【摘要】：為了分析深縣豬保種群的保種效果,為深縣豬及其同類地方豬群體保種方案的制定與調(diào)整提供理論依據(jù),采用分層隨機(jī)抽樣的方法采集深縣豬1-4世代的耳組織樣164份,用線粒體基因組中進(jìn)化速度較快的5個(gè)基因?yàn)闃?biāo)記和核基因組中27個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)兩種分子標(biāo)記對(duì)線粒體基因組和核基因組這兩套遺傳物質(zhì)進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果如下:1.微衛(wèi)星分子標(biāo)記的監(jiān)測(cè)結(jié)果顯示,各世代的平均有效等位基因數(shù)在3.8681-4.1910之間,平均多態(tài)信息含量在0.5932-0.6545之間,平均期望雜合度在0.6497-0.6909之間,平均固定指數(shù)0.5043-0.5215。隨著世代的更替,四個(gè)世代保種群的等位基因數(shù)逐代上升,保種的過(guò)程中未發(fā)現(xiàn)等位基因在傳遞過(guò)程中全部丟失的情況,各個(gè)世代的PIC值都高于0.5,可見(jiàn)整個(gè)種群呈現(xiàn)出高度多態(tài),分析可以看出世代與世代間平均PIC值相差不大,這證明深縣豬在保種過(guò)程中保持了穩(wěn)定的多樣性;4個(gè)世代雖然出現(xiàn)了近交現(xiàn)象,但近交程度沒(méi)有出現(xiàn)升高的趨勢(shì)。2.在深縣豬mtDNA 5個(gè)基因4個(gè)世代群體的120條序列中,共檢測(cè)出32種單倍型、27個(gè)變異位點(diǎn),其中轉(zhuǎn)換6次,顛換11次,顛換次數(shù)明顯高于轉(zhuǎn)換,說(shuō)明深縣豬群體有較強(qiáng)的偏倚性。深縣豬1、2、3和4世代mtDNA 5個(gè)基因平均單倍型樣度(HD)在0.3088-0.3794之間,平均核苷酸差異數(shù)(K)在0.3778-0.6467之間,核苷酸多樣度(Pi)在0.000306-0.000452之間。群體內(nèi)的平均單倍型多樣性和核苷酸多樣性在4個(gè)世代的變化保持穩(wěn)定。4個(gè)世代均采用Tajima’s D值進(jìn)行中性檢驗(yàn),經(jīng)檢驗(yàn)均不顯著,符合中性突變。說(shuō)明深縣豬在世代傳遞過(guò)程中群體大小穩(wěn)定,且保持了遺傳多樣性的穩(wěn)定。3.對(duì)比兩種遺傳標(biāo)記對(duì)深縣豬遺傳多樣性檢測(cè)結(jié)果,并與其他品種相比,深縣豬核基因組的遺傳多樣性豐富,但線粒體DNA遺傳多樣性貧乏。證明深縣豬恢復(fù)群體在起始世代有較好的遺傳多樣性,但母系來(lái)源較狹窄。父系血緣較豐富,對(duì)該群體遺傳多樣性具有重要貢獻(xiàn)。4.在深縣豬mtDNA CytB基因全序列NJ進(jìn)化樹(shù)中,深縣豬三種單倍型聚為同一分支,母系來(lái)源單一,與萊蕪豬、大蒲蓮豬等山東品種遺傳距離較近。由上述結(jié)果可得出如下結(jié)論:兩種分子標(biāo)記結(jié)果均顯示深縣豬在世代的遺傳過(guò)程中群體數(shù)量保持穩(wěn)定,遺傳多樣性處于平穩(wěn)的水平,保種起到了良好的效果。
【學(xué)位授予單位】：河北農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2019
【分類號(hào)】：S828
【圖文】：

部分耳組織的DNA檢測(cè)結(jié)果

PCR擴(kuò)增結(jié)果

S0225聚丙烯胺凝膠電泳檢測(cè)結(jié)果

【參考文獻(xiàn)】

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1 權(quán)金強(qiáng);茍瀟;趙生國(guó);;云南地方豬種mtDNA D-loop區(qū)遺傳多樣性研究[J];四川農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);2015年04期

2 肖煒;王騰;李大宇;鄒芝英;祝t熈

本文編號(hào)：2784520