【摘要】：拷貝數(shù)變異(CNV)是基因組中一種重要的遺傳標(biāo)記,其通過調(diào)節(jié)基因的表達量、調(diào)控因子和基因的相對位置、蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)域以及下游的信號通路來影響動物的復(fù)雜性狀。將CNV與動物的生長性狀和基因表達量進行關(guān)聯(lián)分析是鑒定相關(guān)QTL的一種有效手段。之前研究發(fā)現(xiàn),細(xì)胞周期檢查點激酶β(CHKB),Krupple樣因子6(KLF6),磷脂酰肌醇蛋白聚糖1(GPC1)和毒蕈堿型乙酰膽堿受體3(CHRM3)基因在牦�；蚪M中存在CNV,且位于生長性狀和肉品質(zhì)性狀的QTL中。本研究檢測了5個品種牦牛群體中(大通牦牛,無角牦牛,甘南牦牛,天祝白牦牛和高原牦牛)KLF6,CHKB,GPC1和CHRM3基因CNV的分布,并分析其對生長性狀(體重、體高、體斜長、胸圍和管圍)和基因表達量的影響。通過在5個中國牛群體中檢測KLF6,CHKB,GPC1和CHRM3基因CNV的分布,發(fā)現(xiàn)在6月齡和5周歲的大通牦牛群體中,CHKB和GPC1基因Normal拷貝數(shù)類型個體的體高、體斜長、體重和胸圍顯著高于其他拷貝數(shù)類型個體(P0.05);KLF6基因的CNV與體重、體高和胸圍顯著關(guān)聯(lián)(P0.05),CHRM3基因的CNV與5個生長性狀均顯著相關(guān)(P0.05)。這些結(jié)果表明CHKB,KLF6,GPC1和CHRM3基因的CNV可能對牦牛的生長性狀具有重要的影響。CHKB,KLF6和GPC1基因在天祝白牦牛、甘南牦牛和青海高原牦牛群體中Loss拷貝數(shù)類型頻率較高,為優(yōu)勢拷貝數(shù)類型,而在大通牦牛和無角牦牛群體中Gain拷貝數(shù)類型較高。CHRM3基因Gain拷貝數(shù)類型在5個群體中都屬于優(yōu)勢拷貝數(shù)類型。CHKB、KLF6、GPC1和CHRM3基因的表達量在牦牛腦、肺和肌肉組織中表達量較高,且在胎牛各組織中的表達量高于成年牛,說明這些基因在細(xì)胞增殖和分化中發(fā)揮著重要的生物學(xué)作用。相關(guān)性分析結(jié)果表明,CHKB,KLF6,GPC1和CHRM3基因的表達量與CNV呈負(fù)相關(guān),說明這4個基因可能通過調(diào)節(jié)其在肌肉組織中的表達量來影響牦牛的生長性狀。綜上所述,CHKB,KLF6,GPC1和CHRM3基因的CNV可作為牦牛生長性狀的候選遺傳標(biāo)記,為牦牛生產(chǎn)性能的選育與提高提供了科學(xué)依據(jù)。
【學(xué)位授予單位】：中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院
【學(xué)位級別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2018
【分類號】：S823.85


本文編號：2766353