發(fā)布時間：2019-11-07 08:21

【摘要】：為了確定鴨坦布蘇病毒(duck Tembusu virus,DTMUV)發(fā)揮甲基轉(zhuǎn)移酶(methyltransferase,MTase)功能的氨基酸序列。本研究運用生物信息學(xué)方法,以已知的黃病毒MTase的序列和結(jié)構(gòu)為模板,對GenBank上注入的DTMUV MTase序列進(jìn)行同源比對分析和結(jié)構(gòu)預(yù)測。分析結(jié)果表明,DTMUV MTase與WNV,DENV-2,JEV三種病毒MTase的核酸序列同源性分別為64.76%,64.55%,67.33%,氨基酸序列同源性分別為74.71%,68.45%,75.15%;其可能結(jié)構(gòu)含有SAM結(jié)合位點且具有典型的4個α螺旋和7個β折疊的黃病毒MTase的結(jié)構(gòu)特點;同時,DTMUV MTase序列上存在黃病毒MTase經(jīng)典保守位點K-D-K-E;從而為確定DTMUV MTase屬于黃病毒MTase家族成員提供一些理論依據(jù)。

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