本文關(guān)鍵詞：利用mtDNA D-Loop序列多態(tài)性挖掘四川綿羊遺傳資源，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：為了確定在四川發(fā)現(xiàn)的兩個綿羊群體,即布拖類群、賈洛類群,是否為新的遺傳資源,本研究從四川省涼山州、阿壩州采集了布拖類群、涼山半細毛羊、涼山本地類群、賈洛類群、紅原本地類群、薩�？速Z洛雜交類群6個群體的組織樣,利用綿羊線粒體DNA D-Loop區(qū)多態(tài)性,分析6個群體的起源和遺傳多樣性。同時合并分析從GenBank上下載的68條家綿羊線粒體DNA D-Loop區(qū)序列,構(gòu)建了全部序列的系統(tǒng)發(fā)育樹,最后對6個綿羊群體進行了單倍型的網(wǎng)絡(luò)分析及群體擴張分析,核苷酸不配對分布分析和中性檢驗。研究結(jié)果如下：1.測定的6個綿羊群體286只個體的mtDNA D-loop區(qū)序列長度劃分為8種類型,即1106bp、1179bp、1180bp、181bp、1182bp、1183bp、1184bp、1256 bp,1181bp所占比例(79.6%)最大。其中,在布拖類群中,未發(fā)現(xiàn)1106bp長度,且布拖類群mtDNA D-loop區(qū)長度類型比較少,只有3種長度,即1180bp、1181bp、1182bp,說明布拖類群D-Loop長度變異少；在賈洛類群中發(fā)現(xiàn)了3個1256bp長度的D-Loop,在其他5個類群中,只有薩福克賈洛雜家類群發(fā)現(xiàn)1個1256bp長度的D-Loop,說明1256bp可能為賈洛類群所獨有。本試驗所獲得的286條綿羊mtDNA D-loop序列,共發(fā)現(xiàn)210個變異位點,其中單一多態(tài)位點有43個,簡約信息位點有167個。從堿基組成上來看,A+T含量(62.693%)明顯高于G+C含量(37.324%),除了缺失和插入位點外,發(fā)生轉(zhuǎn)換192次,顛換18次,其中7個位點同時發(fā)生轉(zhuǎn)換和顛換,變異主要以轉(zhuǎn)換為主,說明綿羊mtDNA D-loop區(qū)序列具有轉(zhuǎn)換偏倚性。在6個綿羊群體中,布拖類群G+C含量最低,為37.108%,賈洛類群A+T含量最高,為62.902%,序列堿基組成沒有明顯的差異,其中均以A、T含量占優(yōu)勢,說明了綿羊mtDNA D-loop為A、T富集區(qū)。2.6個群體共發(fā)現(xiàn)了133種單倍型,其中有51個單倍型是群體間與群體內(nèi)共享單倍型,其余82個均為群體特有單倍型。在布拖類群內(nèi),只有11種單倍型,為單倍型最少的群體,286條序列的核苷酸多樣度平均為0.01724,單倍型多樣度平均為0.9843,6個群體的核苷酸多樣度變異范圍為0.01099-0.02114,單倍型多樣性變異范圍為0.780～0.995,單倍型多樣性最低和最高的群體分別是布拖類群和賈洛類群。研究結(jié)果說明,布拖類群綿羊的遺傳多樣性較為貧乏,需要對其種質(zhì)資源進行合理的保護；賈洛類群遺傳多樣性豐富,從遺傳多樣性角度揭示了培育賈洛綿羊具有很好的前景。3.6個綿羊群體間的遺傳距離為0.014-0.023。薩�？速Z洛雜交類群與涼山半細毛羊以及薩福克賈洛雜交類群與賈洛類群之間的遺傳距離較小,為0.014；紅原本地類群與布拖類群的遺傳距離最遠,為0.023。6個綿羊群體聚類關(guān)系圖表明,布拖類群與其他5個群體的遺傳距離都比較遠,單獨聚為一類,可以判斷布拖類群為本地一個獨立的群體；而賈洛類群與同處于阿壩州的紅原本地類群的遺傳距離為0.018,這兩個群體的遺傳分化程度也比較明顯,故也可以看作一個相對獨立的群體�？傊�,布拖類群和賈洛類群與其他類群之間沒有明顯的遺傳地理結(jié)構(gòu)。4.利用MEGA6.0軟件對286條序列構(gòu)建了系統(tǒng)發(fā)育樹,結(jié)果顯示這些序列分為三個分支,同時,利用從GenBank上下載的6條野綿羊序列和62條家綿羊序列作為對照進行分析,結(jié)果表明,摩佛倫羊聚在B支系中,布拖類群出現(xiàn)在A、B2個分支中,賈洛類群在3個分支中都有分布,從而可以推測出,布拖類群有兩個野綿羊始祖進化而來,賈洛類群有三個,而摩佛倫羊為布拖類群和賈洛類群的共同始祖之一。毖蠔團萄虻ザ讕畚煥

本文編號：279174