5個(gè)中國綿羊群體KAPs基因的遺傳變異研究
本文關(guān)鍵詞:5個(gè)中國綿羊群體KAPs基因的遺傳變異研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:角蛋白關(guān)聯(lián)蛋白(Keratin-associated proteins,KAPs)是羊毛纖維的主要結(jié)構(gòu)組成部分,由KAPs基因家族編碼。KAP11-1基因和KAP15-1基因?qū)儆诟吡騅APs基因家族成員,在綿、山羊上鮮有報(bào)道。為了分析中國綿羊群體KAPs基因的遺傳變異,本研究采用PCR-SSCP技術(shù),以KAP11-1基因和KAP15-1基因?yàn)楹蜻x基因,以藏綿羊(歐拉型)、甘肅高山細(xì)毛羊、灘羊、湖羊和青海細(xì)毛羊5個(gè)品種的749只個(gè)體為研究對象,檢測2個(gè)基因的核苷酸序列和氨基酸序列變異,同時(shí)分析等位基因頻率、遺傳雜合度、有效等位基因數(shù)和多態(tài)信息含量等群體遺傳特征,并對綿羊與其它物種2個(gè)基因的核苷酸序列同源性進(jìn)行比較。主要研究結(jié)果為:(1)5個(gè)綿羊群體KAP11-1基因的編碼區(qū)檢測到c.93CT,c.240GA,c.285CG/A和c.331AG 4個(gè)SNPs位點(diǎn),其中前3個(gè)為同義突變,而c.331AG為非同義突變,導(dǎo)致KAP11-1多肽鏈上1個(gè)氨基酸的改變(p.Ser111Gly);KAP15-1基因的編碼區(qū)檢測到7個(gè)SNPs位點(diǎn)(c.133AG,c.171CT,c.229CT,c.245TC,c.267AT,c.323GA和c.339TC),其中c.133AG,c.323GA,c.245TC和c.229CT為非同義突變,導(dǎo)致KAP15-1多肽鏈上p.Thr45Ala,p.Phe77Ser,p.Phe82Ser和p.Ser108Asn的改變。(2)5個(gè)綿羊群體的KAP11-1基因中共發(fā)現(xiàn)了A、B、C、D 4個(gè)等位基因。其中A為優(yōu)勢等位基因,基因頻率為87.70%。在藏綿羊(歐拉型)、甘肅高山細(xì)毛羊、灘羊和湖羊4個(gè)群體的KAP15-1基因中發(fā)現(xiàn)了A、B、C、D 4個(gè)等位基因,而在青海細(xì)毛羊中只發(fā)現(xiàn)A、B、C 3個(gè)等位基因。4個(gè)等位基因中,A為優(yōu)勢等位基因,基因頻率為87.10%。(3)群體遺傳學(xué)分析表明,在5個(gè)綿羊群體中,灘羊KAP11-1基因的遺傳雜合度、有效等位基因數(shù)和多態(tài)信息含量分別為0.17,1.38和0.26,均高于其余4個(gè)群體,呈中度多態(tài);湖羊KAP15-1基因的遺傳多態(tài)性較其它4個(gè)群體豐富,其遺傳雜合度、有效等位基因數(shù)和多態(tài)信息含量分別為0.27,1.98和0.44,呈中度多態(tài)。(4)綿羊KAP11-1基因和KAP15-1基因的核苷酸序列與山羊、牛具有較高的同源性,在系統(tǒng)發(fā)育樹中分別聚為同一支。
【關(guān)鍵詞】:角蛋白關(guān)聯(lián)蛋白 KAP11-1基因 KAP15-1基因 遺傳變異 PCR-SSCP
【學(xué)位授予單位】:甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:S826
【目錄】:
- 摘要4-5
- Summary5-10
- 英文縮略詞表10-11
- 前言11-12
- 第一部分 文獻(xiàn)綜述12-31
- 1 綿羊的起源12
- 2 中國綿羊產(chǎn)業(yè)現(xiàn)狀12-20
- 2.1 中國綿羊遺傳資源概況12-13
- 2.2 中國綿羊存欄量及羊產(chǎn)品產(chǎn)量13-17
- 2.3 本研究涉及的主要綿羊品種17-20
- 3 度量羊毛產(chǎn)量和品質(zhì)的主要性狀及影響因素20-24
- 3.1 度量羊毛產(chǎn)量和品質(zhì)的主要性狀20-21
- 3.2 影響毛用性狀的因素21-24
- 4 KAPs基因的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)、表達(dá)及染色體定位24-26
- 4.1 KAPs基因的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)24-25
- 4.2 KAPs基因的表達(dá)25
- 4.3 KAPs基因在染色體上的定位25-26
- 5 KAPs基因在國內(nèi)外的研究進(jìn)展26-28
- 5.1 高硫KAPs基因的研究進(jìn)展26-27
- 5.2 超高硫KAPs基因的研究進(jìn)展27
- 5.3 高甘氨酸/酪氨酸KAPs基因的研究進(jìn)展27-28
- 6 本試驗(yàn)候選基因概況28-29
- 6.1 KAP11-1 基因28
- 6.2 KAP15-1 基因28-29
- 7 PCR-SSCP技術(shù)29-30
- 7.1 PCR-SSCP技術(shù)的產(chǎn)生和建立29-30
- 7.2 PCR-SSCP技術(shù)特點(diǎn)30
- 8 本研究的目的與意義30-31
- 第二部分 材料與方法31-39
- 1 試驗(yàn)材料、儀器設(shè)備及試劑31-33
- 1.1 試驗(yàn)材料31
- 1.2 主要儀器設(shè)備31-32
- 1.3 溶液試劑配制32-33
- 2 試驗(yàn)步驟與方法33-39
- 2.1 基因組DNA的提取33
- 2.2 引物設(shè)計(jì)和PCR擴(kuò)增33-35
- 2.3 SSCP分析35
- 2.4 等位基因序列測定35-36
- 2.5 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析36-39
- 第三部分 結(jié)果與分析39-51
- 1 PCR-SSCP多態(tài)性檢測結(jié)果39-41
- 1.1 KAP11-1 基因PCR-SSCP多態(tài)性檢測結(jié)果39-40
- 1.2 KAP15-1 基因PCR-SSCP多態(tài)性檢測結(jié)果40-41
- 2 核苷酸與氨基酸序列分析41-46
- 2.1 綿羊KAP11-1 基因的核苷酸與氨基酸序列比對結(jié)果41-43
- 2.2 綿羊KAP15-1 基因的核苷酸與氨基酸序列比對結(jié)果43-46
- 3 群體遺傳學(xué)分析結(jié)果46-51
- 3.1 綿羊KAP11-1 基因的群體遺傳學(xué)分析結(jié)果46-48
- 3.2 綿羊KAP15-1 基因的群體遺傳學(xué)分析結(jié)果48-51
- 第四部分 討論51-57
- 1 關(guān)于SSCP技術(shù)的討論51-52
- 2 KAPs基因的遺傳變異分析52-57
- 2.1 KAP11-1 基因的遺傳變異分析52-54
- 2.2 KAP15-1 基因的遺傳變異分析54-57
- 第五部分 結(jié)論57-58
- 參考文獻(xiàn)58-65
- 附錄1 核苷酸序列比對結(jié)果65-66
- 附錄2 氨基酸序列比對結(jié)果66-67
- 附錄3 氨基酸的簡寫符號67-68
- 致謝68-69
- 作者簡介69-70
- 導(dǎo)師簡介70-71
【參考文獻(xiàn)】
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本文關(guān)鍵詞:5個(gè)中國綿羊群體KAPs基因的遺傳變異研究,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號:275195
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