天堂国产午夜亚洲专区-少妇人妻综合久久蜜臀-国产成人户外露出视频在线-国产91传媒一区二区三区

牦牛脂肪分化相關(guān)miRNAs的篩

發(fā)布時(shí)間:2017-03-30 14:14

  本文關(guān)鍵詞:牦牛脂肪分化相關(guān)miRNAs的篩選、表達(dá)及其靶基因分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:牦牛主要分布在青藏高原及其毗鄰的高海拔區(qū)域,是當(dāng)?shù)啬撩竦闹饕馐硜?lái)源。特殊的環(huán)境和飼養(yǎng)方式形成了獨(dú)特的肉品質(zhì),也造成了牦牛夏壯、春乏的生長(zhǎng)規(guī)律,而脂肪分化對(duì)于脂肪的形成具有重要影響,脂肪細(xì)胞分化進(jìn)程由多個(gè)信號(hào)通路參與復(fù)雜生物過(guò)程,miRNA對(duì)于脂肪分化也有不同程度的調(diào)節(jié),但具體的調(diào)控機(jī)制至今尚不明確。為更好的解析牦牛脂肪分化的調(diào)控機(jī)制,本論文運(yùn)用生物信息學(xué)方法預(yù)測(cè)出牦牛脂肪分化相關(guān)候選miRNAs,并分析候選miRNAs的組織間表達(dá)差異,運(yùn)用TargetScan和STRING在線(xiàn)軟件篩選出候選miRNAs的相應(yīng)靶基因并對(duì)其進(jìn)行功能分析,采用雙熒光素酶報(bào)告基因系統(tǒng)對(duì)得到的候選靶基因進(jìn)行驗(yàn)證,主要結(jié)果如下:1.牦牛脂肪分化相關(guān)miRNAs的篩選首先找出可能調(diào)控普通牛脂肪分化的miRNAs,將其同牦牛核苷酸序列進(jìn)行blast比對(duì),運(yùn)用Mfold預(yù)測(cè)所得pre-miRNA的二級(jí)結(jié)構(gòu),得到bta-miR-2340、 bta-miR-1260b、bta-miR-22-5p、bta-miR-2328-3p、bta-miR-1777b和bta-miR-1388-5p共5個(gè)miRNAs可能參與牦牛脂肪分化調(diào)控。2.候選miRNAs組織間差異表達(dá)分析對(duì)預(yù)測(cè)得到的5個(gè)miRNAs基于心、脾、肺、腎、背最長(zhǎng)肌和皮下脂肪6個(gè)組織進(jìn)行表達(dá)差異分析。結(jié)果顯示,脂肪組織,肝臟組織和胰臟組織作為脂質(zhì)代謝的主要組織,bta-miR-2328-3p、bta-miR-1388-5p和bta-miR-22-5p相較其他組織在脂肪組織中表達(dá)量均較低,可能主要參與其他調(diào)節(jié)并非調(diào)控脂肪分化;而bta-miR-2340、bta-miR-1777b和bta-miR-1260b在脂肪組織中表達(dá)量相對(duì)較高,可能參與調(diào)控脂肪分化過(guò)程。3.候選miRNAs靶基因的預(yù)測(cè)和功能分析運(yùn)用TargetScan對(duì)篩選得到的miRNA包括bta-miR-2340、bta-miR-1777b和bta-miR-1260b進(jìn)行相應(yīng)靶基因的預(yù)測(cè)。bta-miR-2340和bta-miR-1777b分別預(yù)測(cè)得到131和49個(gè)靶基因,而bta-miR-1260b無(wú)預(yù)測(cè)結(jié)果。使用STRING在線(xiàn)軟件對(duì)bta-miR-2340靶基因進(jìn)行功能分析,候選靶基因BAD、CHRM1、IRAK1、 SOCS3和FOXO4主要參與脂肪分化相關(guān)信號(hào)通路,推測(cè)上述基因可能為bta-miR-2340的靶基因。4. bta-miR-2340候選靶基因的組織間差異表達(dá)分析運(yùn)用RT-PCR對(duì)bta-miR-2340候選靶基因進(jìn)行心、脾、肺、腎、背最長(zhǎng)肌和皮下脂肪組織的表達(dá)差異分析,結(jié)果顯示BAD和IRAK1整體表達(dá)量較高。其中BAD在心中高豐度表達(dá),脂肪中次之。CHRM1同在脂肪中相比腎中表達(dá)量較高。IRAKI在心和脾中表達(dá)量高,其他組織較低。SOCS3在肺和脂肪中表達(dá)量較高。FOXO4心和背肌組織中表達(dá)量較高,其他組織均較低。但CHRM1和FOXO4整體表達(dá)均很低。5. bta-miR-2340靶基因的驗(yàn)證采用雙熒光素酶報(bào)告基因系統(tǒng)對(duì)bta-miR-2340靶基因進(jìn)行驗(yàn)證。分別構(gòu)建BAD、CHRM1、IRAK1、SOCS3和FOXO4與psiCHECK-2載體的重組質(zhì)粒,并在bta-miR-2340 mimics和脂質(zhì)體2000存在的條件下轉(zhuǎn)染到Hela細(xì)胞。與對(duì)照組相比最終結(jié)果顯示bta-miR-2340 mimics可降低BAD突變型活性,對(duì)于CHRM1、IRAK1、SOCS3和FOXO4突變型均無(wú)任何影響,對(duì)于CHRM1野生型也無(wú)任何影響,然而可增加IRAKI和FOXO4野生型熒光活性,只有SOCS3野生型熒光活性下降且突變組熒光活性無(wú)影響,但只下降20%不符合前人所述30%,推測(cè)bta-miR-2340可能均不作用于以上位點(diǎn)。
【關(guān)鍵詞】:牦牛 脂肪分化 miRNAs 靶基因 差異表達(dá)
【學(xué)位授予單位】:西北民族大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類(lèi)號(hào)】:S823.85
【目錄】:
  • 摘要5-7
  • abstract7-9
  • 縮略詞表9-13
  • 第1章 文獻(xiàn)綜述13-27
  • 1.1 脂肪細(xì)胞分化概述13-22
  • 1.1.1 脂肪細(xì)胞分化過(guò)程13
  • 1.1.2 脂肪組織分類(lèi)13-14
  • 1.1.3 調(diào)控脂肪分化的主要信號(hào)通路14-17
  • 1.1.3.1 Wnt/β-catenin信號(hào)通路14-15
  • 1.1.3.2 TGF-β信號(hào)通路15-16
  • 1.1.3.3 MAPK信號(hào)通路16
  • 1.1.3.4 FGF信號(hào)通路16-17
  • 1.1.3.5 Hedgehog信號(hào)通路17
  • 1.1.3.6 胰島素/IGF1信號(hào)通路17
  • 1.1.4 調(diào)控脂肪分化的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子17-20
  • 1.1.4.1 PPARs17-19
  • 1.1.4.2 C/EBPs家族19
  • 1.1.4.3 SREBP家族19-20
  • 1.1.5 調(diào)控脂肪組織和肌內(nèi)脂肪代謝關(guān)鍵基因研究進(jìn)展20-22
  • 1.1.5.1 LPL21
  • 1.1.5.2 LRP621
  • 1.1.5.3 AP221-22
  • 1.1.5.4 FAS22
  • 1.1.5.5 SOCS322
  • 1.2 miRNA的研究進(jìn)展22-26
  • 1.2.1 miRNA的發(fā)現(xiàn)及形成機(jī)制22-23
  • 1.2.2 動(dòng)物miRNA的作用機(jī)制23-24
  • 1.2.3 miRNA的鑒定方法24-25
  • 1.2.3.1 直接克隆法24
  • 1.2.3.2 生物信息學(xué)法24-25
  • 1.2.3.3 其他方法25
  • 1.2.4 調(diào)控脂肪分化miRNA的研究進(jìn)展25-26
  • 1.3 本研究的目的及意義26-27
  • 第2章 牦牛脂肪分化相關(guān)miRNA的預(yù)測(cè)與表達(dá)分析27-39
  • 2.1 實(shí)驗(yàn)材料27-28
  • 2.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物樣品采集27
  • 2.1.2 主要儀器設(shè)備27
  • 2.1.3 主要試劑27
  • 2.1.4 數(shù)據(jù)采集27-28
  • 2.2 實(shí)驗(yàn)方法28-31
  • 2.2.1 miRNA生物信息學(xué)預(yù)測(cè)28
  • 2.2.2 組織總RNA提取28-29
  • 2.2.3 引物設(shè)計(jì)29
  • 2.2.4 RNA反轉(zhuǎn)錄29-30
  • 2.2.5 PCR分析30
  • 2.2.6 RT-PCR分析30-31
  • 2.3 結(jié)果和分析31-35
  • 2.3.1 候選牦牛與脂肪分化相關(guān)miRNA31-34
  • 2.3.2 牦牛各組織總RNA提取結(jié)果34
  • 2.3.3 候選miRNA的RT-PCR分析34-35
  • 2.4 討論35-38
  • 2.5 小結(jié)38-39
  • 第3章 牦牛miRNA靶基因的預(yù)測(cè)、功能及表達(dá)分析39-45
  • 3.1 實(shí)驗(yàn)材料39
  • 3.1.1 主要軟件39
  • 3.1.2 主要儀器設(shè)備及試劑39
  • 3.2 實(shí)驗(yàn)方法39-40
  • 3.2.1 miRNA靶基因預(yù)測(cè)及功能分析39
  • 3.2.2 miRNA靶基因表達(dá)引物設(shè)計(jì)39
  • 3.2.3 cDNA合成及實(shí)時(shí)熒光定量PCR39-40
  • 3.3 結(jié)果和分析40-43
  • 3.3.1 miRNA靶基因預(yù)測(cè)和功能分析40-42
  • 3.3.2 miRNA候選靶基因RT-PCR分析42-43
  • 3.4 討論43-44
  • 3.5 小結(jié)44-45
  • 第4章 bta-miR-2340靶基因的驗(yàn)證45-53
  • 4.1 實(shí)驗(yàn)材料45
  • 4.1.1 主要試劑與儀器45
  • 4.2 實(shí)驗(yàn)方法45-49
  • 4.2.1 靶基因克隆和載體構(gòu)建引物設(shè)計(jì)45-46
  • 4.2.2 靶位點(diǎn)PCR擴(kuò)增和回收46
  • 4.2.3 T克隆測(cè)序46-48
  • 4.2.4 雙酶切和重組載體構(gòu)建48
  • 4.2.5 Hela細(xì)胞的培養(yǎng)48-49
  • 4.2.6 細(xì)胞轉(zhuǎn)染49
  • 4.2.7 雙熒光素酶報(bào)告系統(tǒng)檢測(cè)49
  • 4.3 結(jié)果和分析49-51
  • 4.3.1 野生型和突變型質(zhì)粒構(gòu)建50
  • 4.3.2 雙熒光素酶報(bào)告系統(tǒng)檢測(cè)50-51
  • 4.4 討論51-52
  • 4.5 結(jié)論52-53
  • 結(jié)論53
  • 創(chuàng)新點(diǎn)53
  • 進(jìn)一步研究?jī)?nèi)容53-54
  • 參考文獻(xiàn)54-65
  • 致謝65

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 ;Small but influential:the role of microRNAs on gene regulatory network and 3′UTR evolution[J];遺傳學(xué)報(bào);2009年01期

2 B.SAILAJA;S.R.VOLETI;D.SUBRAHMANYAM;N.SARLA;V.VISHNU PRASANTH;V.P.BHADANA;S.K.MANGRAUTHIA;;Prediction and Expression Analysis of miRNAs Associated with Heat Stress in Oryza sativa[J];Rice Science;2014年01期

3 羅書(shū)芳;崔浪軍;王健;屈生憲;;干旱脅迫下15種丹參miRNAs差異表達(dá)分析[J];廣東農(nóng)業(yè)科學(xué);2013年05期

4 郝力力;李必富;;應(yīng)用熒光定量PCR對(duì)細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)miRNAs在蟲(chóng)體不同發(fā)育階段表達(dá)量的研究[J];中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào);2012年26期

5 Liming Ma;Lianghu Qu;;The Function of MicroRNAs in Renal Development and Pathophysiology[J];遺傳學(xué)報(bào);2013年04期

6 Gang Wu;;Plant MicroRNAs and Development[J];Journal of Genetics and Genomics;2013年05期

7 Xiang-Shun Cui;Xing-Hui Shen;Shao-Chen Sun;Sun-Wha Cho;Young-Tae Heo;Yong-Kook Kang;Teruhiko Wakayama;Nam-Hyung Kim;;Identifying MicroRNA and mRNA Expression Profiles in Embryonic Stem Cells Derived from Parthenogenetic,Androgenetic and Fertilized Blastocysts[J];遺傳學(xué)報(bào);2013年04期

8 葉瑞松;習(xí)欠云;束剛;王麗娜;王松波;朱曉彤;高萍;江青艷;張永亮;;GnRH引起豬垂體細(xì)胞miRNAs表達(dá)譜變化[J];畜牧與獸醫(yī);2012年S1期

9 陶新;徐子偉;;miRNAs對(duì)腸道健康的調(diào)控作用及機(jī)理[J];動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)學(xué)報(bào);2013年09期

10 郝力力;李銳;李必富;;細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)miRNAs的鑒定及分析[J];浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào);2012年04期

中國(guó)重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 ;A potential role for Chlamydomonas miRNAs in response to environmental changes[A];中國(guó)遺傳學(xué)會(huì)植物遺傳和基因組學(xué)專(zhuān)業(yè)委員會(huì)2009年學(xué)術(shù)研討會(huì)論文摘要匯編[C];2009年

2 Ping Xuan;Maozu Guo;Yangchao Huang;;MaturePred:Efficient Identification of MicroRNAs within Novel Plant Pre-miRNAs[A];第五屆全國(guó)生物信息學(xué)與系統(tǒng)生物學(xué)學(xué)術(shù)大會(huì)論文集[C];2012年

3 Zhen-Dong Xiao;Li-Ting Diao;Jian-Hua Yang;Hui Xu;Mian-Bo Huang;Yong-Jin Deng;Hui Zhou;Liang-Hu Qu;;Systematical identification of cis-elements orchestrating the expressions of miRNAs in humans[A];生命的分子機(jī)器及其調(diào)控網(wǎng)絡(luò)——2012年全國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)學(xué)術(shù)大會(huì)摘要集[C];2012年

4 ;Cell-free miRNAs may indicate diagnosis and docetaxel sensitivity of tumor cells in malignant effusions[A];2011醫(yī)學(xué)科學(xué)前沿論壇第十二屆全國(guó)腫瘤藥理與化療學(xué)術(shù)會(huì)議論文集[C];2011年

5 任波;馬迪;李毅;;地高辛標(biāo)記探針結(jié)合化學(xué)發(fā)光技術(shù)快速靈敏檢測(cè)植物總RNA中的miRNAs方法[A];中國(guó)植物病理學(xué)會(huì)2005年學(xué)術(shù)年會(huì)暨植物病理學(xué)報(bào)創(chuàng)刊50周年紀(jì)念會(huì)論文摘要集[C];2005年

6 任波;馬迪;李毅;;地高辛標(biāo)記探針結(jié)合化學(xué)發(fā)光技術(shù)快速靈敏檢測(cè)植物總RNA中的miRNAs方法[A];中國(guó)植物病理學(xué)會(huì)2005年學(xué)術(shù)年會(huì)暨植物病理學(xué)報(bào)創(chuàng)刊50周年紀(jì)念會(huì)論文集[C];2005年

7 戚鵬;韓金祥;魯艷芹;王傳璽;欒中華;卜范峰;;病毒編碼的miRNAs:基因表達(dá)新的調(diào)控因子[A];山東省藥學(xué)會(huì)2006年生化與生物技術(shù)藥物學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2006年

8 ;Bioinformatic identification and expression analysis of new microRNAs from Medicago truncatula[A];華東六省一市生物化學(xué)與分子生物學(xué)會(huì)2008年學(xué)術(shù)交流會(huì)論文摘要匯編[C];2008年

9 ;Cell-free miRNAs may indicate diagnosis and docetaxel sensitivity of tumor cells in malignant effusions[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)腫瘤學(xué)分會(huì)第七屆全國(guó)中青年腫瘤學(xué)術(shù)會(huì)議——中華醫(yī)學(xué)會(huì)腫瘤學(xué)分會(huì)“中華腫瘤 明日之星”大型評(píng)選活動(dòng)暨中青年委員全國(guó)遴選論文匯編[C];2011年

10 ;miRNAs involved in Tau expression of BMSCs induced neurons[A];中國(guó)神經(jīng)科學(xué)學(xué)會(huì)第九屆全國(guó)學(xué)術(shù)會(huì)議暨第五次會(huì)員代表大會(huì)論文摘要集[C];2011年

中國(guó)重要報(bào)紙全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 江尚;特異性miRNAs與前列腺癌發(fā)病密切相關(guān)[N];中國(guó)醫(yī)藥報(bào);2007年

中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 陳健德;新生兒膿毒癥miRNAs表達(dá)譜及其免疫調(diào)節(jié)作用研究[D];復(fù)旦大學(xué);2014年

2 A.B.M.Khaldun;[D];中國(guó)科學(xué)院研究生院(武漢植物園);2015年

3 成鷹;大腸桿菌和布魯氏菌脂多糖刺激條件下巨噬細(xì)胞差異表達(dá)miRNAs的鑒定及其作用機(jī)制[D];海南大學(xué);2014年

4 王奕;MiRNAs在白癜風(fēng)外周血單個(gè)核細(xì)胞中的表達(dá)及miR-3940-5p對(duì)T細(xì)胞作用機(jī)制的研究[D];山東大學(xué);2015年

5 陳科;小鼠子宮內(nèi)膜mRNAs和miRNAs時(shí)空表達(dá)與胚胎著床的關(guān)系及SPOP對(duì)基質(zhì)細(xì)胞蛻膜化的影響[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2015年

6 陳芳;鵝肥肝生成相關(guān)miRNAs、基因的鑒定及功能研究和就巢性相關(guān)miRNAs的鑒定[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

7 顧麗紅;北京鴨胚胎期胸肌發(fā)育相關(guān)基因與miRNAs表達(dá)模式鑒定及其互作關(guān)系研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2015年

8 侯冬霞;游離脂肪酸在脂肪組織胰島素抵抗中的作用研究及Solexa技術(shù)在miRNAs檢測(cè)中的應(yīng)用研究[D];南京大學(xué);2011年

9 李菁;分泌的miRNAs在2型糖尿病和血管再生中的生物學(xué)功能研究[D];南京大學(xué);2011年

10 王鳳;miRNAs對(duì)TBX5的靶向調(diào)控及其遺傳變異的調(diào)控差異在先天性心臟病中的作用[D];復(fù)旦大學(xué);2012年

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 榮輝;B.melitensis M5-90及其LPS刺激條件下RAW264.7細(xì)胞受CD14影響的miRNAs的作用機(jī)制[D];海南大學(xué);2014年

2 李新瓊;豬細(xì)小病毒感染PK-15細(xì)胞前后microRNAs表達(dá)譜的研究及部分免疫功能的鑒定[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

3 邢艷芳;比較分析線(xiàn)蟲(chóng)參與微重力調(diào)控的miRNAs[D];大連海事大學(xué);2016年

4 黨春艷;高山離子芥低溫脅迫調(diào)控的miRNAs及其靶基因的表達(dá)分析[D];蘭州大學(xué);2013年

5 高蓉芳;人ULK1的表達(dá)和純化及miRNAs對(duì)人宮頸癌細(xì)胞Hela中G4R1表達(dá)調(diào)控的研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2016年

6 江冬瑞;人乳腺癌MCF-7細(xì)胞在不同HER-2水平下外泌型miRNAs表達(dá)譜檢測(cè)[D];安徽醫(yī)科大學(xué);2016年

7 杜新;肉牛H-FABP基因分子特征及肌內(nèi)脂肪沉積相關(guān)miRNAs鑒定[D];沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年

8 馬蘇日古嘎;UC-MSCs條件培養(yǎng)基對(duì)HepG2影響的miRNAs差異表達(dá)譜分析及miR-3065-5p功能的初步探討[D];內(nèi)蒙古大學(xué);2016年

9 孟麗雅;惡性轉(zhuǎn)化BEAS-2B細(xì)胞lncRNAs與miRNAs的差異表達(dá)[D];鄭州大學(xué);2016年

10 趙海軍;應(yīng)用微陣列芯片技術(shù)分析先天性巨結(jié)腸miRNAs表達(dá)譜差異[D];南方醫(yī)科大學(xué);2016年


  本文關(guān)鍵詞:牦牛脂肪分化相關(guān)miRNAs的篩選、表達(dá)及其靶基因分析,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。



本文編號(hào):277319

資料下載
論文發(fā)表

本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/dongwuyixue/277319.html


Copyright(c)文論論文網(wǎng)All Rights Reserved | 網(wǎng)站地圖 |

版權(quán)申明:資料由用戶(hù)40fb2***提供,本站僅收錄摘要或目錄,作者需要?jiǎng)h除請(qǐng)E-mail郵箱bigeng88@qq.com
99久久免费看国产精品| 亚洲欧美日韩综合在线成成| 欧美一区二区三区不卡高清视| 人妻内射精品一区二区| 国产免费操美女逼视频| 亚洲国产精品久久琪琪| 狠狠做深爱婷婷久久综合| 少妇成人精品一区二区| 日韩欧美一区二区黄色| 一级片二级片欧美日韩| 欧美日韩国产一级91| 99国产精品国产精品九九| 中文人妻精品一区二区三区四区| 人妻精品一区二区三区视频免精| 日本深夜福利视频在线| 亚洲视频在线观看你懂的| 中文精品人妻一区二区| 精品一区二区三区三级视频| 欧美日韩视频中文字幕| 男人操女人下面国产剧情| 视频一区中文字幕日韩| 好吊妞视频只有这里有精品| 精品国产亚洲av成人一区| 亚洲一区精品二人人爽久久| 丝袜美女诱惑在线观看| 精品人妻av区波多野结依 | 日韩精品一区二区三区四区| 91日韩欧美在线视频| 国产精品久久三级精品| 国产午夜精品在线免费看| 亚洲av日韩一区二区三区四区| 人妻亚洲一区二区三区| 亚洲精品黄色片中文字幕| 中文字幕欧美视频二区| 国产精品亚洲欧美一区麻豆| 日本一品道在线免费观看| 亚洲欧洲一区二区综合精品| 国产欧美精品对白性色| 欧美日韩亚洲国产综合网| 一区二区三区18禁看| 永久福利盒子日韩日韩|