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馬五種盅口亞科線蟲線粒體全基因組比較與進(jìn)化分析

發(fā)布時間:2020-07-08 09:14
【摘要】:馬的盅口亞科線蟲是馬屬動物大腸內(nèi)重要的寄生蟲,隸屬于圓線科。當(dāng)蟲體大量寄生時會導(dǎo)致宿主貧血、被毛粗亂、消瘦、腹瀉,嚴(yán)重者甚至?xí)斐伤劳?給養(yǎng)馬業(yè)帶來較為嚴(yán)重的損失。該類線蟲以種類多、寄生數(shù)量大為特征,而這類線蟲的分類一直以來都有所爭議。目前,國內(nèi)外學(xué)者對盅口亞科線蟲的研究主要集中在形態(tài)學(xué)、流行病學(xué)及疾病防控等方面,對于該類線蟲的線粒體全基因組、遺傳進(jìn)化、親緣關(guān)系的研究還是相對較少。因此,本研究的目的是對馬的五種盅口亞科線蟲(蝶狀盅口線蟲、碗形盅口線蟲、鼻狀杯環(huán)線蟲、異齒盆口線蟲、微小杯冠線蟲)進(jìn)行形態(tài)學(xué)和分子生物學(xué)鑒定,然后擴(kuò)增其線粒體基因組,對線粒體基因組進(jìn)行比較分析和進(jìn)化分析,構(gòu)建進(jìn)化樹,探討盅口亞科線蟲與其他線蟲的親緣關(guān)系。本研究中的蝶狀盅口線蟲、碗形盅口線蟲、鼻狀杯環(huán)線蟲、微小杯冠線蟲和異齒盆口線蟲形態(tài)學(xué)特征均與文獻(xiàn)資料描述相符,五種線蟲的核糖體內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(ITS)序列分別與Gen Bank上已發(fā)表相應(yīng)線蟲的ITS序列比較,同源性分別為99.9%、99.6%、99.8%、99.7%和99.2%,通過形態(tài)學(xué)和分子生物學(xué)方法準(zhǔn)確地鑒定了五種線蟲。擴(kuò)增獲得蝶狀盅口線蟲、碗形盅口線蟲、鼻狀杯環(huán)線蟲、微小杯冠線蟲和異齒盆口線蟲的線粒體基因組全長分別為13822 bp、13838 bp、13846 bp、13826 bp和13817 bp,均包含了12個蛋白質(zhì)編碼基因,22個t RNA,2個r RNA和2個非編碼區(qū),所有基因均在同一條鏈上且轉(zhuǎn)錄方向相同。五種線蟲線粒體全基因組的AT含量明顯偏高,分別為75.70%(蝶狀盅口線蟲)、76.12%(碗形盅口線蟲)、74.74%(鼻狀杯環(huán)線蟲)、76.77%(微小杯冠線蟲)和74.65%(異齒盆口線蟲)。五種線蟲線粒體基因組核苷酸序列同源性變化為84.1~95.1%,其中碗形盅口線蟲和蝶狀盅口線蟲的同源性最高,蝶狀盅口線蟲和異齒盆口線蟲同源性最低,三種三齒屬線蟲與盅口亞科線蟲同源性高于同一亞科的馬圓線蟲。同時也發(fā)現(xiàn)目前圓線超科已獲得線粒體基因組的20種線蟲的基因排列順序完全相同。以串聯(lián)的12個蛋白質(zhì)編碼基因作為基因標(biāo)記重新構(gòu)建盅口亞科線蟲與其他線蟲之間的進(jìn)化關(guān)系結(jié)果顯示三齒屬線蟲與盅口亞科線蟲的進(jìn)化關(guān)系較近,而與同一亞科的馬圓線蟲親緣關(guān)系較遠(yuǎn),進(jìn)一步驗(yàn)證了三齒屬線蟲應(yīng)歸屬于盅口亞科的假說。本研究首次獲得了蝶狀盅口線蟲、碗形盅口線蟲、鼻狀杯環(huán)線蟲、微小杯冠線蟲和異齒盆口線蟲的線粒體全基因,通過比較分析發(fā)現(xiàn)目前已獲得的20種圓線超科線蟲的線粒體全基因組基因排列完全一致,且基于線粒體基因組進(jìn)一步驗(yàn)證了三齒屬線蟲應(yīng)歸屬于盅口亞科的假說。本研究不僅豐富了線蟲線粒體數(shù)據(jù)庫,也為今后圓線科線蟲系統(tǒng)發(fā)生學(xué)、分子分類學(xué)等研究提供了有效的基因標(biāo)記。
【學(xué)位授予單位】:黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:S852.7
【圖文】:

側(cè)面觀,雄蟲,蟲體,尾部


結(jié) 果3 結(jié) 果3.1 五種蟲體形態(tài)學(xué)鑒定取五種蟲體的雌、雄蟲若干在顯微鏡下分別從腹面、側(cè)面進(jìn)行觀察,測量后拍照。蟲體的形態(tài)包括長度、有無背溝,口領(lǐng)和口囊形態(tài)、內(nèi)外葉冠數(shù)量、尾部特征等方面進(jìn)了詳細(xì)的描述,見表 3-1,圖 3-1,蟲體各部分的測量參數(shù)見表 3-2。

側(cè)面觀,尾部,雄蟲,線蟲


3-2 蝶狀盅口線蟲,1:食道區(qū),腹面觀;2:頭部側(cè)面觀;3:頭部腹面觀;4:雌蟲尾部側(cè)面觀;5:雄蟲尾部側(cè)面觀;6:雄蟲尾部腹面觀;標(biāo)尺=0.1 mmig. 3-2 The morphological characteristics of Cy. pateratum, 1: Esophageal region, ventral view; 2: The headdorsoventral view; 3: The head, ventral view; 4: The tail of female, dorsoventral view; 5: The tail of male,dorsoventral view; 6: The tail of male, ventral view; Bar=0.1 mm

尾部,側(cè)面觀,雄蟲,雌蟲


3-2 蝶狀盅口線蟲,1:食道區(qū),腹面觀;2:頭部側(cè)面觀;3:頭部腹面觀;4:雌蟲尾部側(cè)面觀5:雄蟲尾部側(cè)面觀;6:雄蟲尾部腹面觀;標(biāo)尺=0.1 mmig. 3-2 The morphological characteristics of Cy. pateratum, 1: Esophageal region, ventral view; 2: The hedorsoventral view; 3: The head, ventral view; 4: The tail of female, dorsoventral view; 5: The tail of maledorsoventral view; 6: The tail of male, ventral view; Bar=0.1 mm

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