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東方泰勒蟲直接PCR檢測方法的建立及應(yīng)用

發(fā)布時(shí)間:2020-05-12 10:57
【摘要】:東方泰勒蟲(Theileria Oriental)是一種經(jīng)蜱傳播的胞內(nèi)原生動(dòng)物寄生蟲,在世界范圍內(nèi)廣泛分布。該病原體能夠引發(fā)牛東方泰勒蟲病,其主要臨床表現(xiàn)為發(fā)熱、溶血性貧血、生產(chǎn)力下降、乳牛和肉牛的流產(chǎn)或死亡,給養(yǎng)牛業(yè)造成了經(jīng)濟(jì)損失和危害。目前,血液直接PCR檢測方法因其不需要提取DNA而直接應(yīng)用血液,從而節(jié)約時(shí)間減少成本故逐漸發(fā)展并應(yīng)用于動(dòng)物疾病流行病學(xué)研究。因此本試驗(yàn)直接以患東方泰勒蟲病的牛血液為模板,建立了血液直接PCR檢測方法。本文首先根據(jù)Genbank上發(fā)布的東方泰勒蟲p33基因序列[DQ078264.1]設(shè)計(jì)一對特異性引物,并以血液為模版,采用血液直接PCR反應(yīng)體系擴(kuò)增出一條416 bp大小的條帶,通過測序得到的核酸序列與基因文庫中發(fā)表的p33基因進(jìn)行序列比對同源性高達(dá)99%,進(jìn)而確定該目的片段為p33基因。此外,本試驗(yàn)設(shè)計(jì)的引物均未能對弓形蟲、新孢子蟲、牛附紅細(xì)胞體擴(kuò)增出目的條帶,說明該方法具有良好的特異性。同時(shí),該方法能檢測出1μL血液最大稀釋倍數(shù)為40倍。說明該方法具有良好的敏感性。另外,分別對5份同一批的東方泰勒蟲陽性血液樣品進(jìn)行血液直接PCR檢測以及常規(guī)PCR檢測并重復(fù)3次試驗(yàn)結(jié)果一致說明該方法重復(fù)性良好。采集吉林省多個(gè)縣市共210份疑似牛東方泰勒蟲抗凝血進(jìn)行血液直接PCR檢測,與常規(guī)PCR法進(jìn)行比較,確定該方法在診斷檢測方面的優(yōu)勢。結(jié)果顯示,直接PCR總陽性率為30.0%,而常規(guī)PCR總陽性率為25.7%,兩種方法的符合率為94.0%,一致性分析Kappa值為0.85。陽性符合率為80.0%,陰性符合率為92.0%;通化地區(qū)陽性率最高,為75.0%,而洮南地區(qū)陽性率最低,為12.0%,不同地區(qū)陽性率之間存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P0.05)。該檢測結(jié)果與胡詩悅等報(bào)道的吉林省的牛東方泰勒蟲感染率為21.1%~75.9%結(jié)果相符。結(jié)果表明該方法更值得推廣和應(yīng)用。本試驗(yàn)建立一種簡便、快捷、敏感、特異的東方泰勒蟲快速檢測方法,可適用于東方泰勒蟲病的診斷和流行病調(diào)查。
【圖文】:

泰勒蟲,常規(guī),血液


1邋PCR擴(kuò)增逡逑以PI、P2為引物,東方泰勒蟲陽性血液為模板,進(jìn)行血液直接PCR擴(kuò)增和逡逑常規(guī)PCR,得到大小約為416bp的DNA片段,與預(yù)期目的片段大小一致,如圖1。逡逑M邋1邐2邐3逡逑2000bp——>邋I逡逑750bp邋邐>逡逑500bp邐>邐<——416bp逡逑250bp——>邋I邋.邋c邋:》、逡逑圖1東方泰勒蟲直接PCR擴(kuò)增和常規(guī)PCR逡逑Fig.l邋Direct邋PCR邋and邋Conventional邋PCR邋amplification邋of邋Theileria邋Oriental逡逑M:邋DNA分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn);1:常規(guī)PCR結(jié)果;2:血液直接PCR結(jié)果;3:水逡逑對照逡逑M:DL2000邋Marker;l:邋Conventional邋PCR;2:邋Direct邋PCR邋amplification^:逡逑Negative邋control邋(ddKhO)逡逑2目的基因的測序及序列分析逡逑將鑒定合格的血液直接PCR樣品送至上海英駿公司測序后顯示,所克隆的逡逑融合基因長為416邋bp,此基因與GenBank上登錄的東方泰勒蟲p33基因序逡逑(DQ078264.1)的同源性為99%,如圖2。逡逑14逡逑

退火溫度,條帶,脂糖


脂糖凝膠電泳檢測,在416邋bp處出現(xiàn)特異性條帶,與預(yù)期口的片段大小相同。結(jié)逡逑果出現(xiàn)的特異條帶在51.9°C時(shí)條帶最亮,故選擇51.9°C為eA伴退火溫度結(jié)果,如逡逑圖3。逡逑M12邐34邐5678逡逑2000bp邐>逡逑750bp邋邐>逡逑4i6bp逡逑I^^HI逡逑圖3直接PCR退火溫度篩選結(jié)果逡逑Fig.3邋Screening邋results邋of邋Direct邋PCR邋annealing邋temperature逡逑M:DNA邋分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn);1邋?8.退火溫度:50邋C、50.邋7’C、51.邋9邋C、53.邋7邋C、56.邋1C、逡逑58^C邋>邋59.邋2°C邋x邋60邋C邋;逡逑M邋:邋1)1,2000邋Marker;邋1邋?8.邋annealing邋temperature:50"C、50.7°C、5邋1邋.VC、53.7°C、逡逑56.1°C
【學(xué)位授予單位】:延邊大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:S858.23

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號:2660109

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