高脂對小鼠肝臟基因RNA甲基化的影響
發(fā)布時間:2020-08-15 20:31
【摘要】:為了滿足人們對動物性蛋白質的高需求,提高豬的瘦肉率、降低皮下脂肪積累成為生產者的重要任務;同時,為了保證肉品質,又需要在肌肉中沉積適當的脂肪。脂肪代謝在其中發(fā)揮了關鍵的作用。在分子水平上研究脂肪代謝的基因表達調控可以為解決以上問題提供理論基礎。肝臟是脂肪代謝的重要場所,肝臟脂肪代謝相關基因表達調控的紊亂可導致諸如脂肪沉積、高血糖等病變,誘發(fā)非酒精性脂肪肝等嚴重疾病。m6A甲基化可對基因表達產生重要影響。研究表明m6A甲基化與脂肪代謝調控密切相關,而小鼠高脂營養(yǎng)誘導的脂肪肝的m6A甲基化修飾圖譜尚未有研究報道。另外,m6A甲基化可介導RNA的翻譯調控,有證據表明,翻譯調控占整個基因表達調控幅度的一半以上。故本研究使用小鼠肝臟作為模型,利用MeRIP-seq和RNC-seq,探究高脂營養(yǎng)條件對小鼠肝臟的m6A甲基化模式和正在翻譯的mRNA的影響,試圖找出與肝臟脂肪代謝調控相關的重要靶點。結果顯示,相比于對照組,高脂組的小鼠肝臟顯示出了 m6A甲基化模式的改變,甲基化差異基因在脂質代謝、翻譯等相關重要生物學過程中顯著富集。差異表達的RNC-mRNA在晝夜節(jié)律、脂質代謝等重要生物學過程中顯著富集。這些甲基化差異基因和差異表達的RNC-mRNA編碼基因可作為候選基因,為下一步的研究奠定基礎。
【學位授予單位】:廣西大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:S816;Q75
【圖文】:
接著與m6A抗體進行解育,m6A抗體便在mRNA上的m6A位點與mRNA結合逡逑在了一起,然后將含有m6A位點的mRNA富集出來,構建cDNA文庫,最后進行高通逡逑量測序。其原理簡圖如圖1-1[31】所示。經過與參考基因組比對等相關生物信息學分析,逡逑最后可以得到全轉錄組水平的m6A修飾圖譜。不過這種方法只能達到100邋m左右的分逡逑辨率,無法達到單堿基分辨率的要求,即無法檢測出單個堿基上的m6A的具體位置。逡逑3逡逑
序稱為RNC-seq,由于與核糖體足跡測序(ribosome邋profiling,Ribo-seq)相比,可以測逡逑到全長的正在翻譯的mRNA,所以又叫全長翻譯組測序。RNC-seq與RNA-seq相比,逡逑操作步驟只是多了一步提。遥危茫恚遥危恋倪^程,如圖1-2[99]所示。逡逑8逡逑
3.邋1高脂飼養(yǎng)對小鼠血糖濃度和肝臟甘油三酯水平的影響逡逑經過8周的飼養(yǎng),對照組和高脂組小鼠的血糖濃度呈現出顯著的差異(p<邋0.05),逡逑高脂組相比對照組血糖濃度上升約1.5倍(見圖3-1),表明高脂飼喂對小鼠血糖代謝逡逑具有顯著的影響。對小鼠肝臟冰凍切片的油紅0染色結果顯示,高脂組小鼠肝臟細胞積逡逑累了大量脂肪(見圖3-2邋A)。對肝臟甘油三酯含量的測定顯示,高脂組小鼠肝臟甘油三酯逡逑水平相比對照組提升約4倍(見圖3-2邋B),說明肝臟脂肪大量沉積。逡逑2.0i逡逑S邐*逡逑iilil逡逑CK邐HFD逡逑圖3-1喂養(yǎng)8周后對照組和高脂組小鼠的相對血糖濃度逡逑注:CK,對照組;HFD,高脂組。*表示p<0.05。逡逑Figure邋3-1邋Relative邋blood邋glucose邋levels邋in邋mice邋after邋8邋weeks邋of邋feeding邋of邋normal邋chow邋or邋an邋HFD逡逑Note:邋CK,邋control邋group;邋HFD,邋high-fat邋diet邋group.邋*p邋<邋0.05.逡逑19逡逑
本文編號:2794607
【學位授予單位】:廣西大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:S816;Q75
【圖文】:
接著與m6A抗體進行解育,m6A抗體便在mRNA上的m6A位點與mRNA結合逡逑在了一起,然后將含有m6A位點的mRNA富集出來,構建cDNA文庫,最后進行高通逡逑量測序。其原理簡圖如圖1-1[31】所示。經過與參考基因組比對等相關生物信息學分析,逡逑最后可以得到全轉錄組水平的m6A修飾圖譜。不過這種方法只能達到100邋m左右的分逡逑辨率,無法達到單堿基分辨率的要求,即無法檢測出單個堿基上的m6A的具體位置。逡逑3逡逑
序稱為RNC-seq,由于與核糖體足跡測序(ribosome邋profiling,Ribo-seq)相比,可以測逡逑到全長的正在翻譯的mRNA,所以又叫全長翻譯組測序。RNC-seq與RNA-seq相比,逡逑操作步驟只是多了一步提。遥危茫恚遥危恋倪^程,如圖1-2[99]所示。逡逑8逡逑
3.邋1高脂飼養(yǎng)對小鼠血糖濃度和肝臟甘油三酯水平的影響逡逑經過8周的飼養(yǎng),對照組和高脂組小鼠的血糖濃度呈現出顯著的差異(p<邋0.05),逡逑高脂組相比對照組血糖濃度上升約1.5倍(見圖3-1),表明高脂飼喂對小鼠血糖代謝逡逑具有顯著的影響。對小鼠肝臟冰凍切片的油紅0染色結果顯示,高脂組小鼠肝臟細胞積逡逑累了大量脂肪(見圖3-2邋A)。對肝臟甘油三酯含量的測定顯示,高脂組小鼠肝臟甘油三酯逡逑水平相比對照組提升約4倍(見圖3-2邋B),說明肝臟脂肪大量沉積。逡逑2.0i逡逑S邐*逡逑iilil逡逑CK邐HFD逡逑圖3-1喂養(yǎng)8周后對照組和高脂組小鼠的相對血糖濃度逡逑注:CK,對照組;HFD,高脂組。*表示p<0.05。逡逑Figure邋3-1邋Relative邋blood邋glucose邋levels邋in邋mice邋after邋8邋weeks邋of邋feeding邋of邋normal邋chow邋or邋an邋HFD逡逑Note:邋CK,邋control邋group;邋HFD,邋high-fat邋diet邋group.邋*p邋<邋0.05.逡逑19逡逑
【參考文獻】
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本文編號:2794607
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