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絨山羊骨骼肌高肉堿相關(guān)基因的篩選

發(fā)布時(shí)間:2019-03-05 16:20
【摘要】:L-肉堿是人體必需營(yíng)養(yǎng)素,且可用作減肥的保健品。內(nèi)蒙古絨山羊肌肉中肉堿含量較其他動(dòng)物高,而且目前沒(méi)有關(guān)于不同部位肌肉中肉堿含量情況的研究,也不清楚調(diào)控肉堿含量的相關(guān)基因。因此,找出調(diào)控肉堿含量的基因,對(duì)于今后有關(guān)肉堿的研究及羊肉精細(xì)分割出售具有重要意義。本研究以內(nèi)蒙古絨山羊?yàn)檠芯繉?duì)象,利用高效液相色譜法(HPLC)測(cè)定了絨山羊不同部位肌肉組織中總?cè)鈮A含量,通過(guò)RNA-Seq技術(shù)對(duì)肉堿含量較高的股四頭肌,以及肉堿含量較低的股二頭肌以及心臟轉(zhuǎn)錄組文庫(kù)進(jìn)行高通量測(cè)序,對(duì)差異基因進(jìn)行功能注釋和富集性分析,將肉堿相關(guān)基因與差異基因中結(jié)合篩選出絨山羊骨骼肌高肉堿含量的候選基因,從而為進(jìn)一步研究絨山羊骨骼肌肉堿含量提供研究依據(jù)與思路,為實(shí)現(xiàn)絨山羊肉類精細(xì)分割,為給企業(yè)創(chuàng)造更大的利潤(rùn)提供可能。本研究主要研究結(jié)果如下:1、利用HPLC測(cè)定了絨山羊12個(gè)不同部位肌肉總?cè)鈮A含量。其中骨骼肌肉堿含量(1203.53-1231.53mg/kg)整體高于心肌(413.45-479.45mg/kg);骨骼肌中半膜肌含量最高,股四頭肌次之,股二頭肌最低;總體上肉堿含量為:后腿肌肉肩背部肌肉前腿肌肉。2、成功構(gòu)建了內(nèi)蒙古絨山羊股二頭肌、股四頭肌和心臟轉(zhuǎn)錄組文庫(kù),利用RNA-Seq技術(shù)進(jìn)行高通量測(cè)序,得到7.2GB原始測(cè)序數(shù)據(jù)。通過(guò)TopHat軟件比對(duì)分析,得出股二頭肌與股四頭肌差異表達(dá)基因共1864個(gè);股二頭肌與心臟差異表達(dá)基因共993個(gè);股四頭肌與心臟差異表達(dá)基因共2770個(gè)。3、差異表達(dá)基因GO功能注釋結(jié)果表明:差異基因主要與肌肉發(fā)育、葡萄糖代謝、ATP代謝、氧化磷酸化、泛素化、囊泡介導(dǎo)的轉(zhuǎn)運(yùn)和線粒體相關(guān);KEGG通路富集分析表明:差異基因主要參與PPAR信號(hào)通路、胰島素信號(hào)通路和MAPK信號(hào)通路。4、結(jié)合Geneontology網(wǎng)站上的肉堿相關(guān)基因,篩選出絨山羊骨骼肌高肉堿含量的9個(gè)候選基因,分別為:PDZK1、CDV3、ACADL、PRKAA2、PRKAB2、MOBAT1、 NAT6、PLA2G15和HRASLS。5、進(jìn)化樹分析可知:PDZK1、CDV3、ACADL、PRKAA2、MOBAT1、PLA2G15和HRASLS在山羊、綿羊和牛,大鼠和小鼠中同源性高,且保守性強(qiáng);山羊PRKAB2與其他物種同源性低且變異大;雞的PDZK1、CDV3、PRKAA2、PRKAB2、MOBAT1、 PLA2G15和HRASLS基因與其他物種的同源性均較低。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:S827

【參考文獻(xiàn)】

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1 徐少輝;武書庚;張海軍;岳洪源;齊廣海;;L-肉堿生理作用及其機(jī)理的研究進(jìn)展[J];動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)學(xué)報(bào);2011年03期

2 劉美蓮;過(guò)氧化物酶體增殖物激活受體研究的新進(jìn)展[J];國(guó)外醫(yī)學(xué)(生理、病理科學(xué)與臨床分冊(cè));2001年05期

3 王金雷;朱慶;劉益平;杜華銳;;雞PRKAB2基因PCR-SSCP分析及其與屠宰性狀和肉質(zhì)性狀的相關(guān)性[J];遺傳;2008年08期

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本文編號(hào):2435087

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