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奶山羊發(fā)情期與間情期卵巢中circRNAs差異性表達(dá)譜篩選及功能預(yù)測分析

發(fā)布時(shí)間:2020-07-15 20:33
【摘要】:circRNAs能夠作為吸附miRNA的“海綿”,參與機(jī)體生命活動(dòng)中多種重要的生物學(xué)過程。卵巢是雌性動(dòng)物的重要生殖器官,其主要功能是產(chǎn)生卵子和分泌雌激素。產(chǎn)生卵子和分泌雌激素的重要器官目前關(guān)于卵巢中circRNA的種類、數(shù)量、功能及其對卵巢發(fā)育的調(diào)控機(jī)理研究報(bào)道很少。因此本研究對奶山羊發(fā)情期和發(fā)情間期卵巢組織中circRNA表達(dá)譜進(jìn)行檢測和分析,為更好地探索circRNA在奶山羊發(fā)情周期的卵巢發(fā)育過程中所起到的調(diào)控作用研究提供新的試驗(yàn)依據(jù)。本試驗(yàn)以發(fā)情期與間情期的奶山羊卵巢為研究對象,通過樣品提取總RNA后并對其進(jìn)行處理之后制備整個(gè)文庫的策略,利用IlluminaHiSeq進(jìn)行測序并進(jìn)行分析、生物信息學(xué)方法、GO和KEGG通路分析,采用RT-qPCR等檢測技術(shù),研究了奶山羊發(fā)情期與間情期卵巢中的circRNA及其在奶山羊發(fā)情過程中發(fā)揮的作用,并從circRNA調(diào)控的角度預(yù)測奶山羊卵巢發(fā)育不同時(shí)期差異性表達(dá)的circRNA的生理機(jī)理。主要研究結(jié)果如下:1.奶山羊發(fā)情期卵巢中circRNAs的篩選及驗(yàn)證研究通過circRNA高通量測序檢測到奶山羊發(fā)情期和發(fā)情間期卵巢組織中候選的circRNA有22,333個(gè),可分為六類;奶山羊發(fā)情期卵巢相對發(fā)情間期有772個(gè)circRNA差異性表達(dá),268個(gè)上調(diào),504個(gè)下調(diào);奶山羊卵巢組織中除了Y染色體,circRNAs在其他所有染色體上均廣泛分布,大多數(shù)circRNA長度約為500nt。2.奶山羊發(fā)情期卵巢中相關(guān)circRNAs功能預(yù)測分析(1)GO分析結(jié)果顯示,共86個(gè)組顯著富集在細(xì)胞組分。在分子功能GO分析中circRNA顯著聚集在111個(gè)分類中,而371個(gè)在生物過程分類中聚集。(2)KEGG結(jié)果顯示,105個(gè)通路被顯著富集,包括黏著連接、泛素介導(dǎo)的蛋白水解、胞吞作用等。本試驗(yàn)研究了奶山羊卵巢組織中circRNA表達(dá)水平在奶山羊發(fā)情的不同生理階段而不同,circRNAs可參與卵巢發(fā)育相關(guān)信號(hào)通路,可能與奶山羊的發(fā)情有關(guān)。該結(jié)果為circRNA在卵巢發(fā)育中RNA的功能研究提供了新的研究思路,并為circRNA參與奶山羊卵巢發(fā)育、發(fā)情的具體生物學(xué)功能和分子機(jī)理提供了數(shù)據(jù)支持。
【學(xué)位授予單位】:西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:S827
【圖文】:

發(fā)情周期,卵巢,占比,雌性動(dòng)物


圖 1-1 發(fā)情周期(以 21 天為例)中各階段所占比重及卵巢變化(2013)e proportion of each stage and ovarian changes in an estrous cycle (21 days as exa的結(jié)構(gòu)雌性動(dòng)物重要生殖器官,它可以產(chǎn)生卵子、分泌雌激素。具體的結(jié)

卵子,雌激素


它可以產(chǎn)生卵子、分泌雌激素。具體的結(jié)構(gòu)如圖1-2 所示。圖 1-2 卵巢的結(jié)構(gòu)(王珊, 2016)Fig 1-2 The ovarian structure

卵泡,卵巢皮質(zhì),三級卵泡,次級卵泡


第一章 奶山羊卵巢及 circRNA 研究進(jìn)展卵巢的主要功能是促進(jìn)卵泡發(fā)育。胚胎干細(xì)胞中大約有 14%~28%在胎兒時(shí)期發(fā)了雌性生殖細(xì)胞。卵原細(xì)胞(Oogonium)產(chǎn)生于卵巢皮質(zhì)內(nèi),在卵巢皮質(zhì)內(nèi)散布-70 萬個(gè)原始卵泡。卵母細(xì)胞和顆粒細(xì)胞(Granulosa cell)可以連續(xù)的增殖分化,形態(tài)也隨之發(fā)生著不斷的改變,如圖 1-3 所示為卵母細(xì)胞形態(tài)依次的變化:原始、初級卵泡(Primary oocyte)、次級卵泡(Secondary oocyte)及三級卵泡。

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