山羊FSHR基因編碼蛋白的結(jié)構(gòu)及功能分析
本文選題:FSHR基因 + 系統(tǒng)發(fā)育分析; 參考:《河南農(nóng)業(yè)科學(xué)》2017年07期
【摘要】:通過(guò)Prot Param和ProtScale等在線軟件對(duì)山羊FSHR基因編碼蛋白的理化性質(zhì)、亞細(xì)胞定位及功能進(jìn)行分析,分別使用Chou-Fasman和同源建模方法對(duì)二級(jí)、三級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測(cè),并對(duì)采用鄰近法構(gòu)建的不同物種FSHR基因編碼蛋白的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)進(jìn)行分析。結(jié)果顯示,山羊FSHR基因編碼蛋白由695個(gè)氨基酸殘基組成,包含7個(gè)跨膜域和1個(gè)G蛋白耦合受體,屬于不穩(wěn)定蛋白,具有較高的親水性;亞細(xì)胞定位結(jié)果顯示,FSHR基因編碼蛋白分布在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、液泡和線粒體內(nèi);二級(jí)結(jié)構(gòu)主要是α螺旋,三級(jí)結(jié)構(gòu)富含helix螺旋結(jié)構(gòu)域和長(zhǎng)鏈卷曲。對(duì)不同物種FSHR基因編碼蛋白進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析發(fā)現(xiàn),與其他物種相比,山羊與綿羊、家牛、野豬親緣關(guān)系較近,系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果與其動(dòng)物學(xué)分類(lèi)結(jié)果一致。
[Abstract]:The physicochemical properties, subcellular localization and function of goat FSHR gene coding protein were analyzed by Prot Param and ProtScale online software. Chou-Fasman and homology modeling methods were used to predict the secondary and tertiary structures, respectively. The phylogenetic tree of FSHR gene encoding proteins of different species was constructed by proximity method. The results showed that the goat FSHR gene encoding protein consists of 695 amino acid residues, including 7 transmembrane domains and 1 G protein coupled receptor, which belongs to unstable protein and has high hydrophilicity. The results of subcellular localization showed that the protein encoding FSHR gene was distributed in endoplasmic reticulum, vacuole and mitochondria, the secondary structure was mainly 偽 helix, and the tertiary structure was rich in helix domain and long chain crimp. Phylogenetic analysis of FSHR gene encoding proteins in different species showed that goat was closely related to sheep, domestic cattle and wild boar compared with other species, and the phylogenetic analysis was consistent with the results of zoological classification.
【作者單位】: 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院;
【基金】:國(guó)家現(xiàn)代肉羊產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系項(xiàng)目(CARS-39)
【分類(lèi)號(hào)】:S827
【參考文獻(xiàn)】
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【共引文獻(xiàn)】
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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】
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本文編號(hào):2071659
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