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廣西首例豬圓環(huán)病毒3型的發(fā)現(xiàn)及其衣殼蛋白序列分析

發(fā)布時間:2018-07-27 12:51
【摘要】:【目的】明確豬圓環(huán)病毒3型(Porcine circovirustype 3,PCV3)在廣西豬群中的致病性及流行病學(xué)特點,為有效防控其暴發(fā)流行提供參考依據(jù)!痉椒ā坎捎肞CR對廣西某豬場腹瀉死亡仔豬的病料樣品進行PCV3檢測,并對其唯一結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)(Cap)的結(jié)構(gòu)進行同源模擬,構(gòu)建遺傳進化樹;同時在線(http://www.cbs.dtu.dk/services/)預(yù)測Cap蛋白信號肽、糖基化位點和B細胞抗原表位。【結(jié)果】在廣西某豬場腹瀉死亡仔豬的病料樣品中檢測到PCV3。PCR擴增產(chǎn)物經(jīng)核苷酸序列測定分析后截取Cap基因序列(645 bp),命名為PCV3/CN/Guangxi001/2017。PCV3/CN/Guangxi001/2017與13株國內(nèi)PCV3毒株和5株美國PCV3毒株的Cap基因序列同源性分別在96.9%~99.4%和98.3%~99.5%,屬于3b亞群;而與PCV1毒株和PCV2毒株的核苷酸序列同源性只有43.0%和45.8%,且B細胞抗原表位差異明顯,在PCV1特有的B細胞抗原表位(92~103 aa)、PCV2特有的B細胞抗原表位(69~83 aa、117~131 aa和231~233 aa)及PCV1、PCV2共有的B細胞抗原表位(156~162 aa和179~192 aa)均無相似性!窘Y(jié)論】廣西豬群中已存在PCV3感染,鑒于PCV2與PCV3間無交叉免疫保護特性,實際生產(chǎn)中應(yīng)通過加強清潔消毒、滅鼠殺蟲、定期監(jiān)測、自繁自養(yǎng)等生物安全措施防控PCV3暴發(fā)流行。
[Abstract]:[objective] to study the pathogenicity and epidemiological characteristics of porcine circovirus type 3 (Porcine circovirustype 3) in Guangxi pig population. [methods] PCR was used to detect the disease material of dead piglets with diarrhea in a pig farm in Guangxi, and the structure of its unique structural protein (Cap) was homologous simulated to construct genetic evolution tree. Simultaneous online (http://www.cbs.dtu.dk/services/) prediction of Cap protein signal peptides, Glycosylation sites and B cell antigen epitopes. [results] PCV3.PCR amplification products were detected in the samples of piglets with dead piglets with diarrhea in a pig farm in Guangxi. After nucleotide sequence analysis, the Cap gene sequences (645 bp), named PCV3/CN/Guangxi001/2017.PCV3/CN/Guangxi001/2017 and 13%) were obtained. The homology of Cap gene sequence of domestic PCV3 strain and 5 American PCV3 strain was 99.4% and 98.3%, respectively, belonging to 3b subgroup. The nucleotide sequence homology was only 43.0% and 45.8% with PCV1 and PCV2 strains, and the B cell epitopes were significantly different. There was no similarity in B cell epitope (92103aa), B cell antigen epitope (6983aaaA1a) and B cell antigen epitope (179192aa) shared by PCV1 and PCV1. [conclusion] PCV3 infection has been found in Guangxi pig population, and the B cell antigenic epitope of PCV1 / PCV2 (156o162aa and 179192aa) is not similar to that of PCV2-specific B cell epitope. [conclusion] there is no similarity between the B cell antigen epitopes of PCV2 and that of PCV2. [conclusion] In view of the fact that there is no cross immune protection between PCV2 and PCV3, it is necessary to prevent and control the outbreak of PCV3 by strengthening cleaning and disinfection, killing rats and insects, regularly monitoring and self-propagating and self-nourishing.
【作者單位】: 廣西獸醫(yī)研究所/廣西獸醫(yī)生物技術(shù)重點實驗室;
【基金】:廣西科學(xué)研究與技術(shù)開發(fā)計劃項目(桂科重14121003-3-1) 廣西水產(chǎn)畜牧獸醫(yī)局科技項目(桂漁牧科201633002)
【分類號】:S852.651

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本文編號:2147889

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