【摘要】：牦牛(Bos grunniens Linnaeus)是世界珍奇稀有的畜種資源,主要分布在中國的青藏高原及周邊高海拔地區(qū),被譽(yù)為“高原之舟”,是高原農(nóng)牧民飼養(yǎng)的主要畜種之一。在品種分類上有17個地方品種和1個培育品種,但以上品種均未涵蓋分布于新疆的喀喇昆侖-帕米爾高原區(qū)域的牦牛種群,成為牦牛地理分布上未涉及的區(qū)域。為進(jìn)一步闡明該區(qū)域牦牛遺傳多樣性水平及系統(tǒng)進(jìn)化地位。本文以分布于喀喇昆侖-帕米爾高原區(qū)域牦牛為研究對象,采用PCR直接測序和生物信息學(xué)分析方法對mtDNA D-loop和mtDNA Cytb全序列進(jìn)行遺傳多樣性分析,利用GenBank提交的牦牛mtDNA D-loop序列分析喀喇昆侖-帕米爾高原區(qū)域牦牛的系統(tǒng)進(jìn)化地位,以及mtDNA Cytb全序列與GenBank中牦牛和牛屬10個近緣物種進(jìn)行比較分析。主要研究結(jié)果如下:1.喀喇昆侖-帕米爾高原牦牛群體mtDNA D-loop序列全長為890-895bp,其中T、C、A和G 4種堿基的平均含量分別為28.7%、25.2%、32.5%和13.6%,A+T含量(61.2%)高于G+C含量(38.8%),說明牦牛mtDNA D-loop區(qū)富含A+T,符合哺乳動物線粒體mtDNA D-loop區(qū)堿基組成存在偏倚性的特點(diǎn)。156個喀喇昆侖-帕米爾高原牦牛個體中分析共檢測出63個多態(tài)位點(diǎn)界定了44個單倍型,其中單倍型多樣性0.806、核苷酸多樣性0.01528,說明喀喇昆侖-帕米爾高原牦牛具有豐富的遺傳多樣性;構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹和Network網(wǎng)絡(luò)關(guān)系表明喀喇昆侖-帕米爾高原區(qū)域牦牛具有兩個母系起源。2.利用GenBank數(shù)據(jù)庫中下載mtDNA D-loop序列與本研究獲得序列mtDNA D-loop構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,結(jié)果表明140種單倍型被聚類成兩大分支,兩大分支共形成了五個小分支(A-F);家牦牛mtDNA D-loop序列由兩個分支較遠(yuǎn)的進(jìn)化支系組成,表明中國牦牛擁有兩個母系起源。各分支中未發(fā)現(xiàn)家牦牛種群與地理分布格局的相關(guān)性;喀喇昆侖-帕米爾高原牦牛與其他牦牛品種共享情況較少,在分支C中喀喇昆侖-帕米爾高原牦牛群體所占比例較大且與野牦牛共享,說明喀喇昆侖-帕米爾高原牦牛群體較獨(dú)特,喀喇昆侖-帕米爾高原地區(qū)牦牛可能起源于野牦牛。3.利用本研究獲得的110個喀喇昆侖-帕米爾高原地區(qū)牦牛和下載的82條牦牛mtDNA Cytb序列,與牛亞科代表物種42條序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,結(jié)果顯示:牦牛首先和美洲野牛聚類,形成的分支與歐洲野牛聚類,再與印度野牛、大額牛、林牛、爪哇野牛及普通牛與原牛、瘤牛形成的分支聚為一類,最后和水牛屬相聚;表明牦牛與美洲野牛起源關(guān)系較近,與普通牛起源關(guān)系較遠(yuǎn)。
【學(xué)位授予單位】：喀什大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2019
【分類號】：S823.85

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

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2 戚文華;蔣雪梅;杜聯(lián)明;肖國生;;牦牛和水牛全基因組微衛(wèi)星分布規(guī)律及其比較分析[J];基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué);2015年07期

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本文編號：2796734