秦川肉牛脂肪組織高表達(dá)長(zhǎng)鏈非編碼RNA的篩選鑒定及其表達(dá)特異性的探究
發(fā)布時(shí)間:2020-04-13 22:56
【摘要】:牛肉以其高蛋白低膽固醇的特點(diǎn)受到消費(fèi)者的歡迎,其中影響牛肉的適口性的牛肉嫩度是決定消費(fèi)者選擇的關(guān)鍵因素。牛肉的嫩度很大程度上受肌內(nèi)脂肪含量影響,促進(jìn)肌間脂肪生成可以增加大理石花紋,減少肌纖維含量,從而提高牛肉嫩度。牛的脂肪生成是個(gè)比較復(fù)雜的過程,受到各種調(diào)控因子、作用通路的作用。近來許多研究發(fā)現(xiàn)長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)在調(diào)節(jié)脂肪細(xì)胞發(fā)育中也起著關(guān)鍵作用,但目前此類研究主要集中在臨床醫(yī)學(xué)上,在肉牛脂肪發(fā)育方面對(duì)于長(zhǎng)鏈非編碼RNA的研究并不多,這便突出了此方向研究的必要性。本試驗(yàn)利用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù),以西北農(nóng)林科技大學(xué)國(guó)家肉牛改良中心選育的秦川牛肉用新品系(簡(jiǎn)稱“秦川肉!)為研究對(duì)象,分析并篩選了在秦川肉牛背最長(zhǎng)肌、皮下脂肪、心臟、肝臟、脾臟、腎臟、肺、皺胃八個(gè)組織中,只在脂肪組織中特異性表達(dá)的長(zhǎng)鏈非編碼RNA,并利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)在秦川肉牛初生犢牛脂肪、肌肉、心臟、肝臟、脾臟、腎臟、肺、大腸、小腸、瘤胃、網(wǎng)胃、瓣胃、皺胃、睪丸共14個(gè)組織中進(jìn)行驗(yàn)證。在經(jīng)過鑒定的長(zhǎng)鏈非編碼RNA中,我們選擇在脂肪組織中表達(dá)量最高,特異性最強(qiáng)的長(zhǎng)鏈非編碼RNA39520進(jìn)行下一步研究,即探究長(zhǎng)鏈非編碼RNA39520在秦川牛初生犢牛以及6月齡、12月齡、18月齡、24月齡、60月齡秦川肉牛脂肪組織中表達(dá)情況,以及在誘導(dǎo)分化的秦川肉牛前體脂肪細(xì)胞中0d、3d、6d、9d、12d的表達(dá)情況。本研究有如下結(jié)果:1.對(duì)秦川肉牛初生犢牛背最長(zhǎng)肌、皮下脂肪、心臟、肝臟、脾臟、腎臟、肺、皺胃八個(gè)組織進(jìn)行采樣,進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序并對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)量分析,結(jié)果表示約90%的reads可以比對(duì)到參考基因組上,99%的數(shù)據(jù)為高質(zhì)量數(shù)據(jù),所以我們可以肯定所得測(cè)序數(shù)據(jù)真實(shí)可靠,可以用于下一步的研究。2.經(jīng)測(cè)序得到這些reads在基因組位置、在染色體上分布情況以及表達(dá)水平和表達(dá)差異性。3.得到了在各個(gè)組織中表達(dá)的長(zhǎng)鏈非編碼RNA。通過對(duì)長(zhǎng)鏈非編碼RNA表達(dá)差異性以及表達(dá)水平的研究,發(fā)現(xiàn)了在脂肪組織中特異性表達(dá)的17個(gè)長(zhǎng)鏈非編碼RNA。4.長(zhǎng)鏈非編碼RNA39520在秦川肉牛初生犢牛、6月齡、12月齡的脂肪組織中表達(dá)量逐漸升高,在12月齡秦川肉牛脂肪組織中表達(dá)量達(dá)到最高,此后有所波動(dòng),在秦川肉牛初生犢牛脂肪組織中表達(dá)量最低。5.長(zhǎng)鏈非編碼RNA39520在誘導(dǎo)分化的秦川肉牛前體脂肪細(xì)胞的第0至3天表達(dá)量逐漸升高,在第三天達(dá)到最高,并且與第0天、第12天成績(jī)顯著差異,此后表達(dá)量逐漸降低。綜上,本研究成功篩選并鑒定了在秦川肉牛脂肪組織中特異性表達(dá)的長(zhǎng)鏈非編碼RNA,并揭示了長(zhǎng)鏈非編碼RNA39520在不同時(shí)期秦川肉牛脂肪組織及誘導(dǎo)分化的秦川肉牛前體脂肪細(xì)胞中的表達(dá)特點(diǎn),為下一步研究其功能奠定基礎(chǔ)。
【學(xué)位授予單位】:西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S823.5
本文編號(hào):2626545
【學(xué)位授予單位】:西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S823.5
【參考文獻(xiàn)】
相關(guān)期刊論文 前2條
1 林清;昝林森;李廣;;肉牛高效育肥技術(shù)[J];中國(guó)牛業(yè)科學(xué);2009年02期
2 孔保華,陶菲,刁新平;中國(guó)肉牛產(chǎn)業(yè)的現(xiàn)狀和發(fā)展趨勢(shì)[J];肉類研究;2002年01期
,本文編號(hào):2626545
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