【摘要】：我國生豬生產(chǎn)和消費(fèi)始終占世界總量的一半,養(yǎng)豬業(yè)產(chǎn)值超過1.5萬億元,是影響國計(jì)民生的重要產(chǎn)業(yè)�！柏i糧安天下”,但目前仍然存在許多制約我國豬養(yǎng)殖業(yè)持續(xù)健康發(fā)展的因素,其中仔豬腹瀉致使豬抵抗力降低,死亡率增高,尤以病毒性感染引起的腹瀉最為常見且致死率高。病毒性腹瀉病原感染還導(dǎo)致生豬屠宰率下降、受污染豬肉進(jìn)一步成為疾病感染源,造成嚴(yán)重的食品安全及相關(guān)公共衛(wèi)生問題。本研究樣本采集自廣東某生豬養(yǎng)殖場,在2017年4月及7月發(fā)生的兩起疑似病毒性腹瀉疫情中分別采集仔豬的糞便樣本和小腸內(nèi)容物樣本,進(jìn)行病毒的測定,再運(yùn)用Illumina MiSeq高通量測序技術(shù)檢測健康仔豬和特定年齡的病毒性腹瀉仔豬腸道菌群。具體內(nèi)容如下:1、2017年4月收集到1-3周齡哺乳仔豬糞便樣本,其中腹瀉仔豬與健康仔豬各有20頭;2017年7月收集到13頭7日齡仔豬的小腸內(nèi)容物樣本,其中10頭腹瀉仔豬,3頭健康仔豬。采用免疫膠體金技術(shù)和RT-PCR技術(shù)對樣本進(jìn)行針對豬流行性腹瀉病毒、輪狀病毒和豬傳染性胃腸炎病毒的檢測。檢測發(fā)現(xiàn)健康仔豬均未檢出病毒,可作對照樣本;4月收集到的20頭腹瀉仔豬糞便樣本中豬流行性腹瀉病毒檢出率為90%,18頭病毒感染豬作流行性腹瀉仔豬糞便菌群研究樣本;7月收集到的腹瀉小腸內(nèi)容物樣本中輪狀病毒陽性率為40%,陽性樣本作豬輪狀病毒感染仔豬腸道菌群研究。2、研究1-3周齡流行性腹瀉仔豬糞便菌群動(dòng)態(tài)變化發(fā)現(xiàn),由豬流行性腹瀉病毒感染引起的菌群失調(diào),導(dǎo)致埃希氏-志賀菌屬(Escherichia-Shigella),腸球菌屬(Enterococcus),梭菌屬(Fusobacterium)和韋榮球菌屬(Veillonella)等與疾病相關(guān)菌屬的豐度顯著增加(P0.05)。特別的,腹瀉仔豬中梭菌屬和韋榮球菌屬豐度呈現(xiàn)與周齡相關(guān)的顯著增長(P0.05)。某些產(chǎn)短鏈脂肪酸菌,如瘤胃球菌科_UGG-002(Ruminococcaceae_UGG-002),Butyricimonas和Alistipes,作為核心菌屬存在于所有健康仔豬中,但在特定周齡的腹瀉仔豬中存在缺失現(xiàn)象。此外,通過COG功能預(yù)測得到流行性腹瀉病毒嚴(yán)重?cái)_亂各年齡段仔豬糞便菌群正常生理功能。3、通過對7日齡輪狀病毒感染仔豬與健康仔豬腸道菌群的對比研究發(fā)現(xiàn),作為新生健康仔豬小腸內(nèi)優(yōu)勢菌屬的埃希氏-志賀菌屬,腸球菌屬和葡萄球菌屬(Staphylococcus),在患病仔豬腸道內(nèi)豐度顯著降低(P0.05)。特別的,食淀粉乳桿菌(Lactobacillus amylovorus)、約氏乳桿菌(Lactobacillus johnsonii)和唾液乳桿菌(Lactobacillus salivarius)等對某些病毒有抑制作用的乳酸菌,在疾病組中豐度極顯著增加(P0.01)。豬輪狀病毒的感染導(dǎo)致腸道內(nèi)部分菌屬間相關(guān)性減弱甚至消失,使仔豬正常穩(wěn)定的腸道菌群結(jié)構(gòu)遭到破壞,腸道正常生理功能受損。本研究結(jié)果表明,豬流行性腹瀉病毒和豬輪狀病毒感染引起了豬腸道微生物群結(jié)構(gòu)和功能被嚴(yán)重?cái)_亂,同時(shí),根據(jù)不同年齡段仔豬有益菌群的缺乏情況進(jìn)行針對性的補(bǔ)充,可能是一種預(yù)防或治療病毒性腹瀉的有效方法。
【圖文】：

第一章 緒論在漫長的進(jìn)化過程中，核糖體 RNA 即 rRNA 的分子功能幾乎是保持不變的，，素有微生物“化石”之稱[76]。原核生物的核糖體 RNA 分為 23S、16S 和 5S 三種，其中 5S rRNA序列太短，信息量不足區(qū)分物種間的差異；23S rRNA 序列太長，難以準(zhǔn)確對其進(jìn)行測序。因此，16S rRNA 逐漸被作為研究物種進(jìn)化關(guān)系的“黃金標(biāo)準(zhǔn)”[77]。16S rRNA 基因序列長度約為 1540bp，由可變區(qū)和恒定區(qū)交錯(cuò)排列構(gòu)成，位點(diǎn)結(jié)構(gòu)如下圖 1-1。所有細(xì)菌、螺旋體等原核生物中均存在這種特殊結(jié)構(gòu)。

圖 2-1 PED 膠體金試劑盒檢測結(jié)果Fig.2-1 Test result of the PED colloidal gold kit圖 2-2 Rota 和 TGE 膠體金試劑盒檢測結(jié)果2-2 Test result of the Rota colloidal gold kit and TGE colloidal g表 2-5 腹瀉樣本 PEDV 檢測結(jié)果Tab. 2-5 PEDV test results樣本編號(hào) 出生周齡 PDEV檢測結(jié)果03FV01 1 周齡 ＋
【學(xué)位授予單位】：華南理工大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2019
【分類號(hào)】：S858.28

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 王茂軍;;豬輪狀病毒病發(fā)病特點(diǎn)及治療方法[J];農(nóng)民致富之友;2015年11期

2 王栓群;孫瑞芹;劉燕玲;夏平安;宋長緒;;華南地區(qū)豬流行性腹瀉病毒的分子流行病學(xué)調(diào)查與分析[J];廣東農(nóng)業(yè)科學(xué);2015年06期

3 張志;董雅琴;劉爽;吳發(fā)興;邵衛(wèi)星;李曉成;;我國部分省份豬流行性腹瀉的流行病學(xué)監(jiān)測[J];中國動(dòng)物檢疫;2014年10期

4 趙毅博;田宗民;王瑩瑩;魏萍;;食淀粉乳桿菌代謝產(chǎn)物抑菌與抗病毒的比較研究[J];中國畜牧獸醫(yī);2014年08期

5 王振玲;王金秋;王黎霞;;北京地區(qū)腹瀉仔豬輪狀病毒感染的流行病學(xué)調(diào)查[J];養(yǎng)豬;2013年06期

6 陳丹丹;顧勝華;張金娜;寶福凱;湯岳琴;吳曉磊;;腸道菌群對免疫系統(tǒng)的影響及其群落分析方法[J];應(yīng)用與環(huán)境生物學(xué)報(bào);2013年03期

7 蔡汝健;張樂宜;宋長緒;;2010—2013年華南地區(qū)豬流行性腹瀉病流行情況調(diào)查及防控效果[J];廣東農(nóng)業(yè)科學(xué);2013年11期

8 劉孝珍;陳建飛;時(shí)洪艷;張鑫;石達(dá);劉勝旺;馮力;;2011年豬流行性腹瀉病毒的遺傳變異分析[J];中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào);2012年03期

9 李彬;XZ原隆充;;豬的消化器官[J];國外畜牧學(xué)(豬與禽);2011年03期

10 甘振磊;湯德元;李春燕;王彬;張曉杰;王鳳;劉志杰;;豬流行性腹瀉流行特點(diǎn)及流行現(xiàn)狀的研究[J];豬業(yè)科學(xué);2010年12期

相關(guān)博士學(xué)位論文 前4條

1 劉紅賓;母豬微生物垂直傳遞影響仔豬腸道的微生物定植與功能發(fā)育[D];中國農(nóng)業(yè)大學(xué);2019年

2 原霖;豬輪狀病毒G4P[6]株的分離鑒定及新型檢測方法的建立與應(yīng)用[D];中國農(nóng)業(yè)大學(xué);2018年

3 王大會(huì);豬源益生菌對宿主腸道病毒的抗病毒作用研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2016年

4 胡遠(yuǎn)亮;利用分子生物技術(shù)研究益生菌對斷奶仔豬生長及糞便菌群的影響[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前6條

1 李卓君;海拔高度及飼養(yǎng)方式對藏豬腸道菌群結(jié)構(gòu)及其特征的影響[D];江西農(nóng)業(yè)大學(xué);2017年

2 宋勇;健康與流行性腹瀉仔豬糞便以及腸道內(nèi)容物的菌群結(jié)構(gòu)差異研究[D];湖南農(nóng)業(yè)大學(xué);2017年

3 楊利娜;不同豬種間腸道微生物菌群以及生長相關(guān)指標(biāo)的比較[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

4 劉孝珍;2011年中國豬流行性腹瀉病毒分子流行病學(xué)初步調(diào)查[D];東北農(nóng)業(yè)大學(xué);2012年

5 張坤;豬病毒性腹瀉多重RT-PCR診斷方法的建立和應(yīng)用及豬輪狀病毒的分離[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2010年

6

本文編號(hào)：2692765