【摘要】：為研究廣東地區(qū)豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)流行株ORF5基因的遺傳演化情況,采用RT-PCR方法對2016年-2017年采自廣東省地區(qū)豬場疑似PRRS豬肺臟組織樣品中的PRRSV ORF5基因進行了擴增,并對這些毒株的核苷酸和氨基酸序列進行了生物信息學分析。結果表明,成功擴增出12株PRRSV流行毒株的ORF5基因片段。遺傳演化分析表明,擴增出的毒株有10株與國內高致病性毒株親緣關系較近,屬于同一分支;2株與廣東地區(qū)新報道的毒株QYYZ和GM2親緣關系較近,屬于同一分支。氨基酸序列比對結果表明,新分離的毒株在GP5抗原表位上存在廣泛的變異。結果表明,該地區(qū)PRRSV毒株已經發(fā)生廣泛變異。研究結果不僅揭示了廣東地區(qū)流行的PRRSV ORF5基因的遺傳演化特性,也為該地區(qū)PRRS的防控提供了科學依據。
[Abstract]:In order to study the genetic evolution of ORF5 gene of porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) epidemic strain in Guangdong, the PRRSV ORF5 gene was amplified by RT-PCR method from 2016 to 2017 in suspected PRRS pig lung tissue samples from pig farms in Guangdong province. The nucleotide and amino acid sequences of these strains were analyzed by bioinformatics. The results showed that the ORF5 gene fragments of 12 PRRSV strains were successfully amplified. Genetic evolution analysis showed that 10 of the amplified strains were closely related to the domestic high pathogenic virulence strains. Two strains belonging to the same branch were closely related to the newly reported strains of QYYZ and GM2 in Guangdong and belonged to the same branch. The results of amino acid sequence alignment showed that the newly isolated strains had extensive variation in GP5 epitopes. The results showed that the PRRSV strains in this area had been widely mutated. The results not only reveal the genetic and evolutionary characteristics of the prevalent PRRSV ORF5 gene in Guangdong, but also provide a scientific basis for the prevention and control of PRRS in this area.
【作者單位】： 華南農業(yè)大學動物科學學院;信陽農林學院牧醫(yī)工程學院;
【基金】：國家支撐計劃項目(2015BAD12B02-5) 廣州市科技計劃項目(201508020062) 現代農業(yè)產業(yè)共性技術創(chuàng)新團隊項目(2016LM2150)
【分類號】：S852.651

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本文編號：2180128