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豬圓環(huán)和豬流感病毒的分離鑒定、遺傳演化分析及致病性研究

發(fā)布時間:2020-05-04 17:04
【摘要】:豬圓環(huán)病毒(Porcine circovirus,PCV)和豬流感病毒(Swine influenza virus,SIV)是豬群中常見的兩種病毒,在世界范圍內廣泛流行并能夠引起多種豬的疾病,對養(yǎng)豬業(yè)造成了嚴重的經濟損失。PCV是單鏈環(huán)狀DNA病毒,自1974年首次發(fā)現PCV1以來,目前在豬群中流行的基因型有3種,其中PCV2對豬群有較強的致病性。PCV3是2016年首次在美國的母豬流產胎兒當中發(fā)現的,同PCV2相比較二者之間Cap基因的同源性較低,由于PCV3是一種新的PCV基因型,目前關于PCV3流行病學調查數據和檢測方法還不是很完善。SIV是分8個基因片段的負鏈RNA病毒,在豬群中主要流行的基因型為H1N1、H1N2和H3N2,由于不同來源的流感病毒能夠在豬體內發(fā)生重組且流感病毒可以從豬傳播到人群中,因此對于SIV的流行病學調查及致病性研究具有重要的獸醫(yī)公共衛(wèi)生學意義。本研究對2016至2018年間山東省、天津市和上海市及周邊地區(qū)豬場中疑似豬圓環(huán)病毒相關疾病的病料進行采集處理,通過建立PCV2和PCV3雙重PCR方法對采集病料進行檢測,發(fā)現PCV3的陽性率為32.7%且存在PCV2和PCV3混合感染的情況(PCV2和PCV3混合感染的陽性率為15.2%)。表明PCV3目前已經在豬群中廣泛流行。將陽性病料接種PK-15細胞進行病毒分離實驗,只成功分離鑒定到2株PCV2毒株。對代表毒株遺傳演化分析,結果顯示分離到的兩株PCV2屬于PCV2b-1A和PCV2b-1C兩個亞型,7株不同地區(qū)PCV3代表毒株屬于PCV3a亞型,與GenBank中登錄的PCV3序列的全長與Cap基因的同源性分別為97.6%-99.4%和97.1%-99.1%。為探究PCV3 Cap蛋白抗原性,本研究通過原核表達方式,獲得了可溶性表達的去核定信號肽重組蛋白pCold TF-dPCV3-Cap,通過Western blot實驗證明該重組蛋白具有良好的反應原性和特異性。為制備針對于PCV3 Cap的單克隆抗體,本研究利用構建的真核表達質粒pCAGGS-PCV3-Cap免疫小鼠,細胞融合后進行陽性雜交瘤細胞株的篩選和亞克隆純化,經間接免疫熒光鑒定,結果顯示有3株雜交瘤細胞株上清能夠與PCV3 Cap蛋白發(fā)生特異性反應,其中一株3G10的反應效果最好。為了解豬流感病毒的流行情況及其致病性,本研究對2018年于山東某豬場采集到的病料進行分離鑒定,獲得3株二源重組H1N1 SIV,遺傳演化分析結果表明,其兩個表面基因HA和NA來源屬于歐洲類禽亞型,其他6個內部基因的來源屬于2009年甲型流感病毒。為探究分離到的毒株對哺乳動物的致病性,本研究將代表毒株A/Swine/Shandong/L1/2018(H1N1)在小鼠模型上進行滴鼻感染攻毒實驗,結果顯示代表毒株對小鼠呈現較高的致病性,能夠導致小鼠體重產生明顯下降,小鼠死亡率為100%;代表毒株能夠在小鼠肺臟中很好地復制,病毒感染對小鼠肺臟產生明顯的組織病理學損傷。
【圖文】:

退火溫度,雙重PCR


圖 2.1 雙重 PCR 不同退火溫度擴增結果.2.1 Effect of annealing temperature on detection of two viruses by double P(DL2000); 1: 50 C; 2: 52 C; 3: 54 C; 4: 56.4 C; 5: 58.8 C; 6: 61.2 C; 7: 6310: 70 C; 11: 陰性對照L2000); 1: 50 C; 2: 52 C; 3: 54 C; 4: 56.4 C; 5: 58.8 C; 6: 61.2 C; 7: 63.6

循環(huán)數,雙重PCR


圖 2.2 雙重 PCR 不同循環(huán)數擴增結果Fig. 2.2 Effect of number of cycles of double PCR分子量標準(DL2000); 1: 25 個循環(huán); 2: 30 個循環(huán); 3: 35 個循環(huán); 4: 40 個A Marker (DL2000); 1: 25 cycles; 2: 30 cycles; 3: 35 cycles; 4: 40 cycles; 5:
【學位授予單位】:中國農業(yè)科學院
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:S852.651

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