奶牛卵巢靜止血液蛋白標(biāo)識物的篩選及其預(yù)警體系的建立
【圖文】:
peptide邋reactive邋group,邋and邋a邋neutral邋balance邋portion邋to邋maintain邋an邋overall邋mass邋of邋145逡逑iTRAQ試劑結(jié)構(gòu)為同量異位標(biāo)簽,由帶電的報告基團(tuán)組成,每種試劑中報告基團(tuán)對應(yīng)逡逑每一個樣品。肽反應(yīng)基團(tuán)和中性平衡基團(tuán)以保持總質(zhì)量145邋(圖1-3)。這些獨(dú)特的試劑在逡逑MS/MS碎裂后產(chǎn)生相應(yīng)的、獨(dú)特的報告離子(荷質(zhì)比:四標(biāo):114-117;六標(biāo):114-119:逡逑八標(biāo):114-121),用于量化它們各自的樣品。MS/MS碎裂除了提供強(qiáng)烈的報告離子信號逡逑夕卜,還可以產(chǎn)生y-和b-離子,而不會改變?nèi)魏翁囟牡碾姾蔂顟B(tài),從而在定量的同時可以逡逑更可靠的鑒定蛋白質(zhì)。逡逑肽反應(yīng)基團(tuán)設(shè)計為能夠與所有伯胺進(jìn)行反應(yīng),包括賴氨酸側(cè)鏈的N-端和e-氨基基團(tuán),逡逑以在多種不同生物樣品中標(biāo)記所有肽,從而增強(qiáng)任何給定蛋白質(zhì)的肽覆蓋,同時允許保留逡逑其他重要的結(jié)構(gòu)信息,例如翻譯后修飾。逡逑11逡逑
逡逑圖1-4以4標(biāo)為例的iTRAQ試劑的工作流程,每個單獨(dú)的樣品被還原、烷基化,并用逡逑胰蛋白酶進(jìn)行酶促消化,然后將得到的肽池分別在一組平行的反應(yīng)中標(biāo)記、合并,然后通逡逑過液相-質(zhì)譜/質(zhì)譜(Liquid邋chromatography-mass邋spectrometry/mass邋spectrometry,,邋LC-MS/MS)逡逑聯(lián)用的方法進(jìn)行分析。所獲得的混合物在MS中產(chǎn)生一組未處理的前體離子,進(jìn)而達(dá)到對逡逑樣品中低豐度蛋白的增強(qiáng)作用。在MS中產(chǎn)生的親本片段經(jīng)過處理后,四個報告基團(tuán)離子逡逑在荷質(zhì)比114-117之間顯現(xiàn)為不同的質(zhì)量。逡逑 ̄>?邋EIMi]-pTC邋+逡逑‘各 …口量鎮(zhèn)逡逑——^邐J邋-Reporter-Balance-Peptide邋INTACT邐-邋Peptide邋fragments邋EQUAL逡逑-邋4邋samptes邋identical邋m/z邐-邋Reporter邋ions邋DIFFERENT逡逑圖1-4四標(biāo)試劑的多重反應(yīng)方案逡逑Figure邋1-4邋General邋scheme邋of邋a邋multiplex邋reaction邋of邋four邋different邋samples邋(S1-S4),逡逑designated邋by邋four邋different邋colours.逡逑iTRAQ試劑拓展了研究蛋白質(zhì)差異表達(dá)的動態(tài)能力,它能提供多種樣本中蛋白的定量逡逑信息,包括時間過程分析及疾病標(biāo)記的發(fā)現(xiàn)和闡明。由于樣本中的大多數(shù)肽都適用于該標(biāo)逡逑記策略
【學(xué)位授予單位】:黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:S858.23
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本文編號:2670674
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