ACSL3基因?qū)χ袊菰t牛前脂肪細(xì)胞分化的影響及其遺傳多態(tài)性研究
【學(xué)位授予單位】:吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:S823
【圖文】:
1.2 RT-PCR 產(chǎn)物;M,DL2000 DNA Mar1.2RT-PCRproduct;M,DL2000DNAMarke 1. 1 中國草原紅牛 ACSL3 基因編碼區(qū) PCRtrophoregram of ACSL3 coding region in因序列的生物信息學(xué)分析比對及系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建 BLAST 對中國草原紅牛 ACSL3 基因 C68.2)、綿羊(登錄號:XM_00400496)、人(登錄號:NM_001354158)、大鼠(登NM_057107.1)、雞(登錄號:XM_015源性比對發(fā)現(xiàn),中國草原紅牛 ACSL3 基的同源性分別為:99%、97%、93%、91苷酸系統(tǒng)進(jìn)化樹,結(jié)果發(fā)現(xiàn),中國草原親緣關(guān)系最遠(yuǎn)(圖 1.2),所構(gòu)建的系分子水平差異。
1.2 RT-PCR 產(chǎn)物;M,DL2000 DNA Marker1.2RT-PCRproduct;M,DL2000DNAMarker圖 1. 1 中國草原紅牛 ACSL3 基因編碼區(qū) PCR 擴增電泳圖Fig 1.1 PCR electrophoregram of ACSL3 coding region in Chinese Red Steppe Ca1.2.2 ACSL3 基因序列的生物信息學(xué)分析1.2.2.1 同源性比對及系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建通過 NCBI 中 BLAST 對中國草原紅牛 ACSL3 基因 CDS 核苷酸序列與牛(登號:NM_001205468.2)、綿羊(登錄號:XM_004004964.3)、豬(登錄號:NM_001143698.1)、人(登錄號:NM_001354158)、大鼠(登錄號:NM_001136222.小鼠(登錄號:NM_057107.1)、雞(登錄號:XM_015277033.2)ACSL3 基因苷酸序列進(jìn)行同源性比對發(fā)現(xiàn),中國草原紅牛 ACSL3 基因與牛、綿羊、豬、大鼠、小鼠、雞的同源性分別為:99%、97%、93%、91%、88%、88%、78%;并Mega6.0 構(gòu)建核苷酸系統(tǒng)進(jìn)化樹,結(jié)果發(fā)現(xiàn),中國草原紅牛與牛、綿羊的親緣系最近,與雞的親緣關(guān)系最遠(yuǎn)(圖 1.2),所構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹可以直觀的表不同物種之間的分子水平差異。
ACSL3 基因共編碼 720 個氨基酸,ACSL3 蛋白分子式 C3597H5703N955O1044S39,總原子數(shù) 11338,分子量為 80.28 kDa,理論等電點為 8.74,氨基酸組成結(jié)果顯示,共包含 18 種氨基酸,其中亮氨酸(L)所占的比例最高 9.7%(70 個氨基酸),色氨酸(W)所占的比例最低 1.1%(8 個氨基酸),同時包含 75 個負(fù)電荷氨基酸堿基(天冬氨酸 D+谷氨酸 E),包含 87 個正電荷氨基酸(精氨酸 R+賴氨酸 K),消光系數(shù) 88335,不穩(wěn)定系數(shù)為 32.68,說明該蛋白為穩(wěn)定蛋白,預(yù)計的半衰期為 30h,脂肪系數(shù)為 88.43,總平均親水性為-0.195,蛋白表現(xiàn)出親水性,進(jìn)一步使用 Protscale 軟件分析其蛋白親疏水性發(fā)現(xiàn),該蛋白為親水性蛋白(圖 1.3)。
【參考文獻(xiàn)】
相關(guān)期刊論文 前10條
1 葉婷婷;黃艷紅;方芳;劉沖霄;陳源文;董艷;;母代大鼠高脂飲食對子代早期肝內(nèi)脂肪酸代謝相關(guān)基因表達(dá)的影響[J];臨床兒科雜志;2015年02期
2 李科;陳怡;董艷;葉志強;;ACSL3在前列腺癌細(xì)胞系中的表達(dá)及其對前列腺癌轉(zhuǎn)移的影響[J];中國病理生理雜志;2014年02期
3 董炳梅;王金良;張春玲;魏鳳;呂素芳;祖立闖;汪洋;沈志強;;蛋白質(zhì)的糖基化作用及其在生物制藥中的應(yīng)用[J];中國畜牧獸醫(yī);2012年11期
4 唐立群;肖層林;王偉平;;SNP分子標(biāo)記的研究及其應(yīng)用進(jìn)展[J];中國農(nóng)學(xué)通報;2012年12期
5 趙鵬;徐霞紅;周立分;劉欣;聶舟;姚守拙;;磷酸化蛋白質(zhì)分析[J];化學(xué)傳感器;2011年01期
6 潘英樹;張永宏;高妍;秦瑩;馬倩;劉同欣;陳承禎;劉國文;王哲;趙志輝;張嘉保;;草原紅牛血液蛋白多態(tài)性及與生產(chǎn)性能相關(guān)性[J];中國獸醫(yī)學(xué)報;2009年12期
7 姜錚;王芳;何湘;劉大偉;陳宣男;趙紅慶;黃留玉;袁靜;;蛋白質(zhì)磷酸化修飾的研究進(jìn)展[J];生物技術(shù)通訊;2009年02期
8 屈長青,張國華,陳粉粉,趙麗麗,楊公社;豬前體脂肪細(xì)胞的原代培養(yǎng)[J];農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報;2005年05期
9 劉正遠(yuǎn),袁纓;影響肉質(zhì)的生物化學(xué)和組織學(xué)因素[J];飼料工業(yè);2005年11期
10 王竹晨,劉建中,李燕,楊冬梓,鄺健全;人前脂肪細(xì)胞的原代培養(yǎng)[J];中山醫(yī)科大學(xué)學(xué)報;2001年06期
相關(guān)博士學(xué)位論文 前2條
1 呂艷濤;母豬乳脂合成關(guān)鍵基因篩選及長鏈脂肪酸對乳脂合成的調(diào)控研究[D];華南農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年
2 詹小立;牛ATGL基因?qū)εV炯?xì)胞中甘油三酯積累的調(diào)控作用研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2014年
相關(guān)碩士學(xué)位論文 前2條
1 王歡;PID1對豬肌內(nèi)前體脂肪細(xì)胞增殖和分化的影響[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年
2 原利榮;內(nèi)毒素對奶牛乳腺組織免疫活化狀態(tài)及乳脂肪和乳蛋白合成的影響及其控制[D];西南大學(xué);2015年
本文編號:2745948
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/dongwuyixue/2745948.html