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巴基斯坦傳染性法氏囊病病毒分子流行病學研究

發(fā)布時間:2020-05-11 18:45
【摘要】:傳染性法氏囊病(IBD)是由傳染性法氏囊病病毒(IBDV)引起的嚴重危害家禽的最重要的免疫抑制病之一,也影響食品安全的可持續(xù)發(fā)展。家禽業(yè)是巴基斯坦的第二大產業(yè),而IBD嚴重威脅家禽的健康養(yǎng)殖。盡管實施了大規(guī)模和高強度的疫苗免疫,IBD在包括巴基斯坦在內的全球許多國家仍然持續(xù)存在。然而,在某種程度上,巴基斯坦的IBDV優(yōu)勢流行株和流行模式尚不清楚,甚至在GenBank中找不到巴基斯坦IBDV毒株的的完整基因組信息。所以,很有必要開展巴基斯坦IBDV流行病學研究以揭示免疫失敗的原因,以及為抗原匹配度更高的疫苗篩選和創(chuàng)制提供參考。IBDV是無囊膜病毒,其基因組是線性雙股雙節(jié)段RNA,A節(jié)段長約3.2 kb,B節(jié)段長約2.8 kb�;蚪MA節(jié)段有兩個開放閱讀框(ORF),ORF1編碼VP5蛋白,ORF2編碼多聚蛋白PP。PP會被進一步酶解為VP2、VP3、VP4。VP2是病毒主要的結構蛋白、毒力蛋白和保護性抗原。B節(jié)段編碼具有RNA依賴的RNA聚合酶活性(RdRp)的VP1蛋白。在本研究中,我們開展了一項流行病學調查,涵蓋了2017年至2018年巴基斯坦家禽主要養(yǎng)殖區(qū)(旁遮普省、信德省、俾路支省和首都伊斯蘭堡地區(qū))的29個雞群。RT-PCR結果顯示,87%的檢測樣品均顯示IBDV陽性。對37個IBDV毒株的VP2和VP1基因代表性區(qū)段進行了擴增和序列分析。VP2和VP1基因分別是IBDV基因組兩個節(jié)段的代表性基因,其序列分析對于IBDV的遺傳演化分析非常重要。在本研究之前,僅有少量的巴基斯坦毒株的VP2基因的部分片段被報道,VP1基因未見報道。本研究揭示了巴基斯坦IBDV的分子特征。獨特的節(jié)段重配IBDV(vv-A/Uniq-B)首次被鑒定為巴基斯坦IBDV的優(yōu)勢流行毒株。vv-A/Uniq-B型節(jié)段重配IBDV的基因組A節(jié)段源自IBDV超強毒(vvIBDV),而B節(jié)段來自一個未知的獨特的(unique)祖先。為了深入解析巴基斯坦IBDV優(yōu)勢毒株的流行特征,采自巴基斯坦旁遮普省、信德省、俾路支省和首都伊斯蘭堡等不同地方6個IBDV毒株(PK2,PK12,PK19,PK28,PK33和PK47)被分離鑒定,克隆并測定了其全長基因組。這是GenBank中第一批巴基斯坦IBDV毒株的全長基因組序列�;蚪M層面的分析進一步證實了巴基斯坦IBDV優(yōu)勢流行毒株是獨特的節(jié)段重配病毒(vv-A/Uniq-B),該類病毒形成獨特分子,具有明顯的地域特征�;赟PF雞的動物試驗顯示,巴基斯坦IBDV均導致高發(fā)病率和高死亡率。本研究較清楚地揭示了巴基斯坦IBDV的主要流行特征。為了進一步了解目前所用疫苗與巴基斯坦IBDV流行毒株的抗原匹配性,本研究運用SPF雞對兩種疫苗的保護效果進行了評估。攻毒保護試驗顯示,所用疫苗可以對巴基斯坦IBDV的致死性攻擊提供臨床保護。此外,本研究進行的一項問卷調查研究發(fā)現,疫苗抗原匹配度、生物安全和飼養(yǎng)管理等多種因素均可能影響疫病的防控效果。本研究開展了覆蓋巴基斯坦主要養(yǎng)禽地區(qū)的IBDV流行病學調查。首次克隆、確定和分析了覆蓋IBDV基因組兩個節(jié)段的巴基斯坦IBDV毒株基因和基因組。具有明顯地域特征的獨特的節(jié)段重配IBDV(vv-A/Uniq-B)首次被鑒定為巴基斯坦的IBDV優(yōu)勢流行毒株。巴基斯坦流行毒株引起較高的發(fā)病率和致死率。選擇的疫苗可以對巴基斯坦IBDV的致死性攻擊提供臨床保護,飼養(yǎng)管理等多種因素均可能影響疫病的綜合防控效果。
【學位授予單位】:中國農業(yè)科學院
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:S852.65

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