秦川肉牛脂肪組織高表達長鏈非編碼RNA的篩選鑒定及其表達特異性的探究
發(fā)布時間:2020-04-13 22:56
【摘要】:牛肉以其高蛋白低膽固醇的特點受到消費者的歡迎,其中影響牛肉的適口性的牛肉嫩度是決定消費者選擇的關(guān)鍵因素。牛肉的嫩度很大程度上受肌內(nèi)脂肪含量影響,促進肌間脂肪生成可以增加大理石花紋,減少肌纖維含量,從而提高牛肉嫩度。牛的脂肪生成是個比較復(fù)雜的過程,受到各種調(diào)控因子、作用通路的作用。近來許多研究發(fā)現(xiàn)長鏈非編碼RNA(lncRNA)在調(diào)節(jié)脂肪細(xì)胞發(fā)育中也起著關(guān)鍵作用,但目前此類研究主要集中在臨床醫(yī)學(xué)上,在肉牛脂肪發(fā)育方面對于長鏈非編碼RNA的研究并不多,這便突出了此方向研究的必要性。本試驗利用轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù),以西北農(nóng)林科技大學(xué)國家肉牛改良中心選育的秦川牛肉用新品系(簡稱“秦川肉!)為研究對象,分析并篩選了在秦川肉牛背最長肌、皮下脂肪、心臟、肝臟、脾臟、腎臟、肺、皺胃八個組織中,只在脂肪組織中特異性表達的長鏈非編碼RNA,并利用實時熒光定量PCR技術(shù)在秦川肉牛初生犢牛脂肪、肌肉、心臟、肝臟、脾臟、腎臟、肺、大腸、小腸、瘤胃、網(wǎng)胃、瓣胃、皺胃、睪丸共14個組織中進行驗證。在經(jīng)過鑒定的長鏈非編碼RNA中,我們選擇在脂肪組織中表達量最高,特異性最強的長鏈非編碼RNA39520進行下一步研究,即探究長鏈非編碼RNA39520在秦川牛初生犢牛以及6月齡、12月齡、18月齡、24月齡、60月齡秦川肉牛脂肪組織中表達情況,以及在誘導(dǎo)分化的秦川肉牛前體脂肪細(xì)胞中0d、3d、6d、9d、12d的表達情況。本研究有如下結(jié)果:1.對秦川肉牛初生犢牛背最長肌、皮下脂肪、心臟、肝臟、脾臟、腎臟、肺、皺胃八個組織進行采樣,進行轉(zhuǎn)錄組測序并對測序數(shù)據(jù)進行質(zhì)量分析,結(jié)果表示約90%的reads可以比對到參考基因組上,99%的數(shù)據(jù)為高質(zhì)量數(shù)據(jù),所以我們可以肯定所得測序數(shù)據(jù)真實可靠,可以用于下一步的研究。2.經(jīng)測序得到這些reads在基因組位置、在染色體上分布情況以及表達水平和表達差異性。3.得到了在各個組織中表達的長鏈非編碼RNA。通過對長鏈非編碼RNA表達差異性以及表達水平的研究,發(fā)現(xiàn)了在脂肪組織中特異性表達的17個長鏈非編碼RNA。4.長鏈非編碼RNA39520在秦川肉牛初生犢牛、6月齡、12月齡的脂肪組織中表達量逐漸升高,在12月齡秦川肉牛脂肪組織中表達量達到最高,此后有所波動,在秦川肉牛初生犢牛脂肪組織中表達量最低。5.長鏈非編碼RNA39520在誘導(dǎo)分化的秦川肉牛前體脂肪細(xì)胞的第0至3天表達量逐漸升高,在第三天達到最高,并且與第0天、第12天成績顯著差異,此后表達量逐漸降低。綜上,本研究成功篩選并鑒定了在秦川肉牛脂肪組織中特異性表達的長鏈非編碼RNA,并揭示了長鏈非編碼RNA39520在不同時期秦川肉牛脂肪組織及誘導(dǎo)分化的秦川肉牛前體脂肪細(xì)胞中的表達特點,為下一步研究其功能奠定基礎(chǔ)。
【學(xué)位授予單位】:西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:S823.5
本文編號:2626545
【學(xué)位授予單位】:西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:S823.5
【參考文獻】
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1 林清;昝林森;李廣;;肉牛高效育肥技術(shù)[J];中國牛業(yè)科學(xué);2009年02期
2 孔保華,陶菲,刁新平;中國肉牛產(chǎn)業(yè)的現(xiàn)狀和發(fā)展趨勢[J];肉類研究;2002年01期
,本文編號:2626545
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