【摘要】：為了闡明miR-449b和miR-222對貴州從江香豬睪丸發(fā)育的調(diào)節(jié)作用。運用qPCR方法檢測香豬睪丸組織中miR-449b和miR-222表達量的發(fā)育性變化,通過miRSystem數(shù)據(jù)庫、Kobas數(shù)據(jù)庫對預(yù)測的靶基因進行信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路富集分析。經(jīng)克隆測序,得到香豬miR-222序列,與豬的相似性為100%,而且物種之間miR-449b和miR-222兩個分子的保守性都很高。香豬睪丸中miR-449b于1~4月齡期間的表達量逐漸上升,4月齡時表達量達到峰值,之后下降;miR-222的表達量呈現(xiàn)相反的變化趨勢,于1~4月齡期間表達量逐漸下降,1月齡時最高,4月齡時最低,之后的表達量有所回升;已知物種的miR-449b和miR-222序列高度保守;經(jīng)預(yù)測miR-449b靶基因有420個,富集于卵母細胞減數(shù)分裂、Notch信號通路、Ras信號通路等100個途徑(P0.05),miR-222的靶基因有429個,富集于細胞周期、Fox O信號通路、TGF-β信號通路等69個通路(P0.05);miR-449b和miR-222的靶基因共享的通路為Wnt信號通路、MAPK信號通路、雌激素信號通路等42個(P0.05)。
[Abstract]:In order to elucidate the regulatory effects of miR-449b and miR-222 on testicular development of Congjiang Xiang pigs in Guizhou Province. The developmental changes of miR-449b and miR-222 expression in testis tissue of Xiang pig were detected by qPCR. The predicted target genes were enriched by signal transduction pathway by miRSystem database and Kobas database. After cloning and sequencing, the sequence of Xiang pig miR-222 was 100% similar to that of pig, and the conservatism of miR-449b and miR-222 among species was very high. The expression of miR-449b in the testis of Xiang pig increased gradually from 1 to 4 months old, reached the peak at 4 months old, and then decreased. The expression of miR-222 decreased gradually at the age of 1-4 months, the highest at 1 month, the lowest at 4 months, and then increased, and the miR-449b and miR-222 sequences of the known species were highly conserved. It was predicted that there were 420target genes of miR-449b, which were enriched in meiosis of oocytes, Notch signaling pathway, Ras signaling pathway and so on (P0.05). 429 target genes of miR-222 were enriched in, Fox O signaling pathway of cell cycle. 69 pathways such as TGF- 尾 signaling pathway (P0.05); The target genes of miR-449b and miR-222 shared 42 pathways such as Wnt signal pathway, MAPK signal pathway, estrogen signal pathway and so on (P0.05).
【作者單位】： 貴州大學動物科學學院;貴州大學省農(nóng)業(yè)生物工程研究院;
【基金】：國家高技術(shù)研究發(fā)展計劃(863計劃)課題(2013AA1-02503) 貴州省農(nóng)業(yè)攻關(guān)項目(黔科合NY[2013]3073號) 貴州省“百”層次創(chuàng)新型人才項目(黔科合人才2016-4012號) 國家自然科學基金(31672390)
【分類號】：S828

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本文編號：2433843