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犬細(xì)小病毒SH15株的分離鑒定與全基因組分析

發(fā)布時(shí)間:2019-04-01 23:39
【摘要】:為了解上海地區(qū)犬細(xì)小病毒的流行及其變異情況,從疑似犬細(xì)小病毒感染的死亡犬采集各種組織,無(wú)菌處理病料后同步接種F81細(xì)胞,盲傳至第5代出現(xiàn)細(xì)胞病變,從腸組織中分離出1株病毒。采用電鏡進(jìn)行病毒形態(tài)學(xué)觀察,以及HA、HI和PCR等方法鑒定病毒,結(jié)果證實(shí)為犬細(xì)小病毒,命名為CPV-SH15。該病毒的血凝效價(jià)為2~9,病毒TCID_(50)為10~(5.2)/m L,測(cè)得病毒編碼區(qū)基因序列的全長(zhǎng)為4 869 bp,與上海分離毒株CPV/CN/SH1/2013的同源性為99.8%,親緣關(guān)系較近,說(shuō)明上海地區(qū)的犬細(xì)小病毒的遺傳變異并不明顯。對(duì)其VP2基因的氨基酸序列進(jìn)行分析,確定該細(xì)小病毒屬于New CPV-2a亞型。該研究為犬細(xì)小病毒遺傳進(jìn)化的進(jìn)一步研究奠定了基礎(chǔ),從而為犬細(xì)小病毒病疫苗的研制以及防控提供參考。
[Abstract]:In order to understand the prevalence and variation of canine parvovirus (DPV) in Shanghai area, various tissues were collected from dead dogs suspected of canine parvovirus infection. After aseptic treatment, F81 cells were inoculated at the same time, and the cells were transmitted blindly to the 5th generation. A strain of virus was isolated from intestinal tissue. The morphology of the virus was observed by electron microscope, and the virus was identified by HA,HI and PCR. The virus was confirmed to be canine parvovirus, named CPV-SH15.. The hemagglutination titer and TCID _ (50) of the virus were 2 and 10 ~ (5.2) / mL, respectively. The full-length sequence of the coding region of the virus was 4 869 bp, and the homology was 99.8% with that of CPV/CN/SH1/2013 isolated from Shanghai. The relative relationship showed that the genetic variation of canine parvovirus in Shanghai was not obvious. The amino acid sequence of the VP2 gene was analyzed and the parvovirus belonged to New CPV-2a subtype. This study lays a foundation for further study on the genetic evolution of canine parvovirus and provides reference for the development and control of canine parvovirus disease vaccine.
【作者單位】: 上海交通大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物學(xué)院上海市獸醫(yī)生物技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;上海市寶山區(qū)動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(31672524)
【分類號(hào)】:S852.655

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本文編號(hào):2452015

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