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高脂對(duì)小鼠肝臟基因RNA甲基化的影響

發(fā)布時(shí)間:2020-08-15 20:31
【摘要】:為了滿足人們對(duì)動(dòng)物性蛋白質(zhì)的高需求,提高豬的瘦肉率、降低皮下脂肪積累成為生產(chǎn)者的重要任務(wù);同時(shí),為了保證肉品質(zhì),又需要在肌肉中沉積適當(dāng)?shù)闹。脂肪代謝在其中發(fā)揮了關(guān)鍵的作用。在分子水平上研究脂肪代謝的基因表達(dá)調(diào)控可以為解決以上問(wèn)題提供理論基礎(chǔ)。肝臟是脂肪代謝的重要場(chǎng)所,肝臟脂肪代謝相關(guān)基因表達(dá)調(diào)控的紊亂可導(dǎo)致諸如脂肪沉積、高血糖等病變,誘發(fā)非酒精性脂肪肝等嚴(yán)重疾病。m6A甲基化可對(duì)基因表達(dá)產(chǎn)生重要影響。研究表明m6A甲基化與脂肪代謝調(diào)控密切相關(guān),而小鼠高脂營(yíng)養(yǎng)誘導(dǎo)的脂肪肝的m6A甲基化修飾圖譜尚未有研究報(bào)道。另外,m6A甲基化可介導(dǎo)RNA的翻譯調(diào)控,有證據(jù)表明,翻譯調(diào)控占整個(gè)基因表達(dá)調(diào)控幅度的一半以上。故本研究使用小鼠肝臟作為模型,利用MeRIP-seq和RNC-seq,探究高脂營(yíng)養(yǎng)條件對(duì)小鼠肝臟的m6A甲基化模式和正在翻譯的mRNA的影響,試圖找出與肝臟脂肪代謝調(diào)控相關(guān)的重要靶點(diǎn)。結(jié)果顯示,相比于對(duì)照組,高脂組的小鼠肝臟顯示出了 m6A甲基化模式的改變,甲基化差異基因在脂質(zhì)代謝、翻譯等相關(guān)重要生物學(xué)過(guò)程中顯著富集。差異表達(dá)的RNC-mRNA在晝夜節(jié)律、脂質(zhì)代謝等重要生物學(xué)過(guò)程中顯著富集。這些甲基化差異基因和差異表達(dá)的RNC-mRNA編碼基因可作為候選基因,為下一步的研究奠定基礎(chǔ)。
【學(xué)位授予單位】:廣西大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:S816;Q75
【圖文】:

抗體,轉(zhuǎn)錄組,位點(diǎn),生物信息學(xué)分析


接著與m6A抗體進(jìn)行解育,m6A抗體便在mRNA上的m6A位點(diǎn)與mRNA結(jié)合逡逑在了一起,然后將含有m6A位點(diǎn)的mRNA富集出來(lái),構(gòu)建cDNA文庫(kù),最后進(jìn)行高通逡逑量測(cè)序。其原理簡(jiǎn)圖如圖1-1[31】所示。經(jīng)過(guò)與參考基因組比對(duì)等相關(guān)生物信息學(xué)分析,逡逑最后可以得到全轉(zhuǎn)錄組水平的m6A修飾圖譜。不過(guò)這種方法只能達(dá)到100邋m左右的分逡逑辨率,無(wú)法達(dá)到單堿基分辨率的要求,即無(wú)法檢測(cè)出單個(gè)堿基上的m6A的具體位置。逡逑3逡逑

核糖體,操作步驟,測(cè)序,過(guò)程


序稱為RNC-seq,由于與核糖體足跡測(cè)序(ribosome邋profiling,Ribo-seq)相比,可以測(cè)逡逑到全長(zhǎng)的正在翻譯的mRNA,所以又叫全長(zhǎng)翻譯組測(cè)序。RNC-seq與RNA-seq相比,逡逑操作步驟只是多了一步提。遥危茫恚遥危恋倪^(guò)程,如圖1-2[99]所示。逡逑8逡逑

高脂,血糖濃度,小鼠,對(duì)照組


3.邋1高脂飼養(yǎng)對(duì)小鼠血糖濃度和肝臟甘油三酯水平的影響逡逑經(jīng)過(guò)8周的飼養(yǎng),對(duì)照組和高脂組小鼠的血糖濃度呈現(xiàn)出顯著的差異(p<邋0.05),逡逑高脂組相比對(duì)照組血糖濃度上升約1.5倍(見(jiàn)圖3-1),表明高脂飼喂對(duì)小鼠血糖代謝逡逑具有顯著的影響。對(duì)小鼠肝臟冰凍切片的油紅0染色結(jié)果顯示,高脂組小鼠肝臟細(xì)胞積逡逑累了大量脂肪(見(jiàn)圖3-2邋A)。對(duì)肝臟甘油三酯含量的測(cè)定顯示,高脂組小鼠肝臟甘油三酯逡逑水平相比對(duì)照組提升約4倍(見(jiàn)圖3-2邋B),說(shuō)明肝臟脂肪大量沉積。逡逑2.0i逡逑S邐*逡逑iilil逡逑CK邐HFD逡逑圖3-1喂養(yǎng)8周后對(duì)照組和高脂組小鼠的相對(duì)血糖濃度逡逑注:CK,對(duì)照組;HFD,高脂組。*表示p<0.05。逡逑Figure邋3-1邋Relative邋blood邋glucose邋levels邋in邋mice邋after邋8邋weeks邋of邋feeding邋of邋normal邋chow邋or邋an邋HFD逡逑Note:邋CK,邋control邋group;邋HFD,邋high-fat邋diet邋group.邋*p邋<邋0.05.逡逑19逡逑

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前7條

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本文編號(hào):2794607

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