【摘要】：【目的】構(gòu)建榮昌豬唾液腺全長cDNA文庫,并進行部分表達序列標(biāo)簽(ESTs)的測序及分析,為榮昌豬種質(zhì)資源的保存、開發(fā)和挖掘提供重要的分子信息�！痉椒ā恳�14日齡榮昌豬仔豬為材料,取其唾液腺,采用SMART法構(gòu)建唾液腺全長cDNA文庫,并進行ESTs測序、注釋及功能分析。【結(jié)果】初級文庫滴度為5.88×106PFU/mL,重組率為99.67%,大部分插入片段長度為400~2 000bp。共獲得144條有效ESTs序列,共計108條非重復(fù)序列,包括23個重疊群和85個單一序列,77(占71.29%)條序列為已知功能基因,31(占28.71%)條為未知功能序列,其中18條為新基因。GO分類和KEGG途徑分析結(jié)果顯示,榮昌豬唾液腺表達基因功能主要包括細胞成分、分子功能和生物學(xué)過程3個類群。在細胞成分類群中,細胞外的成分所占比例最高;在分子功能類群中,酶抑制劑活性所占比例最高;而在生物過程類群中,以轉(zhuǎn)運和定位等過程最突出。表達的基因主要參與補足物和凝固級聯(lián)、百日咳、加壓素調(diào)控的水再吸收及味覺傳導(dǎo)等代謝途徑�！窘Y(jié)論】成功構(gòu)建了榮昌豬唾液腺全長cDNA文庫,解析了榮昌豬唾液腺的表達特征。
[Abstract]:[objective] to construct the full-length cDNA library of Rongchang pig salivary gland, and to sequence and analyze the partial expression sequence tag (ESTs) for the preservation of Rongchang pig germplasm resources. To develop and excavate the important molecular information. [methods] the salivary glands of 14 day old Rongchang piglets were taken as materials, the full-length cDNA library of salivary glands was constructed by SMART method, and ESTs sequencing was performed. Results the titer of the primary library was 5.88 脳 10 ~ (6) PFU / mL, the recombination rate was 99.67, and the length of most of the inserted fragments was 400 ~ 2 000 BP. A total of 144-active ESTs sequences were obtained, including 23 overlapping groups and 85 single sequences. 77 (71.29%) were known functional genes, 31 (28.71%) were unknown functional sequences. The results of GO classification and KEGG pathway analysis showed that the gene function of salivary gland in Rongchang pig was mainly composed of three groups: cell component, molecular function and biological process. The proportion of extracellular components was the highest in the cell classification group, the proportion of enzyme inhibitor activity was the highest in the molecular functional group, while in the biological process group, transport and localization were the most prominent processes. The expressed genes are mainly involved in the metabolic pathways of complement and coagulation cascade, pertussis, vasopressin regulated water reabsorption and taste conduction. [conclusion] the full-length cDNA library of Rongchang pig salivary gland was successfully constructed. The expression characteristics of salivary glands in Rongchang pig were analyzed.
【作者單位】： 西南大學(xué)榮昌校區(qū)動物醫(yī)學(xué)系;
【基金】：國家自然科學(xué)基金項目(31201807)
【分類號】：S828

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本文編號：2406388