及Ⅲ型干擾素(IFN-λ)。Ⅲ型干擾素是近年來(lái)新發(fā)現(xiàn)的一類干擾素。進(jìn)一步研究表明其生物學(xué)功能和信號(hào)通路與Ⅰ型干擾素較為相似,首先與IFN-lR1和IL-10R2組成的受體復(fù)合物結(jié)合后,激活Jak-STAT信號(hào)通路,誘導(dǎo)大量干擾素刺激基因表達(dá)。由于Ⅲ型干擾素特異性受體IFN-lR1在上皮細(xì)胞和組織的大量表達(dá),研究表明Ⅲ型干擾素在粘膜表面發(fā)揮著比Ⅰ型干擾素更特異的抗病毒功能。豬輪狀病毒(Porcine Rotavirus,PoRV)感染是一類致死率極高的烈性傳染病,具體癥狀表現(xiàn)為仔豬腹瀉,在世界范圍內(nèi)廣泛流行,給養(yǎng)豬業(yè)造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失。腸道上皮細(xì)胞是其感染的主要靶細(xì)胞。本文首次對(duì)藏豬的IFN-λ3基因進(jìn)行克隆、原核表達(dá)、并研究其對(duì)豬輪狀病毒的抗病毒活性。1.藏豬IFN-λ3基因克隆及生物信息學(xué)分析根據(jù)GenBank中豬IFN-λ3基因序列(登錄號(hào):NM_001166490)設(shè)計(jì)引物,采用RT-PCR方法從藏豬腸道和肺臟中擴(kuò)增出其IFN-λ3基因(ZPoIFN-λ3),將藏豬IFN-λ3基因克隆至pMD19-T載體上,構(gòu)建重組質(zhì)粒pMD19-T-ZPoIFN-λ3。使用生物信息學(xué)軟件分析,藏豬IFN-λ3核酸序列與野豬核酸同源性為100%,完整ORF全長(zhǎng)588bp。藏豬的IFN-λ3基因編碼蛋白共有23個(gè)氨基酸信號(hào)肽和172個(gè)氨基酸的成熟肽。藏豬IFN-λ3編碼的氨基酸序列含有13個(gè)磷酸化位點(diǎn)、5個(gè)糖基化位點(diǎn),其中1個(gè)為N-糖基化位點(diǎn),4個(gè)O-糖基化位點(diǎn)。藏豬IFN-λ3的二級(jí)結(jié)構(gòu)主要由α-螺旋和無(wú)規(guī)則卷曲組成。2.藏豬IFN-λ3成熟肽基因的原核表達(dá)及抗病毒活性檢測(cè)以pMD19-T-ZPoIFN-λ3質(zhì)粒為模板,克隆藏豬IFN-λ3成熟肽基因(pMD19-T-mZPoIFN-λ3),構(gòu)建原核表達(dá)載體pET-32a(+)-mZPoIFN-λ3,于大腸桿菌BL21(DE3)中表達(dá),成功表達(dá)大小約為34KDa的目的蛋白,并對(duì)誘導(dǎo)時(shí)間、IPTG濃度進(jìn)行了優(yōu)化。通過(guò)超聲波破碎獲得的包涵體經(jīng)過(guò)鎳柱親和層析后,SDS-PAGE顯示蛋白為單一條帶。純化蛋白經(jīng)過(guò)透析復(fù)性濃縮,以此為免疫原制備鼠抗ZPoIFN-λ3多克隆抗體,經(jīng)Western Blotting鑒定,證明獲得的目的蛋白具有良好的免疫原性。采用細(xì)胞病變抑制法測(cè)定蛋白在MDBK/VSV的活性,結(jié)果顯示pET-32a(+)-mZPoIFN-λ3表達(dá)蛋白在MDBK/VSV系統(tǒng)的抗病毒效價(jià)為10×2~(4.5)IU/0.1mL,比活力為2×10~3IU/mg。3.藏豬IFN-λ3抗豬輪狀病毒活性研究將ZPoIFN-λ3原核表達(dá)產(chǎn)物以0、10、100、1000ng/mL的劑量預(yù)處理IPEC-J2細(xì)胞和MA104細(xì)胞24h后,接種0.1MOI PoRV SC-R株,于接種后36h收集細(xì)胞懸液;蛞100ng/mL的劑量預(yù)處理MA104細(xì)胞24h后,于接種0.1MOI PoRV SC-R株后12h、24h和36h收集細(xì)胞懸液。Q-PCR檢測(cè)樣品中PoRV VP6基因的mRNA水平,結(jié)果顯示不同劑量的原核表達(dá)產(chǎn)物在病毒接種IPEC-J2細(xì)胞和MA104細(xì)胞后均能有效地抑制PoRV SC-R株的增殖,并呈現(xiàn)一定的劑量和時(shí)間依賴,且低濃度的ZPoIFN-λ3(100ng/mL和10ng/mL)在IPEC-J2細(xì)胞的抗PoRV活性顯著強(qiáng)于在MA104細(xì)胞的活性,高濃度(1000ng/mL)則差異不顯著。為了探究ZPoIFN-λ3與豬IFN-α聯(lián)合應(yīng)用能否增強(qiáng)其抗病毒活性,以0、0.1、1、10ng/mL ZPoIFN-λ3或者0、10、100、1000IU/mL豬IFN-α單獨(dú)或者聯(lián)合IFN-α+ZPoIFN-λ3(10IU/mL+0.1ng/mL,100IU/mL+1ng/mL,1000IU/mL+10ng/mL)預(yù)處理IPEC-J2細(xì)胞24h,接種0.01MOI PoRV SC-R株,于接種后36h收集細(xì)胞懸液,反復(fù)凍融三次后,以TCID_(50)測(cè)定病毒滴度。結(jié)果顯示所有劑量二者聯(lián)合應(yīng)用均沒(méi)有ZPoIFN-λ3單獨(dú)應(yīng)用抑制PoRV SC-R株增殖的活性強(qiáng)。為探究其中機(jī)制,相對(duì)熒光定量測(cè)定下游抗病毒蛋白MxA,OASL和ISG15轉(zhuǎn)錄情況,發(fā)現(xiàn)單獨(dú)使用ZPoIFN-λ3誘導(dǎo)的下游抗病毒蛋白轉(zhuǎn)錄均高于二者聯(lián)合應(yīng)用。
【學(xué)位授予單位】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S852.4
【圖文】:

干擾素,Ⅲ型,I型,和信號(hào)


圖 1-1 Ⅲ型干擾素與 I 型干擾素的表達(dá)和信號(hào)通路Figure1-1. General induction and receptor signaling pathways of type I and type III IFNs[23] Ⅲ型干擾素的生物學(xué)功能1 抗病毒功能在最初發(fā)現(xiàn)Ⅲ型干擾素時(shí),研究人員就發(fā)現(xiàn),在不同細(xì)胞分別感染登革熱病毒、泡口炎性病毒或腦心肌炎病毒可以誘導(dǎo)IFN-λ產(chǎn)生[5]。隨后大量報(bào)道稱在多種DNAA 病毒刺激下細(xì)胞能夠產(chǎn)生 IFN-λ,如仙臺(tái)病毒[24]、登革熱病毒[25]、輪狀病毒[26]吸道合胞病毒[27]等。IFN-λ可以誘導(dǎo)多種抗病毒蛋白的表達(dá)。由于Ⅲ型干擾素受體上皮組織和細(xì)胞的大量表達(dá),研究表明Ⅲ型干擾素在粘膜表面發(fā)揮著Ⅰ型干擾素不替代的作用[28-30]。1.1 IFN-λ在呼吸道免疫中的研究呼吸道病毒常感染鼻竇、咽喉和肺臟。感染后主要產(chǎn)生 IFN-λs,而不是 IFN-α。

藏豬,PCR擴(kuò)增,陰性,產(chǎn)物


圖 2-1.藏豬 IFN-λ3 的 PCR 擴(kuò)增PCR amplification of Tibetan IFN-λ3 gA Marker,1:PCR 產(chǎn)物,2:陰性對(duì)NA Marker, 1:PCR product, 2:Negativ-λ3 PCR 鑒定 PCR 擴(kuò)增,擴(kuò)增出與預(yù)期目標(biāo)-2 pMD19-T-ZPoIFN-λ3 的 PCR 鑒定ation of the pMD19-T-ZPoIFN-λ3 gen

核酸序列,PCR鑒定,核酸序列,網(wǎng)站


16圖 2-2 pMD19-T-ZPoIFN-λ3 的 PCR 鑒定ntification of the pMD19-T-ZPoIFN-λ3 gene usDNA Mrker,1-5:PCR 產(chǎn)物,6:陰性對(duì)照M:DNA Marker, 1-5:PCR product, 6:negative序結(jié)果BI 網(wǎng)站進(jìn)行 Blast 比對(duì),其與 GenBank,表明克隆成功,核酸序列如下:TCGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGAGGTGCCTGTCCCTGAAGCCCTCAGGTGGCCCAGTTCAAGTCTCTGTCCCCAAGGATGCCTTTGAAGAGTCCCTCT

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