【摘要】：牛病毒性腹瀉病毒(Bovine viral diarrhea virus,BVDV)是牛病毒性腹瀉(Bovine viral diarrhea,BVD)的病原,引起以腹瀉、黏膜糜爛潰瘍、持續(xù)性感染為特征的牛傳染性疾病,對世界養(yǎng)牛業(yè)造成了嚴重的經濟損失。該病毒分為BVDV-1和BVDV-2兩個基因型,致細胞病變型(CP)和非致細胞病變型(NCP)兩個生物型。為了了解本實驗室分離鑒定的BVDV-1 NCP型H2017分離株的全基因組信息和遺傳特性,本研究根據GenBank上發(fā)表5株BVDV-1病毒的全基因序列,設計16對特異性引物,應用RT-PCR方法擴增后,進行序列的測定,并根據H2017株全基因組序列、5'UTR序列、N~(pro)基因序列和E2基因序列分別構建遺傳進化樹,分析各部分遺傳特性,獲得了以下結果。本試驗完成對H2017分離株基因的測序,得到H2017株基因組大小為12142 bp,G+C含量為45.97%,5'UTR大小為303 bp,ORF大小為11706 bp,編碼3901個氨基酸,3'UTR大小為133bp。對H2017株全基因組、5'UTR、Nppo基因和E2基因序列同源性比對并構建遺傳進化樹。結果顯示,H2017株全基因與BVDV-1m LN-1株同源性95.9%,處于遺傳進化樹同一分支;5'UTR與BVDV-1m LN-1株同源性為95.3%;Npro基因與BVDV-1m NMG313株同源性最高為99.2%;E2基因與BVDV-1m XC分離株處于同一進化樹分支。對H2017株與BVDV-1 NADL株(NC_001461.1)NS2/3基因序列的比對結果顯示,H2017株在NS2/3基因4993～5263處缺失270bp,以上試驗結果證明,BVDV H2017分離株為BVDV-1m NCP型病毒。試驗結果不但豐富了 BVDV的分子生物學信息,而且充實了 BVDV-1分子流行病學的資料,為H2017株全基因組的深入研究和防控內蒙古地區(qū)牛病毒性腹瀉提供參考依據。
【學位授予單位】：內蒙古農業(yè)大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2019
【分類號】：S852.65
【圖文】：

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本文編號：2752427