絨山羊下丘腦-垂體-肌肉軸轉錄組比較分析
發(fā)布時間:2020-03-27 01:08
【摘要】:本文以內蒙古絨山羊為試驗模型,利用RNA-seq測序技術對兩組(A組BMI≥90、B組BMI80)山羊下丘腦、垂體、肌肉樣品進行高通量測序,篩選出兩組間差異表達基因,并對其進行GO功能富集分析和Pathway富集分析,確定差異表達基因參與的最重要的生物學代謝途徑和信號通路,從而為絨山羊肥胖的調控機制研究提供依據(jù)。主要研究成果如下:1、成功地構建了6只內蒙古絨山羊下丘腦、垂體、肌肉共18個轉錄組的樣本文庫,基于RNA-Seq高通量測序技術,共獲得68GB的表達譜數(shù)據(jù)。2、通過比較A、B兩組山羊差異表達基因,得到如下結果:下丘腦共有4900個差異表達基因,其中4398個基因顯著上調,502個基因顯著下調;垂體共有721個差異表達基因,其中298個基因顯著上調,423個基因顯著下調;肌肉共有686個差異表達基因,其中276個基因顯著上調,410個基因顯著下調。3、通過共差異表達基因維恩分析,得到如下結果:下丘腦與垂體共差異表達基因196個;下丘腦與肌肉共差異表達基因170個;垂體與肌肉共差異表達基因48個;下丘腦、垂體、肌肉共差異表達基因33個。4、本研究通過對差異表達基因進行Pathway富集分析,得到結果如下:①下丘腦可能通過焦點粘連、肌動蛋白細胞骨架的調控、ECM受體相互作用、氧化磷酸化、TGF-β信號通路、磷脂酰肌醇信號通路、ErbB信號通路、MAPK信號通路、鈣離子信號通路、胰島素信號通路、Notch信號通路和FcyR介導吞噬作用來調節(jié)山羊肥胖;垂體可能通過神經(jīng)活性配體-受體相互作用和緊密連接調控山羊肥胖;肌肉則可能通過焦點粘連、ECM受體相互作用、胰島素信號通路、丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代謝、苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸生物合成、脂肪細胞因子信號通路、細胞粘附分子(CAMs)和糖酵解來調控肥胖。②下丘腦和垂體之間可能通過細胞因子與受體相互作用調控肥胖;下丘腦和肌肉可能通過ECM受體相互作用和果糖及甘露糖代謝;垂體與肌肉則可能通過趨化因子信號通路影響肥胖。5、本研究發(fā)現(xiàn),ECM受體相互作用、趨化因子信號通路及AQP1、ADAMTS2、 UBE2L6和ZBTB16基因在下丘腦-垂體-肌肉軸調控肥胖時極有可能起著重要作用。
【圖文】:
diff來分析基因差異表達。圖5為轉錄組分析的一般流程。逡逑j邐…—邋I邋A*;卞义线姟?逡逑Mapped邐^^ap4>esS逡逑LEEU—\產(chǎn)…'-叫…逡逑YV邋-逡逑Step》邐'?'、逡逑、\逡逑L=J-嚴--逡逑
Fig.邋11邋Gene邋omology邋of邋differ前t邋expressio打邋genes邋of邋muscle逡逑表6差異表達基因參與的生物過程GO分析逡逑Table.6邋BioloTBical邋process邋of邋different邋expression邋genes逡逑巧ory邐GO邋Terms邐D巧cription邐Count邋P-value邋Benjiamini逡逑vs_BH邋00:0006793邐pho巧horus邋mR%abolic邋process邐205邐2.80E-07邐1.20E-03逡逑positive邋regulation邋of邋macromolecule邋metabolic逡逑00:0010604邐179邐3.20E-06邐6.60E-03逡逑process逡逑00:0016310邐Phosphorylation邐167邐7.30E-06邐I.OOE-02逡逑00:0022610邐biological邋adhesion邐148邐1.40E-05邐LlOE-02逡逑00:0007155邐cell邋adhesion邐147邐2.00E-05邐1.40E-02逡逑reTBIllation邋of邋transcription邋from邋民NA逡逑00:0006357邐141邐1.20E-03邐2.20E-01逡逑polymerase邋II邋promobr逡逑00:0007049邐cell邋cycle邐145邐4.40E-03邐2.90E-01逡逑00:0010941邐regulation邋of邋cell邋death邐150邐6.70E-03邐3.30E-01逡逑00:0043067邐regulat
【學位授予單位】:內蒙古農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2015
【分類號】:S827
本文編號:2602225
【圖文】:
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【學位授予單位】:內蒙古農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2015
【分類號】:S827
【參考文獻】
相關期刊論文 前3條
1 李紅政,雷美英,姚樹橋;社會心理因素與單純性肥胖[J];國外醫(yī)學(社會醫(yī)學分冊);2001年01期
2 周華;張新;劉騰云;余發(fā)新;;高通量轉錄組測序的數(shù)據(jù)分析與基因發(fā)掘[J];江西科學;2012年05期
3 祁艷霞;張小輝;王玉琴;王丹丹;郭釗;劉佩;;牛肌肉組織中膠原和ADAMTS2基因表達與肉質的相關性分析[J];云南農(nóng)業(yè)大學學報(自然科學);2014年02期
相關博士學位論文 前2條
1 于太永;脂肪細胞因子leptin和TNF-α對豬骨骼肌成肌細胞增殖分化的影響及其機制[D];西北農(nóng)林科技大學;2007年
2 王淑輝;利用基因芯片對閹割引起牛生長發(fā)育和脂肪沉積變化分子機理的研究[D];中國農(nóng)業(yè)科學院;2008年
,本文編號:2602225
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/dongwuyixue/2602225.html
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