【摘要】：為了研究偽狂犬病毒(pseudorabies virus,PRV)感染宿主細胞后宿主蛋白的差異表達情況,尋找PRV與細胞相互作用的重要分子,本試驗將PRV接種PK-15細胞,運用同位素標記(isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)結(jié)合色譜/串聯(lián)質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù),開展病毒感染細胞后差異表達蛋白分析,并通過qPCR對其數(shù)據(jù)進行驗證。以未接毒細胞為對照,通過數(shù)據(jù)庫檢索,分析出3 062個蛋白,共鑒定到27個差異表達蛋白,其中21個蛋白下調(diào),6個蛋白上調(diào)。這些差異蛋白主要參與代謝過程、生物調(diào)控、應(yīng)激反應(yīng)以及定位等生物學(xué)過程,具有結(jié)合活性、催化活性、轉(zhuǎn)錄活性等分子功能。NFκB1、PIK3R2、HSPA1L等差異蛋白在多條通路中發(fā)揮作用。POP1、UTP15和ND4的表達變化情況與iTRAQ結(jié)果變化趨勢一致,證明了該數(shù)據(jù)的可靠性。本試驗研究結(jié)果為進一步研究PRV致病機制及宿主免疫應(yīng)答提供理論依據(jù)。
[Abstract]:In order to study the differential expression of host proteins after pseudorabies virus (pseudorabies virus,PRV) infection in host cells and to find the important molecules of interaction between PRV and cells, PRV was inoculated into PK-15 cells. The differential expression protein analysis of virus infected cells was carried out by using isotope labeled (isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ and chromatography-tandem mass spectrometry (GC-MS), and its data were verified by qPCR. Using uninfected cells as control, 3 062 proteins were identified and 27 differentially expressed proteins were identified, of which 21 proteins were down-regulated and 6 proteins up-regulated. These differential proteins are mainly involved in metabolic processes, biological regulation, stress response and localization, and have binding activity and catalytic activity. Transcriptional activity and other molecular functions, such as NF 魏 B 1, PIK3R 2, HSPA1L, play a role in many pathways. The changes of the expression of POP 1 UTP15 and ND4 are consistent with the change trend of iTRAQ results, which proves the reliability of the data. The results of this study provide theoretical basis for further study on the pathogenesis of PRV and host immune response.
【作者單位】： 西北農(nóng)林科技大學(xué)動物醫(yī)學(xué)院;中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院上海獸醫(yī)研究所;
【基金】：上海市自然科學(xué)基金資助項目(14ZR1448900) 上海市科技興農(nóng)重點攻關(guān)資助項目(滬農(nóng)科攻字(2015)第1-7號)
【分類號】：S852.65

【參考文獻】

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本文編號：2246750