【摘要】：為研究綿羊(Ovis aries)酪氨酸蛋白激酶受體(tyrosine kinase A,Trk A)基因組織表達(dá)特征及其SNPs與產(chǎn)羔性狀的關(guān)聯(lián)性,本研究以Trk A基因?yàn)檠芯繉?duì)象,利用q RT-PCR分析其在湖羊心、肝、脾、肺、腎、瘤胃、十二指腸、背最長(zhǎng)肌、脂肪、下丘腦、垂體和卵巢等12種組織中的表達(dá)水平,同時(shí)采用DNA混合池測(cè)序和限制性長(zhǎng)度片段多態(tài)性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)等技術(shù)檢測(cè)Trk A基因在963只有產(chǎn)羔記錄湖羊(n=526)和小尾寒羊(n=437)群體中的多態(tài)性,及其與產(chǎn)羔性狀的關(guān)聯(lián)性。結(jié)果表明,Trk A基因在卵巢、肺和肝臟中的表達(dá)水平最高,在心臟中次之,在背最長(zhǎng)肌、瘤胃、脂肪、下丘腦、垂體、脾、腎和十二指腸間表達(dá)量較低。通過DNA池測(cè)序和RFLP分析,在Trk A基因的內(nèi)含子9和14分別檢測(cè)到NC_019458.2:g.105281586CT和NC_019458.2:g.105284246GC兩個(gè)突變。在NC_019458.2:g.105281586CT位點(diǎn),小尾寒羊和湖羊群體中均檢測(cè)到3種基因型,分別為CC、CT和TT型,其中CT為優(yōu)勢(shì)基因型,C為優(yōu)勢(shì)等位基因;在該位點(diǎn),湖羊群體遺傳雜合度(heterozygosity,He)和遺傳純合度(homozygosity,Ho)均為0.50,有效等位基因數(shù)(effective allele numbers,Ne)為1.99;小尾寒羊He=0.51,Ho=0.49,Ne=1.95;多態(tài)信息含量(polymorphic information content,PIC)均為0.37,且在小尾寒羊群體中偏離了Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)。在NC_019458.2:g.105284246GC位點(diǎn)上同樣檢測(cè)到GG、GC和CC三種基因型,其中GC為優(yōu)勢(shì)基因型,C為優(yōu)勢(shì)等位基因;該位點(diǎn)在湖羊群體He和Ho均為0.50,Ne=2.00;小尾寒羊He=0.49,Ho=0.51,Ne=1.96。PIC均為0.37;χ2適合性檢驗(yàn)結(jié)果表明,湖羊群體在該位點(diǎn)顯著偏離于HardyWeinberg平衡狀態(tài)。多態(tài)位點(diǎn)與綿羊產(chǎn)羔數(shù)的關(guān)聯(lián)性分析表明,NC_019458.2:g.105281586CT與湖羊和小尾寒羊的產(chǎn)羔數(shù)顯著相關(guān)(P0.05),而NC_019458.2:g.105284246GC突變位點(diǎn)僅與湖羊的產(chǎn)羔性能顯著相關(guān)(P0.05)。本研究結(jié)果表明,Trk A基因可作為綿羊產(chǎn)羔性狀早期篩選的候選基因,其SNPs可為綿羊繁殖性狀分子標(biāo)記輔助選擇提供依據(jù)。
[Abstract]:In order to study the expression characteristics of sheep (Ovis aries) tyrosine protein kinase receptor (tyrosine kinase (tyrosine kinase Trk A gene and the relationship between SNPs and lambing traits, the Q RT-PCR was used to analyze the expression of Trk A gene in the heart and liver of Hu sheep. The expression levels of spleen, lung, kidney, rumen, duodenum, longissimus dorsi muscle, fat, hypothalamus, pituitary and ovary were detected by DNA mixed pool sequencing and restriction fragment polymorphism (restriction fragment length polymorphism,). RFLP and other techniques were used to detect the polymorphism of Trk A gene in 963 lambing only recorded populations of Hu Sheep (nong526) and small tail Han Sheep (nb437), and their association with lambing traits. The results showed that the expression of, Trk A gene was the highest in ovary, lung and liver, followed by heart, and lower in longissimus dorsi, rumen, fat, hypothalamus, pituitary, spleen, kidney and duodenum. NC_019458.2:g.105281586CT and NC_019458.2:g.105284246GC mutations were detected in intron 9 and 14 of Trk A gene by DNA pool sequencing and RFLP analysis, respectively. At the NC_019458.2:g.105281586CT locus, three genotypes, CC,CT and TT, were detected in small tail Han sheep and Hu sheep, respectively, in which CT was the dominant genotype and C was the dominant allele. At this locus, the genetic heterozygosity (heterozygosity,He) and genetic homozygosity (homozygosity,Ho) of Hu sheep population were 0.50, and the effective allele number (effective allele numbers,Ne was 1.99.The small tail Han sheep was He=0.51,Ho=0.49,Ne=1.95;. The polymorphic information content (polymorphic information content,PIC) was 0.37, and deviated from the Hardy-Weinberg equilibrium state in the small tail Han sheep population. Three genotypes of GG,GC and CC were also detected at the NC_019458.2:g.105284246GC locus, in which GC was the dominant genotype and C was the dominant allele, and this locus was 0.50 Nefeng 2.00 in both He and Ho of Hu sheep population. The results of 蠂 2 fitness test showed that the population of Hu sheep deviated significantly from the equilibrium state of HardyWeinberg at this site. The correlation analysis between polymorphic loci and lambing size showed that NC_019458.2:g.105281586CT was significantly correlated with litter size of Hu sheep and small tail Han sheep (P0.05). However, the NC_019458.2:g.105284246GC mutation site was only significantly correlated with the lambing performance of Hu sheep (P0.05). The results showed that, Trk A gene could be used as a candidate gene for early screening of lamb traits and its SNPs could provide a basis for molecular marker-assisted selection of sheep reproductive traits.
【作者單位】： 甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)技術(shù)學(xué)院;青海大學(xué)農(nóng)牧學(xué)院;蘭州大學(xué)草地農(nóng)業(yè)科技學(xué)院;甘肅省肉羊繁育生物技術(shù)工程實(shí)驗(yàn)室;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.31472072) 國(guó)家肉羊現(xiàn)代肉羊產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)(No.CARS-39)
【分類號(hào)】：S826

【參考文獻(xiàn)】

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2 陳曉勇;孫洪新;田樹軍;敦偉濤;;BMPR1B基因在寒泊肉羊世代選育中的遺傳變異及其與產(chǎn)羔性狀的關(guān)聯(lián)分析[J];河北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);2015年02期

3 劉榮;;蒙古羊多羔性狀候選基因ADAMTS1的遺傳效應(yīng)分析[J];現(xiàn)代農(nóng)業(yè);2014年04期

4 張麗;仇雪梅;王娟;姜志強(qiáng);劉洋;王秀利;;紅鰭東方渶(Takifugu rubripes)MC4R基因的多態(tài)性分析[J];生物技術(shù)通報(bào);2012年07期

5 程美玲;趙素梅;黃英;高士爭(zhēng);;云嶺黑山羊FSH基因表達(dá)量與其產(chǎn)羔數(shù)相關(guān)性研究[J];云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2010年06期

6 馬永和;孫永峰;李純錦;周虛;;神經(jīng)生長(zhǎng)因子受體TrkA在母牛性腺及性腺外生殖器官中的表達(dá)研究[J];吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);2010年03期

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2 孫洪新;王紅娜;張英杰;劉月琴;陳曉勇;敦偉濤;;BMPR-IB基因的克隆及其在絨山羊成纖維細(xì)胞中的表達(dá)[J];畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào);2016年06期

3 陳曉勇;孫洪新;敦偉濤;;寒泊肉羊繁殖性能分析[J];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué);2015年16期

4 瞿長(zhǎng)偉;普少瑕;李春梅;;神經(jīng)生長(zhǎng)因子及其受體在動(dòng)物卵巢上的研究進(jìn)展[J];畜牧與獸醫(yī);2014年10期

5 張曉萌;馬普;王洪迪;王秀利;;SNPs在水產(chǎn)動(dòng)物中的研究進(jìn)展[J];生物技術(shù)通報(bào);2013年08期

6 朱琳琳;王秀利;王洪迪;郭曉黎;常亞青;劉洋;仇雪梅;;光棘球海膽CYP17基因的SNPs標(biāo)記篩選及遺傳分析[J];大連海洋大學(xué)學(xué)報(bào);2013年04期

7 陸晨;李萬(wàn)宏;陳樹雄;呂巖;周虛;;神經(jīng)生長(zhǎng)因子對(duì)豬卵丘細(xì)胞擴(kuò)散及卵母細(xì)胞體外成熟的影響[J];吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);2013年03期

8 劉立文;馬永和;李萬(wàn)宏;王春強(qiáng);周虛;;NGF對(duì)輸卵管黏膜上皮細(xì)胞促性腺激素受體表達(dá)的影響[J];中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào);2013年05期

9 朱曉玲;李成嬌;侯曉峰;石德順;劉慶友;周虛;;神經(jīng)生長(zhǎng)因子NGF及其受體TrkA在雌性水牛生殖器官的表達(dá)定位[J];吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);2011年03期

10 孫永峰;李純錦;馬永和;王春強(qiáng);張偉;周虛;;腦源性神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子在母牛性腺及性腺外生殖組織中的表達(dá)[J];吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);2010年04期

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1 楊偉平;藏豬腸道細(xì)菌群落組成與纖維素分解菌的研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2015年

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2 王志武;毛楊毅;李俊;趙鵬;郭宏宇;田暉;;陶賽特羊與小尾寒羊雜交羔羊肉用性能分析[J];中國(guó)草食動(dòng)物科學(xué);2014年01期

3 李潔;羅玉柱;李少斌;劉秀;成述儒;;甘肅高山細(xì)毛羊微衛(wèi)星遺傳多樣性及親子鑒定研究[J];農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào);2013年02期

4 張潤(rùn)鋒;林亞秋;李曉峰;鄭靜;汪曉菲;;3個(gè)黃牛品種Y-STR多態(tài)性[J];西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào);2012年11期

5 敦偉濤;陳曉勇;田樹軍;孫洪新;董玉玲;譚志偉;李盼霞;劉桐令;;杜泊綿羊與小尾寒羊雜交自群繁育后代生產(chǎn)性能研究[J];華北農(nóng)學(xué)報(bào);2011年S2期

6 孫洪新;敦偉濤;陳曉勇;田樹軍;譚薇;;BMPR-IB基因多態(tài)性與河北肉用綿羊產(chǎn)羔數(shù)及羔羊生長(zhǎng)發(fā)育的相關(guān)性研究[J];黑龍江畜牧獸醫(yī);2011年13期

7 王洪程;昝林森;宋付標(biāo);王洪寶;Ujan.J.A;鐘昕;辛亞平;;秦川牛微衛(wèi)星基因位點(diǎn)遺傳多樣性分析[J];中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào);2011年11期

8 孫洪新;敦偉濤;陳曉勇;田樹軍;譚薇;;不同品種BMPR-IB基因多態(tài)性與產(chǎn)羔數(shù)及發(fā)情季節(jié)的相關(guān)性研究[J];湖南農(nóng)業(yè)科學(xué);2011年03期

9 王斌;昝林森;楊彥杰;鐘昕;黃磊;王洪寶;;陜南水牛微衛(wèi)星DNA遺傳多樣性研究[J];西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2010年08期

10 王生寶;張英杰;劉月琴;孫洪新;;不同綿羊品種BMPR-IB基因多態(tài)性與產(chǎn)羔數(shù)的關(guān)系研究[J];湖南農(nóng)業(yè)科學(xué);2009年12期

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1 束婧婷;雞肌苷酸相關(guān)候選基因遺傳效應(yīng)及表達(dá)規(guī)律研究[D];揚(yáng)州大學(xué);2008年

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2 朱曉玲;李成嬌;侯曉峰;石德順;劉慶友;周虛;;神經(jīng)生長(zhǎng)因子NGF及其受體TrkA在雌性水牛生殖器官的表達(dá)定位[J];吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);2011年03期

3 羅振國(guó),張小云;神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子受體TrkA、TrkB、TrkC和TrkE在參環(huán)毛蚓體內(nèi)的分布[J];動(dòng)物學(xué)報(bào);2001年04期

4 卿素珠,張涌,徐永平;神經(jīng)生長(zhǎng)因子及其受體TrKA在山羊脊髓發(fā)育中的表達(dá)特點(diǎn)[J];中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào);2004年06期

5 ;[J];;年期

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2 ;The expression of TrkA in brain original neural stem cells of embryonic rat[A];Proceedings of the 7th Biennial Meeting and the 5th Congress of the Chinese Society for Neuroscience[C];2007年

3 Junwen Zhang;Lan Wang;Yuhe Yuan;Xiwu Hui;Beibei Ni;Hong Chen;Bingren Huang;;Snapin,a potential phosphorylation substrate of a tyrosine Kinase receptor TrkA[A];中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)會(huì)第十屆會(huì)員代表大會(huì)暨全國(guó)學(xué)術(shù)會(huì)議摘要集[C];2010年

4 梅旭暉;吳劍聰;于天源;;推拿對(duì)坐骨神經(jīng)損傷大鼠神經(jīng)生長(zhǎng)因子受體TrkA的影響[A];第十三次中醫(yī)推拿學(xué)術(shù)年會(huì)暨推拿手法治療脊柱相關(guān)疾病高級(jí)培訓(xùn)班論文匯編[C];2012年

5 王嵐;裘佳;陳虹;黃秉仁;;Snapin與TrkA相互作用對(duì)神經(jīng)遞質(zhì)釋放影響的研究[A];全國(guó)第十一屆生化與分子藥理學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文集[C];2009年

6 王黔艷;施靜;;電針抗大鼠局灶性腦缺血再灌注損傷的機(jī)制研究—TrkA受體信號(hào)通路對(duì)Src磷酸化的調(diào)節(jié)[A];節(jié)能環(huán)保 和諧發(fā)展——2007中國(guó)科協(xié)年會(huì)論文集（二）[C];2007年

7 田舜蓮;施靜;趙麗;曾燕;李伶俐;;電針治療腦缺血再灌注過程中TrkA對(duì)TRPM7表達(dá)水平的調(diào)節(jié)作用[A];中國(guó)神經(jīng)科學(xué)學(xué)會(huì)第六屆學(xué)術(shù)會(huì)議暨學(xué)會(huì)成立十周年慶祝大會(huì)論文摘要匯編[C];2005年

8 王國(guó)權(quán);趙忠新;邵福源;;穩(wěn)定表達(dá)TrkA的Cos-7細(xì)胞株在NGF刺激下與分化相關(guān)的蛋白質(zhì)組學(xué)研究[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)第七次全國(guó)神經(jīng)病學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2004年

9 王黔艷;施靜;;電針抗大鼠局灶性腦缺血再灌注損傷的機(jī)制研究——TrkA受體信號(hào)通路對(duì)Src磷酸化的調(diào)節(jié)[A];湖北省神經(jīng)科學(xué)學(xué)會(huì)學(xué)術(shù)年會(huì)論文匯編[C];2007年

10 王魯民;鄒春杰;郭宗君;;穹隆-海馬傘切斷大鼠腦內(nèi)TrkA表達(dá)的變化[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)第七次全國(guó)神經(jīng)病學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2004年

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1 王永剛;Mint2與神經(jīng)生長(zhǎng)因子受體TrkA結(jié)合的生物學(xué)功能研究[D];第二軍醫(yī)大學(xué);2007年

2 陳冰;Syntaxin8調(diào)節(jié)TrkA受體合成后轉(zhuǎn)運(yùn)及炎性相關(guān)痛傳導(dǎo)的研究[D];山東大學(xué);2014年

3 王嵐;TrkA/p75NTR信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路中有關(guān)蛋白間相互作用的研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2009年

4 田舜蓮;NGF/TrkA對(duì)大鼠海馬TRPM7的調(diào)節(jié)作用[D];華中科技大學(xué);2007年

5 苑玉和;神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)素受體TrkA、p75NTR與RanBPM及其它蛋白之間相互作用的研究[D];中國(guó)協(xié)和醫(yī)科大學(xué);2005年

6 王勇;NGF及其受體對(duì)卵泡發(fā)育調(diào)控的分子機(jī)制研究[D];中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué);2013年

7 張繼紅;TrkA基因抑制神經(jīng)母細(xì)胞瘤增殖和血管生成及誘導(dǎo)其分化的研究[D];中國(guó)醫(yī)科大學(xué);2003年

8 李麗;哮喘豚鼠肺泡巨噬細(xì)胞中SH2-Bβ的表達(dá)及NGF/TrkA對(duì)其調(diào)控機(jī)制[D];中國(guó)醫(yī)科大學(xué);2008年

9 郭春妮;Aβ致大鼠基底前腦膽堿能神經(jīng)元NGF及TrkA表達(dá)變化及尼古丁干預(yù)研究[D];復(fù)旦大學(xué);2004年

10 趙春明;NGF及其受體trkA、p75在翼狀胬肉中的實(shí)驗(yàn)研究[D];華中科技大學(xué);2009年

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1 劉，

本文編號(hào)：2406535