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云霄縣PRRS血清學(xué)調(diào)查及3株P(guān)RRSV GP5基因分析

發(fā)布時(shí)間:2020-03-30 12:10
【摘要】:豬繁殖與呼吸綜合征(PRRS)是對(duì)養(yǎng)豬業(yè)危害最大的疾病之一,每年給全世界帶來巨大的經(jīng)濟(jì)損失。PRRS可導(dǎo)致豬群出現(xiàn)精神倦怠,厭食發(fā)熱,早產(chǎn)、流產(chǎn)、死胎、木乃伊及弱仔等癥狀,并影響免疫調(diào)節(jié)功能。云霄縣是漳州市生豬重要基地之一,PRRS的流行也給云霄縣的養(yǎng)豬業(yè)帶來嚴(yán)峻的挑戰(zhàn)。本研究通過對(duì)豬群進(jìn)行PRRS抗體檢測(cè)和抗原檢測(cè),分析目前云霄縣PRRSV的流行及遺傳變異情況,為云霄縣對(duì)PRRS的防控提供理論基礎(chǔ)。本研究采集了云霄縣2013-2017年種豬場(chǎng)、商品代飼養(yǎng)場(chǎng)、散養(yǎng)場(chǎng)己免疫藍(lán)耳病疫苗的豬血清樣本共計(jì)3865份。對(duì)不同年份、季節(jié)的血清樣品進(jìn)行PRRS免疫陽(yáng)性率進(jìn)行調(diào)查。為進(jìn)一步了解云霄縣PRRSV的遺傳變異發(fā)生情況,本研究針對(duì)GP5基因設(shè)計(jì)一對(duì)特異性引物,對(duì)采集的臨床病料進(jìn)行RT-PCR檢測(cè)并進(jìn)行測(cè)序,從陽(yáng)性樣品中選取3株同源性較低的基因序列進(jìn)行分析。對(duì)測(cè)序序列進(jìn)行抗原位點(diǎn)、糖基化位點(diǎn)、磷酸化位點(diǎn)、跨膜結(jié)構(gòu)、二級(jí)結(jié)構(gòu)分析,并與NCBI里的參考毒株序列進(jìn)行比對(duì)分析。本研究取得如下結(jié)果:1.2013-2017年豬血清PRRS抗體陽(yáng)性率最高的是2013年(84.85%),最低的是2014年(82.90%);不同類型養(yǎng)殖場(chǎng)的抗體陽(yáng)性率存在差異,抗體陽(yáng)性率的大小排列順序?yàn)榉N豬場(chǎng)(87.73%)商品代飼養(yǎng)場(chǎng)(83.13%)散養(yǎng)戶(77.50%)。豬群夏秋兩季的抗體陽(yáng)性率明顯高于冬春兩季。2.經(jīng)測(cè)序分析表明,3株P(guān)RRSV與參考株的同源性在61.9%-99.5%之間。FJYX-1相對(duì)參考株,在第23、41位氨基酸出現(xiàn)了磷酸化位點(diǎn)變異,FJYX-2在第23位氨基酸出現(xiàn)了磷酸化位點(diǎn)變異;FJYX-3序列相對(duì)參考株未見明顯變異。3株P(guān)RRSV糖基化位點(diǎn)未見明顯變異。將3株P(guān)RRSV GP5蛋白氨基酸序列與參考株進(jìn)行比對(duì)分析表明,FJYX-1第15、23、41、196位氨基酸位點(diǎn)分別發(fā)生了脯氨酸、絲氨酸、絲氨酸、精氨酸變異,FJYX-2第23、151、196位氨基酸分別發(fā)生了絲氨酸、賴氨酸、精氨酸變異,FJYX-3第28、33、193、196位氨基酸分別發(fā)生了脯氨酸、谷氨酰酸、丙氨酸、組氨酸變異。對(duì)所測(cè)序列翻譯成氨基酸后進(jìn)行同源性分析(圖3-5)抗原肽段預(yù)測(cè)結(jié)果表明這3個(gè)毒株的GP5蛋白存在7-8個(gè)抗原位點(diǎn),其中FJYX-2毒株抗原位點(diǎn)多出了一個(gè)143-NFLLDTK-149抗原肽段。綜上所述,目前云霄縣的PRRS免疫陽(yáng)性率較好。從實(shí)驗(yàn)分析的3株P(guān)RRSV與參考毒株對(duì)比結(jié)果來看,糖基化位點(diǎn)未見明顯的變異,而磷酸化位點(diǎn)、氨基酸位點(diǎn)和抗原肽段都存在一定程度的變異,我們需要密切監(jiān)視PRRSV的變異情況,為云霄縣PRRSV的防控提供有效的理論依據(jù)。
【圖文】:

序列,遺傳進(jìn)化,毒株,病料


2結(jié)果逡逑2.1臨床病料PRRSV檢測(cè)逡逑根據(jù)所設(shè)計(jì)的PRRSV引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,試驗(yàn)結(jié)果表明(圖3-1),陽(yáng)性逡逑樣品能夠擴(kuò)增出1條約603bp的條帶,與預(yù)期片段大小相符,而陰性對(duì)照并未出逡逑現(xiàn)特異性條帶。對(duì)云霄縣動(dòng)物疾病預(yù)防控制中心2013-2017保存臨床病料32份逡逑進(jìn)行RT-PCR,結(jié)果顯示,有12份的病料檢測(cè)為PRRSV陽(yáng)性,陽(yáng)性率為37.5%。逡逑M邋1邐2逡逑750逡逑500邋'IHwM'逡逑圖3-1邋PRRSV陽(yáng)性病料PCR檢測(cè)結(jié)果逡逑Fig.邋3-1邋PCR邋results邋of邋PRRSv邋positive邋venereal邋diseases逡逑M:質(zhì)量分析DL2000邋1.陰性對(duì)照2.陽(yáng)性樣品逡逑M:DL2000邋marker邋1.邋Negative邋control邋2.邋Positive邋sample逡逑2.2邋3株PRRSV毒株測(cè)序及分析逡逑PCR產(chǎn)物送生物公司測(cè)序,,選。保矖l測(cè)序結(jié)果中3條同源性相對(duì)較低的逡逑序列見附錄A。對(duì)測(cè)得的序列進(jìn)行遺傳進(jìn)化分析(圖3-2)。結(jié)果顯示,FJYX-1、逡逑FJYX-2、FJYX-3都與HuN、TJ和JXA1等藍(lán)耳病毒株同屬一個(gè)分支,而與MN184、逡逑LV、NADC-30等毒株遺傳距離相對(duì)較遠(yuǎn)。對(duì)所測(cè)序列進(jìn)行同源性分析(圖3-3),逡逑結(jié)果顯示,3株序列同源性在92.9%-96.7%之間,FJYX-1和FJYX-3,同源性最逡逑24逡逑

基因


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本文編號(hào):2607527

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