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ACSL3基因?qū)χ袊菰t牛前脂肪細(xì)胞分化的影響及其遺傳多態(tài)性研究

發(fā)布時間:2020-07-08 02:13
【摘要】:長鏈脂酰輔酶A合成酶(long-chain acyl-CoA synthetase,ACSLs)是生物合成途徑中必需的酶,有助于活化脂肪酸,主要催化其鏈長度為12-20個碳的脂肪酸。ACSLs是哺乳動物中幾乎所有代謝途徑的一個完整的初始步驟,如復(fù)雜的脂質(zhì)合成、蛋白質(zhì)修飾和脂肪酸β-氧化。ACSL3是ACSLs家族的成員,含有高水平的多不飽和脂肪酸磷脂,在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)(ER)和大多數(shù)組織的脂滴中廣泛表達(dá)。ACSL3能夠調(diào)節(jié)脂肪細(xì)胞分化關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子的活性,有助于維持脂質(zhì)平衡,參與脂肪酸的吸收。目前,關(guān)于ACSL3基因在肉牛前體脂肪細(xì)胞向脂肪細(xì)胞分化過程中的機制及遺傳多態(tài)性的研究還不清楚。為探究ACSL3基因?qū)εVx調(diào)控作用及遺傳多態(tài)性功能,試驗以ACSL3基因為研究對象,通過構(gòu)建過表達(dá)載體及siRNA方法,解析ACSL3基因在前體脂肪細(xì)胞向脂肪細(xì)胞分化過程中的作用。同時,在中國草原紅牛群體水平中,通過Sanger直接測序技術(shù)對ACSL3基因進(jìn)行多態(tài)性檢測,分析其SNPs與肉牛肉質(zhì)性狀的相關(guān)性。主要研究結(jié)果如下:(1)成功克隆中國草原紅牛ACSL3基因,同時進(jìn)行了相關(guān)生物信息學(xué)分析,并分析了ACSL3基因在各組織間的mRNA及蛋白表達(dá)差異。(2)成功分離中國草原紅牛前體脂肪細(xì)胞,確定ACSL3基因在牛前體脂肪細(xì)胞誘導(dǎo)分化過程中mRNA及蛋白的表達(dá)規(guī)律。(3)構(gòu)建過表達(dá)載體與siRNA,分別轉(zhuǎn)染于牛前體脂肪細(xì)胞中。在成脂分化過程中,過表達(dá)ACSL3基因能夠顯著提高PPARγ和C/EBPα的mRNA及蛋白含量(P0.05),而干擾ACSL3基因則顯著降低PPARγ和C/EBPα的mRNA及蛋白含量(P0.05);ACSL3基因過表達(dá)能夠顯著提高中國草原紅牛脂肪細(xì)胞中脂滴和甘油三酯含量(P0.05),而干擾ACSL3基因能顯著降低細(xì)胞中脂滴和甘油三酯含量(P0.05)。(4)以中國草原紅牛為研究對象,對ACSL3基因15個外顯子進(jìn)行SNP位點檢測,發(fā)現(xiàn)僅第6外顯子在g.111870595位置存在一個G-A突變(E6-GA)。結(jié)合肉質(zhì)性狀進(jìn)行了相關(guān)分析,發(fā)現(xiàn)該突變在中國草原紅牛的花生酸、亞油酸、剪切力、脂肪含量和水分含量中存在顯著差異。綜上所述,在中國草原紅牛成脂分化過程中,ACSL3基因能夠促進(jìn)細(xì)胞中甘油三酯和脂滴合成,促進(jìn)成脂分化標(biāo)志基因的表達(dá),對脂肪細(xì)胞分化具有正向調(diào)節(jié)作用;同時,ACSL3基因在編碼區(qū)發(fā)生g.111870595 GA(E6-GA)突變,與脂肪酸含量、部分肉質(zhì)性狀存在相關(guān)性。研究結(jié)果可以為進(jìn)一步探究ACSL3基因的功能及應(yīng)用提供基礎(chǔ)材料,為牛脂代謝及脂肪沉積的相關(guān)研究提供理論依據(jù)。
【學(xué)位授予單位】:吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:S823
【圖文】:

電泳圖,基因編碼區(qū),電泳圖,PCR擴增


1.2 RT-PCR 產(chǎn)物;M,DL2000 DNA Mar1.2RT-PCRproduct;M,DL2000DNAMarke 1. 1 中國草原紅牛 ACSL3 基因編碼區(qū) PCRtrophoregram of ACSL3 coding region in因序列的生物信息學(xué)分析比對及系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建 BLAST 對中國草原紅牛 ACSL3 基因 C68.2)、綿羊(登錄號:XM_00400496)、人(登錄號:NM_001354158)、大鼠(登NM_057107.1)、雞(登錄號:XM_015源性比對發(fā)現(xiàn),中國草原紅牛 ACSL3 基的同源性分別為:99%、97%、93%、91苷酸系統(tǒng)進(jìn)化樹,結(jié)果發(fā)現(xiàn),中國草原親緣關(guān)系最遠(yuǎn)(圖 1.2),所構(gòu)建的系分子水平差異。

登錄號,系統(tǒng)進(jìn)化樹,同源性,綿羊


1.2 RT-PCR 產(chǎn)物;M,DL2000 DNA Marker1.2RT-PCRproduct;M,DL2000DNAMarker圖 1. 1 中國草原紅牛 ACSL3 基因編碼區(qū) PCR 擴增電泳圖Fig 1.1 PCR electrophoregram of ACSL3 coding region in Chinese Red Steppe Ca1.2.2 ACSL3 基因序列的生物信息學(xué)分析1.2.2.1 同源性比對及系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建通過 NCBI 中 BLAST 對中國草原紅牛 ACSL3 基因 CDS 核苷酸序列與牛(登號:NM_001205468.2)、綿羊(登錄號:XM_004004964.3)、豬(登錄號:NM_001143698.1)、人(登錄號:NM_001354158)、大鼠(登錄號:NM_001136222.小鼠(登錄號:NM_057107.1)、雞(登錄號:XM_015277033.2)ACSL3 基因苷酸序列進(jìn)行同源性比對發(fā)現(xiàn),中國草原紅牛 ACSL3 基因與牛、綿羊、豬、大鼠、小鼠、雞的同源性分別為:99%、97%、93%、91%、88%、88%、78%;并Mega6.0 構(gòu)建核苷酸系統(tǒng)進(jìn)化樹,結(jié)果發(fā)現(xiàn),中國草原紅牛與牛、綿羊的親緣系最近,與雞的親緣關(guān)系最遠(yuǎn)(圖 1.2),所構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹可以直觀的表不同物種之間的分子水平差異。

親疏水性,蛋白,氨基酸


ACSL3 基因共編碼 720 個氨基酸,ACSL3 蛋白分子式 C3597H5703N955O1044S39,總原子數(shù) 11338,分子量為 80.28 kDa,理論等電點為 8.74,氨基酸組成結(jié)果顯示,共包含 18 種氨基酸,其中亮氨酸(L)所占的比例最高 9.7%(70 個氨基酸),色氨酸(W)所占的比例最低 1.1%(8 個氨基酸),同時包含 75 個負(fù)電荷氨基酸堿基(天冬氨酸 D+谷氨酸 E),包含 87 個正電荷氨基酸(精氨酸 R+賴氨酸 K),消光系數(shù) 88335,不穩(wěn)定系數(shù)為 32.68,說明該蛋白為穩(wěn)定蛋白,預(yù)計的半衰期為 30h,脂肪系數(shù)為 88.43,總平均親水性為-0.195,蛋白表現(xiàn)出親水性,進(jìn)一步使用 Protscale 軟件分析其蛋白親疏水性發(fā)現(xiàn),該蛋白為親水性蛋白(圖 1.3)。

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

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相關(guān)博士學(xué)位論文 前2條

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相關(guān)碩士學(xué)位論文 前2條

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