【摘要】：本文以內(nèi)蒙古絨山羊?yàn)樵囼?yàn)?zāi)Ｐ?利用RNA-seq測序技術(shù)對兩組(A組BMI≥90、B組BMI80)山羊下丘腦、垂體、肌肉樣品進(jìn)行高通量測序,篩選出兩組間差異表達(dá)基因,并對其進(jìn)行GO功能富集分析和Pathway富集分析,確定差異表達(dá)基因參與的最重要的生物學(xué)代謝途徑和信號通路,從而為絨山羊肥胖的調(diào)控機(jī)制研究提供依據(jù)。主要研究成果如下：1、成功地構(gòu)建了6只內(nèi)蒙古絨山羊下丘腦、垂體、肌肉共18個(gè)轉(zhuǎn)錄組的樣本文庫,基于RNA-Seq高通量測序技術(shù),共獲得68GB的表達(dá)譜數(shù)據(jù)。2、通過比較A、B兩組山羊差異表達(dá)基因,得到如下結(jié)果：下丘腦共有4900個(gè)差異表達(dá)基因,其中4398個(gè)基因顯著上調(diào),502個(gè)基因顯著下調(diào)；垂體共有721個(gè)差異表達(dá)基因,其中298個(gè)基因顯著上調(diào),423個(gè)基因顯著下調(diào)；肌肉共有686個(gè)差異表達(dá)基因,其中276個(gè)基因顯著上調(diào),410個(gè)基因顯著下調(diào)。3、通過共差異表達(dá)基因維恩分析,得到如下結(jié)果：下丘腦與垂體共差異表達(dá)基因196個(gè)；下丘腦與肌肉共差異表達(dá)基因170個(gè)；垂體與肌肉共差異表達(dá)基因48個(gè)；下丘腦、垂體、肌肉共差異表達(dá)基因33個(gè)。4、本研究通過對差異表達(dá)基因進(jìn)行Pathway富集分析,得到結(jié)果如下：①下丘腦可能通過焦點(diǎn)粘連、肌動(dòng)蛋白細(xì)胞骨架的調(diào)控、ECM受體相互作用、氧化磷酸化、TGF-β信號通路、磷脂酰肌醇信號通路、ErbB信號通路、MAPK信號通路、鈣離子信號通路、胰島素信號通路、Notch信號通路和FcyR介導(dǎo)吞噬作用來調(diào)節(jié)山羊肥胖；垂體可能通過神經(jīng)活性配體-受體相互作用和緊密連接調(diào)控山羊肥胖；肌肉則可能通過焦點(diǎn)粘連、ECM受體相互作用、胰島素信號通路、丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代謝、苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸生物合成、脂肪細(xì)胞因子信號通路、細(xì)胞粘附分子(CAMs)和糖酵解來調(diào)控肥胖。②下丘腦和垂體之間可能通過細(xì)胞因子與受體相互作用調(diào)控肥胖；下丘腦和肌肉可能通過ECM受體相互作用和果糖及甘露糖代謝；垂體與肌肉則可能通過趨化因子信號通路影響肥胖。5、本研究發(fā)現(xiàn),ECM受體相互作用、趨化因子信號通路及AQP1、ADAMTS2、 UBE2L6和ZBTB16基因在下丘腦-垂體-肌肉軸調(diào)控肥胖時(shí)極有可能起著重要作用。
【圖文】：

ｄｉｆｆ來分析基因差異表達(dá)。圖５為轉(zhuǎn)錄組分析的一般流程。逡逑ｊ邐…—邋Ｉ邋Ａ＊�；卞义线姟�？？逡逑Ｍａｐｐｅｄ邐＾＾ａｐ４＞ｅｓＳ逡逑ＬＥＥＵ—＼產(chǎn)…＇－叫…逡逑ＹＶ邋－逡逑Ｓｔｅｐ》邐＇？＇、逡逑、＼逡逑Ｌ＝Ｊ－嚴(yán)－－逡逑

Ｆｉｇ．邋１１邋Ｇｅｎｅ邋ｏｍｏｌｏｇｙ邋ｏｆ邋ｄｉｆｆｅｒ前ｔ邋ｅｘｐｒｅｓｓｉｏ打邋ｇｅｎｅｓ邋ｏｆ邋ｍｕｓｃｌｅ逡逑表６差異表達(dá)基因參與的生物過程ＧＯ分析逡逑Ｔａｂｌｅ．６邋ＢｉｏｌｏTBｉｃａｌ邋ｐｒｏｃｅｓｓ邋ｏｆ邋ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ邋ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ邋ｇｅｎｅｓ逡逑巧ｏｒｙ邐ＧＯ邋Ｔｅｒｍｓ邐Ｄ巧ｃｒｉｐｔｉｏｎ邐Ｃｏｕｎｔ邋Ｐ－ｖａｌｕｅ邋Ｂｅｎｊｉａｍｉｎｉ逡逑ｖｓ＿ＢＨ邋００：０００６７９３邐ｐｈｏ巧ｈｏｒｕｓ邋ｍR%ａｂｏｌｉｃ邋ｐｒｏｃｅｓｓ邐２０５邐２．８０Ｅ－０７邐１．２０Ｅ－０３逡逑ｐｏｓｉｔｉｖｅ邋ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ邋ｏｆ邋ｍａｃｒｏｍｏｌｅｃｕｌｅ邋ｍｅｔａｂｏｌｉｃ逡逑００：００１０６０４邐１７９邐３．２０Ｅ－０６邐６．６０Ｅ－０３逡逑ｐｒｏｃｅｓｓ逡逑００：００１６３１０邐Ｐｈｏｓｐｈｏｒｙｌａｔｉｏｎ邐１６７邐７．３０Ｅ－０６邐Ｉ．ＯＯＥ－０２逡逑００：００２２６１０邐ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ邋ａｄｈｅｓｉｏｎ邐１４８邐１．４０Ｅ－０５邐ＬｌＯＥ－０２逡逑００：０００７１５５邐ｃｅｌｌ邋ａｄｈｅｓｉｏｎ邐１４７邐２．００Ｅ－０５邐１．４０Ｅ－０２逡逑ｒｅTBＩｌｌａｔｉｏｎ邋ｏｆ邋ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ邋ｆｒｏｍ邋民ＮＡ逡逑００：０００６３５７邐１４１邐１．２０Ｅ－０３邐２．２０Ｅ－０１逡逑ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ邋ＩＩ邋ｐｒｏｍｏｂｒ逡逑００：０００７０４９邐ｃｅｌｌ邋ｃｙｃｌｅ邐１４５邐４．４０Ｅ－０３邐２．９０Ｅ－０１逡逑００：００１０９４１邐ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ邋ｏｆ邋ｃｅｌｌ邋ｄｅａｔｈ邐１５０邐６．７０Ｅ－０３邐３．３０Ｅ－０１逡逑００：００４３０６７邐ｒｅｇｕｌａｔ
【學(xué)位授予單位】：內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：S827

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前3條

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本文編號：2602225