發(fā)布時間：2018-10-17 13:44

【摘要】：試驗通過對巴美肉羊性腺軸進行轉(zhuǎn)錄組分析,旨在挖掘影響多羔性狀的關(guān)鍵功能基因。分別選取雙羔組巴美肉羊5只、單羔組4只,利用轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-Seq)技術(shù)對下丘腦、垂體、卵巢轉(zhuǎn)錄組文庫進行測序,然后對得到的測序數(shù)據(jù)進行生物信息學分析。測序數(shù)據(jù)經(jīng)過質(zhì)量控制后,27個樣品共得到112Gb的有效數(shù)據(jù)。差異基因分析表明,與單羔組相比,雙羔組下丘腦中,上調(diào)表達基因111個,下調(diào)表達基因106個;垂體組織中,上調(diào)表達基因97個,下調(diào)表達基因142個;卵巢組織中,上調(diào)表達基因182個,下調(diào)表達基因67個。功能富集性分析表明,神經(jīng)活性的配體-受體相互作用信號通路在下丘腦-垂體-卵巢性腺軸調(diào)控排卵及卵泡發(fā)育方面發(fā)揮著重要的調(diào)控作用。通過不同產(chǎn)羔數(shù)巴美肉羊性腺軸比較轉(zhuǎn)錄組研究,提供了全部的轉(zhuǎn)錄本信息,篩選了影響產(chǎn)羔數(shù)的相關(guān)功能基因,豐富和補充了綿羊基因組信息,為進一步闡明綿羊繁殖力差異的分子機制奠定基礎(chǔ)。
[Abstract]:By transcriptome analysis of gonad axis in Bamei sheep, the key functional genes affecting the traits of lambs were excavated. Five lambs and four lambs were selected respectively. The hypothalamus, pituitary and ovary transcriptional libraries were sequenced by transcriptional sequencing (RNA-Seq) technique, and the sequence data were analyzed by bioinformatics. After quality control, 27 samples obtained valid 112Gb data. Differential gene analysis showed that, in the hypothalamus, 111 up-regulated genes and 106 down-regulated genes were found in the hypothalamus, 97 up-regulated genes and 142 down-regulated genes in pituitary tissues. There were 182 up-regulated genes and 67 down-regulated genes. Functional enrichment analysis showed that the ligand-receptor interaction signaling pathway of nerve activity plays an important role in the regulation of ovulation and follicular development by hypothalamus-pituitary-ovarian gonadal axis. Based on the comparative transcriptome study of gonad axis in different lambs, the complete transcription information was provided, and the related functional genes affecting lambing size were screened, which enriched and supplemented the genomic information of sheep. It lays a foundation for further elucidating the molecular mechanism of sheep fecundity difference.
【作者單位】： 內(nèi)蒙古農(nóng)牧業(yè)科學院;內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學動物科學學院;內(nèi)蒙古ATCG生物信息研究所;巴彥淖爾市家畜改良工作站;中國農(nóng)業(yè)科學院北京畜牧獸醫(yī)研究所農(nóng)業(yè)部畜禽遺傳資源與種質(zhì)創(chuàng)新重點實驗室;
【基金】：國家自然科學基金項目(31360542) 國家肉羊產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)項目(CARS-39) 內(nèi)蒙古自治區(qū)農(nóng)牧業(yè)科學院創(chuàng)新基金(2015CXJJM02) 內(nèi)蒙古自治區(qū)自然科學基金博士基金(2016BS(LH)0303) 中國農(nóng)業(yè)科學院科技創(chuàng)新工程(ASTIP-IAS13)
【分類號】：S826

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本文編號：2276844