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羊口瘡病毒重慶株的分離鑒定及其F1L基因原核表達(dá)研究

發(fā)布時(shí)間:2018-10-15 08:44
【摘要】:羊口瘡病毒(Orf virus,OrfV)屬于痘病毒科、副痘病毒屬成員,為有囊膜線性雙股DNA病毒,是引起綿羊、山羊發(fā)生以口唇、舌、鼻、乳房等部位皮膚、黏膜形成丘疹、膿皰、潰瘍以及結(jié)成疣狀厚痂為主要特征的接觸性、嗜上皮性、人獸共患傳染病病原。國(guó)內(nèi)外的研究已證明該病毒是一種變異性較強(qiáng)的病毒,各地分離的病毒在致病性上存在著較大差異,基因組限制性酶切圖譜分析表明也存在差異。2013年10月重慶市江津縣某羊場(chǎng)羊只出現(xiàn)疑似羊口瘡疫情。為了獲得地方流行毒株,分析主要抗原基因F1L基因的分子變異特點(diǎn)以及為羊口瘡防控的研究奠定基礎(chǔ),本實(shí)驗(yàn)開(kāi)展了以下研究:1.羊口瘡病毒重慶株(OrfV-CQ株)的分離鑒定:采集病羊口唇部痂皮,提取核酸,PCR鑒定為羊口瘡病毒陽(yáng)性,以陽(yáng)性病料接種MDBK細(xì)胞分離病毒,通過(guò)透射電鏡、間接免疫熒光、PCR方法擴(kuò)增、序列測(cè)定及同源性分析和動(dòng)物感染試驗(yàn)鑒定病毒。結(jié)果:陽(yáng)性病料接種MDBK細(xì)胞后,F1至F3代并無(wú)明顯CPE現(xiàn)象,F4代MDBK細(xì)胞于48 h開(kāi)始變圓、聚集、融合、拉網(wǎng)甚至脫落;透射電鏡觀察感染細(xì)胞的胞漿中有大量成熟與未成熟的病毒粒子;在接毒MDBK細(xì)胞漿中觀察到了亮綠色的免疫熒光;提取F3~F13代接毒細(xì)胞懸液DNA,PCR方法均能擴(kuò)增出特異性目的片段(708 bp),該序列與GenBank中38株OrfV-F1L基因核苷酸的同源性為97%~99%;測(cè)定F6代細(xì)胞毒TCID50值為10-4.25/0.1 mL;細(xì)胞培養(yǎng)物人工接種宿主動(dòng)物山羊,能復(fù)制出與羊口瘡相似的臨床癥狀。2.羊口瘡病毒重慶株(OrfV-CQ株)F1L基因的生物信息學(xué)分析:根據(jù)GenBank上收錄OrfV基因序列(No.AY040083),應(yīng)用Premier Primer 5.0軟件設(shè)計(jì)針對(duì)OrfV-F1L基因全長(zhǎng)引物,對(duì)OrfV-CQ株F1L基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增、克隆及序列測(cè)定。應(yīng)用生物信息學(xué)相關(guān)軟件(DNAStar,SignalP 4.1等)分析序列同源性,繪制遺傳進(jìn)化樹(shù),預(yù)測(cè)二級(jí)結(jié)構(gòu)及B細(xì)胞抗原表位和信號(hào)肽。結(jié)果顯示:F1L基因PCR擴(kuò)增產(chǎn)物大小為1023 bp,編碼340個(gè)氨基酸;與Genbank收錄20株相應(yīng)序列核苷酸同源性為93.9%~98.4%,氨基酸的同源性僅與shanxi株(登錄號(hào)HQ221964)同源,為95.0%,與其余序列氨基酸同源性為12.2%~13.1%;二級(jí)結(jié)構(gòu)以α螺旋和β折疊較少,β轉(zhuǎn)角和無(wú)規(guī)則卷曲較多,預(yù)測(cè)此蛋白可能存在13個(gè)B細(xì)胞優(yōu)勢(shì)抗原表位,無(wú)信號(hào)肽區(qū)域。3.羊口瘡病毒重慶株(OrfV-CQ株)F1L基因的原核表達(dá)研究:提取OrfV-CQ株病毒核酸為模板,擴(kuò)增F1L基因,并將其克隆至pET-32a載體中,構(gòu)建原核表達(dá)載體pET-32a-F1L,轉(zhuǎn)化至大腸埃希菌BL21,優(yōu)化表達(dá)條件,SDS-PAGE及Western bloting檢測(cè)目的蛋白表達(dá)情況及其反應(yīng)原性。結(jié)果:PCR擴(kuò)增出F1L基因全長(zhǎng)1023 bp,pET32-F1L在BL21工程菌中最佳表達(dá)時(shí)間為5 h,IPTG誘導(dǎo)濃度為0.2 mmol/L,融合蛋白大小為57.4 kDa,表達(dá)S-Tag融合蛋白與Anti-S antibody發(fā)生了特異性反應(yīng)。結(jié)論:從發(fā)病山羊分離到1株羊口瘡病毒,命名為Orf V-CQ株;Orf V-CQ株F1L基因生物信息學(xué)分析表明,F1L基因核苷酸序列比較保守,但存在堿基缺失和突變,F1L蛋白具有眾多的B細(xì)胞優(yōu)勢(shì)抗原表位;構(gòu)建了OrfV F1L基因原核表達(dá)載體,并在大腸桿菌中成功表達(dá)。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:貴州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:S852.65

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本文編號(hào):2271992

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