中國荷斯坦奶牛泌乳周期中乳腺脂質(zhì)代謝轉(zhuǎn)錄組分析
發(fā)布時間:2018-05-24 07:47
本文選題:乳成分 + 脂肪酸。 參考:《揚州大學(xué)》2017年碩士論文
【摘要】:奶牛泌乳是一個動態(tài)過程,本研究在跟蹤測定中國荷斯坦奶牛一個完整泌乳周期中乳成分、乳脂肪酸水平的基礎(chǔ)上,在泌乳的特定6個時間段采集乳腺組織,運用轉(zhuǎn)錄組測序和生物信息學(xué)分析技術(shù)篩選差異表達基因,獲得與乳脂代謝相關(guān)的基因,結(jié)合脂肪酸變化趨勢和規(guī)律探索與脂肪酸代謝相關(guān)基因的表達模式,旨在進一步發(fā)掘泌乳周期中乳脂相關(guān)基因及其調(diào)控機制。試驗在揚州大學(xué)實驗?zāi)翀鲞M行,選擇體況相近、分娩時期相對集中、2-3胎健康的中國荷斯坦奶牛30頭,在奶牛泌乳的第3、15、45、75、105、135、165、195、225、255、285、315d,每頭每次采集乳樣100 mL,立即進行乳成分分析,余樣冷凍保存用于脂肪酸提取檢測,分析其脂肪酸的組成及其比例變化。同時選擇體況相近、分娩時間接近(±3d)的2胎奶牛3頭,微創(chuàng)采集分娩前7d及泌乳30、90、180、270、315d乳腺組織,液氮保存,用于提取RNA,進行轉(zhuǎn)錄組分析。主要結(jié)果如下:1.在奶牛整個泌乳過程中,乳脂肪、蛋白和非脂乳固體相對含量變化趨勢相近,其中脂肪含量,在3d時含量最多,并在195d含量出現(xiàn)最低,在泌乳中后期脂肪含量下降。沁乳早期(3d和15d)乳中蛋白質(zhì)含量極顯著大于其他時間段(P0.01),15d后各泌乳階段差異不顯著(P0.05)。非脂乳固體7d相對含量極顯著大于其他時間段,但從泌乳45d開始非脂乳固體相對含量穩(wěn)定,且45d-315d所有泌乳時間段差異不顯著(P0.05),本試驗乳糖含量在第7d時含量最小,至15d時保持相對穩(wěn)定,且其他泌乳各階段無明顯變化特征。通過乳脂中的4種主要的脂肪酸在整個泌乳周期變化趨勢進行歸類,主要分為兩大類脂肪酸:C14:0(肉蔻酸)、C16:0(棕櫚酸)脂肪酸與C18:0(硬脂酸)、C18:1(油酸)脂肪酸,且這兩類脂肪酸比例趨勢在泌乳周期中變化趨勢相反,推測奶牛乳腺脂質(zhì)代謝中的肉蔻酸、棕櫚酸與硬脂酸、油酸相互之間在不同泌乳階段的變化可能具有不同的生物學(xué)意義。2.對6個時序18個乳腺組織樣本進行轉(zhuǎn)錄組分析,從所有得到的差異基因數(shù)據(jù)中篩選出-7dvs30d、30dvs90d、90dvs180d、180dvs270d、270dvs315d 兩個相鄰階段樣本間差異表達基因,共有2144個上調(diào)差異表達基因和2042個下調(diào)基因,將不同兩個連續(xù)階段差異表達基因與篩選出的可能與脂質(zhì)相關(guān)的1460個轉(zhuǎn)錄表達基因做交叉分析,總共得到413個可能與脂質(zhì)相關(guān)的差異表達基因,最后分別對所得到兩個連續(xù)泌乳階段與脂質(zhì)相關(guān)的差異上調(diào)和下調(diào)基因做GO和KEGG富集分析,得到總共4466個GO term和794個pathway,再從中篩選出與脂肪代謝相關(guān)的248條GOterm和129個pathway富集的通路,可分別解釋富集在GO term和Pathway上的各兩個連續(xù)階段樣本間關(guān)于脂質(zhì)代謝的差異基因與乳脂代謝的關(guān)系。3.對一個泌乳周期中富集在GOterm和Pathway上關(guān)于脂質(zhì)代謝的所有差異基因進行統(tǒng)計,發(fā)現(xiàn)在泌乳周期中與調(diào)控乳腺乳脂肪代謝的有185個重要基因,這些基因在不同泌乳階段調(diào)控著乳脂肪代謝以及影響著乳脂肪中脂肪酸的組成比例。4.通過對脂質(zhì)有關(guān)基因時序表達進行動態(tài)聚類以及GO富集分析,共篩選出五種顯著差異的(P0.01)的基因時序表達模型,其中第五種基因聚類表達趨勢模型中的LPIN1、ACSL1、CHPT1、ACSS2、AGPAT6、SCD、GPD1這7個基因不僅表達趨勢一致,同時在整個泌乳期乳腺脂肪代謝調(diào)控中有著十分緊密的聯(lián)系。
[Abstract]:The results were as follows : 1 . The content of milk fat , protein and non - fat milk in milk was similar to that of other periods ( P0.05 ) .
【學(xué)位授予單位】:揚州大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:S823
【參考文獻】
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