本文選題：拜城油雞 + 盲腸　； 參考：《家畜生態(tài)學(xué)報(bào)》2017年02期

【摘要】：為了研究拜城油雞盲腸細(xì)菌物種多樣性,本研究采用基于16SrDNA基因序列系統(tǒng)發(fā)育分析的免培養(yǎng)方法進(jìn)行細(xì)菌物種多樣性分析,以盲腸內(nèi)容物樣品總DNA為模板,利用細(xì)菌通用引物擴(kuò)增16SrDNA基因,構(gòu)建16SrDNA基因克隆文庫,并對(duì)文庫中的插入序列進(jìn)行RFLP分析。結(jié)果表明:隨機(jī)挑選的252個(gè)克隆為陽性克隆,陽性率為65.7%,經(jīng)過RFLP篩選出95個(gè)不同圖譜的重組克隆并測序,比對(duì)分析后發(fā)現(xiàn):拜城油雞盲腸細(xì)菌分屬于厚壁菌門(Firmicutes)(65.26%)、擬桿菌門(Bacteroidetes)27.37%)和變形菌門(Proteobacteria)(4.21%)。在綱水平有梭菌綱(Clostridia)、擬桿菌綱(Bacteroidia)和ε-變形菌綱(Epsilonproteobacteria)相對(duì)含量最多,分別占總菌的64.21%、26.32%和4.21。在科水平上以瘤胃菌科(Ruminococcaceae)(21.05%)、毛螺菌科(Lachnospiraceae)(20%)和理研菌科(Rikenellaceae)(12.63%)相對(duì)含量最多,為優(yōu)勢(shì)科。在屬水平上僅有31.58%的序列可以鑒定到屬,Lachnoclostridium的相對(duì)含量最多,占總菌的12.63%,其次為另枝菌屬(Alistipes)和瘤胃梭菌屬(Ruminiclostridium)。拜城油雞盲腸內(nèi)容物中的細(xì)菌組成具有豐富的多樣性,并有新細(xì)菌分類單位的潛在資源,值得進(jìn)一步進(jìn)行開發(fā)研究。
[Abstract]:In order to study the species diversity of cecum bacteria in Baicheng fowl, the bacterial species diversity was analyzed by using 16s rDNA gene phylogenetic analysis method. The total DNA of cecum contents was used as template. 16s rDNA gene was amplified by bacterial universal primers and the 16s rDNA gene clone library was constructed. The inserted sequence of 16s rDNA gene was analyzed by RFLP. The results showed that 252 clones randomly selected were positive clones with a positive rate of 65.7. 95 recombinant clones with different profiles were screened by RFLP and sequenced. The results showed that the cecum bacteria belonged to Firmicutes (65.26%), Bacteroidetes (27.37%) and Proteobacteria (4.21%). The relative contents of Clostridia, Bacteroidia and Epsilon proteobacteria were the most, accounting for 64.21% and 4.21% of the total bacteria, respectively. The relative contents of Ruminococcaceae (21.05%), Lachnospiraceae (20%) and Rikenellaceae (12.63%) were the dominant family. At the generic level, only 31.58% of the sequences could be identified as the relative content of Lachnoclostridium, accounting for 12.63% of the total bacteria, followed by (Alistipes) and Ruminiclostridium. The bacterial composition in the cecum of Baicheng fowl is rich in diversity and potential resources of new bacteria taxonomic units, so it is worthy of further development and research.
【作者單位】： 塔里木大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團(tuán)塔里木畜牧科技重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】：兵團(tuán)塔里木畜牧科技重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室開放課題(HS201205) 國家自然科學(xué)基金(31160521) 塔里木大學(xué)校長基學(xué)校長基金(TDZKGG201504)
【分類號(hào)】：S831;S852.6

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本文編號(hào)：2076847